More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5468 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  85.98 
 
 
448 aa  767    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  75.35 
 
 
450 aa  654    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  83.45 
 
 
444 aa  756    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  85.98 
 
 
448 aa  767    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  85.98 
 
 
448 aa  767    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  72.79 
 
 
441 aa  639    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3345  hypothetical protein  74.19 
 
 
451 aa  642    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1483  hypothetical protein  85.75 
 
 
448 aa  766    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  73.46 
 
 
451 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  85.49 
 
 
444 aa  771    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3268  hypothetical protein  85.75 
 
 
448 aa  766    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  84.58 
 
 
444 aa  767    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  85.98 
 
 
448 aa  767    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  87.36 
 
 
448 aa  778    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  95.25 
 
 
442 aa  855    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  892    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0344  hypothetical protein  74.83 
 
 
441 aa  657    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  83.9 
 
 
444 aa  763    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  88.44 
 
 
445 aa  799    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  83.9 
 
 
444 aa  763    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3154  hypothetical protein  85.98 
 
 
448 aa  767    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  84.13 
 
 
444 aa  764    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  82.99 
 
 
444 aa  754    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3854  hypothetical protein  65.16 
 
 
447 aa  593  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  64.69 
 
 
440 aa  587  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  65.02 
 
 
446 aa  578  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  67.76 
 
 
446 aa  578  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  64.97 
 
 
443 aa  570  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  63.22 
 
 
444 aa  568  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  63.28 
 
 
443 aa  556  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3685  hypothetical protein  65.3 
 
 
442 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  61.54 
 
 
442 aa  551  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  62.78 
 
 
447 aa  551  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  63.08 
 
 
447 aa  548  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3480  hypothetical protein  63.93 
 
 
442 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.634829  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3798  hypothetical protein  63.11 
 
 
441 aa  533  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3803  hypothetical protein  63.93 
 
 
442 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  58.68 
 
 
444 aa  510  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  57.44 
 
 
444 aa  504  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  55.32 
 
 
443 aa  504  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00991  aminotransferase, class III (AFU_orthologue; AFUA_1G16810)  47.92 
 
 
448 aa  400  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.47575  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06930  conserved hypothetical protein  47.11 
 
 
447 aa  388  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38281  aminotransferase  45.79 
 
 
461 aa  379  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722642  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06180  class III aminotransferase, putative  43.81 
 
 
469 aa  335  9e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0804287  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  43.38 
 
 
442 aa  326  5e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  41 
 
 
455 aa  311  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3905  aminotransferase  41.63 
 
 
451 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.57399  decreased coverage  0.00444917 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0831  aminotransferase class-III  43.73 
 
 
470 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2094  aminotransferase class-III  36.62 
 
 
459 aa  301  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0920345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  42.89 
 
 
456 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  37.91 
 
 
451 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2275  hypothetical protein  38.37 
 
 
436 aa  288  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2934  hypothetical protein  39.23 
 
 
466 aa  286  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.913582  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1177  aminotransferase class-III  41.82 
 
 
444 aa  286  5e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2139  hypothetical protein  38.37 
 
 
436 aa  286  7e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2077  hypothetical protein  38.37 
 
 
436 aa  286  7e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2319  hypothetical protein  38.37 
 
 
436 aa  286  7e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2073  hypothetical protein  38.37 
 
 
436 aa  286  7e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2294  hypothetical protein  38.37 
 
 
436 aa  286  7e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3048  hypothetical protein  38.14 
 
 
436 aa  285  8e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2328  hypothetical protein  38.37 
 
 
436 aa  285  9e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000223994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2402  hypothetical protein  38.37 
 
 
436 aa  285  9e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2111  aminotransferase class-III  39.04 
 
 
453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683698  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  39.71 
 
 
459 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4329  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  34.47 
 
 
446 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656375  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2112  hypothetical protein  37.67 
 
 
436 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  39.34 
 
 
458 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  36.43 
 
 
466 aa  278  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1682  hypothetical protein  37.91 
 
 
436 aa  278  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63587  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35479  aminotransferase  36 
 
 
465 aa  276  6e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1751  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  34.27 
 
 
446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000427853  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  38.57 
 
 
455 aa  274  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  36.01 
 
 
471 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  38.84 
 
 
448 aa  272  9e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  38.84 
 
 
448 aa  272  9e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  39.58 
 
 
457 aa  272  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  36.13 
 
 
458 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  36.49 
 
 
470 aa  272  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  38.6 
 
 
448 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  40.05 
 
 
456 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  38.93 
 
 
456 aa  271  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  38.86 
 
 
459 aa  271  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  39.66 
 
 
456 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  38.93 
 
 
456 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  37.47 
 
 
463 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  37.88 
 
 
456 aa  270  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  38.6 
 
 
449 aa  270  5e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  36.05 
 
 
459 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6095  hypothetical protein  38.88 
 
 
465 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  37.8 
 
 
449 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  37.59 
 
 
459 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  36.68 
 
 
459 aa  268  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  40.05 
 
 
454 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  37.8 
 
 
449 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  37.8 
 
 
449 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  37.8 
 
 
449 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  37.8 
 
 
449 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  36.9 
 
 
446 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  37.8 
 
 
449 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6015  hypothetical protein  39.17 
 
 
462 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>