More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4086 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  75.58 
 
 		 450 aa  655    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  87.36 
 
 		 448 aa  779    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3268  hypothetical protein  87.13 
 
 		 448 aa  776    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3345  hypothetical protein  77.42 
 
 		 451 aa  671    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  899    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  87.36 
 
 		 448 aa  779    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  77.22 
 
 		 441 aa  683    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1483  hypothetical protein  87.13 
 
 		 448 aa  776    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  87.36 
 
 		 448 aa  779    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  96.62 
 
 		 444 aa  874    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3154  hypothetical protein  87.36 
 
 		 448 aa  779    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  87.36 
 
 		 448 aa  779    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  75.96 
 
 		 451 aa  667    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  86.67 
 
 		 448 aa  771    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  99.32 
 
 		 444 aa  895    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  84.13 
 
 		 442 aa  764    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0344  hypothetical protein  76.08 
 
 		 441 aa  677    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  81.98 
 
 		 445 aa  751    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  899    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  83.9 
 
 		 442 aa  763    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  96.17 
 
 		 444 aa  864    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  96.4 
 
 		 444 aa  868    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  92.57 
 
 		 444 aa  835    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3854  hypothetical protein  66.21 
 
 		 447 aa  599  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  66.06 
 
 		 440 aa  597  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  66.36 
 
 		 443 aa  592  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  66.59 
 
 		 443 aa  587  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  66.74 
 
 		 446 aa  581  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  63.41 
 
 		 446 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  63.62 
 
 		 444 aa  568  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  63.16 
 
 		 447 aa  558  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3798  hypothetical protein  64.04 
 
 		 441 aa  551  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3685  hypothetical protein  65.53 
 
 		 442 aa  551  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  61.68 
 
 		 442 aa  552  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  62.84 
 
 		 447 aa  547  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3803  hypothetical protein  63.47 
 
 		 442 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3480  hypothetical protein  63.01 
 
 		 442 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.634829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  56.25 
 
 		 443 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  58.77 
 
 		 444 aa  515  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  59.18 
 
 		 444 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00991  aminotransferase, class III (AFU_orthologue; AFUA_1G16810)  47.3 
 
 		 448 aa  419  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.47575  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06930  conserved hypothetical protein  47.34 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38281  aminotransferase  45.27 
 
 		 461 aa  382  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722642  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06180  class III aminotransferase, putative  44.72 
 
 		 469 aa  346  6e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0804287  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0831  aminotransferase class-III  43.52 
 
 		 470 aa  318  1e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3905  aminotransferase  41.74 
 
 		 451 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.57399  decreased coverage  0.00444917 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  41.55 
 
 		 442 aa  315  9e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  40.71 
 
 		 455 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2094  aminotransferase class-III  37.35 
 
 		 459 aa  306  6e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0920345  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2111  aminotransferase class-III  41.16 
 
 		 453 aa  303  4.0000000000000003e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1177  aminotransferase class-III  41.89 
 
 		 444 aa  295  1e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  38.19 
 
 		 451 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2934  hypothetical protein  39.38 
 
 		 466 aa  290  4e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.913582  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6095  hypothetical protein  41.03 
 
 		 465 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  39.1 
 
 		 459 aa  282  8.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1489  hypothetical protein  40.33 
 
 		 465 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147981  hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  36.78 
 
 		 463 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  39.19 
 
 		 456 aa  275  9e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  37.62 
 
 		 459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  38.55 
 
 		 456 aa  274  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35479  aminotransferase  36.69 
 
 		 465 aa  273  4.0000000000000004e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2275  hypothetical protein  35.65 
 
 		 436 aa  272  7e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  38.14 
 
 		 456 aa  271  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4329  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  34.43 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656375  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1751  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  34.35 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000427853  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  38.14 
 
 		 456 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  37.27 
 
 		 459 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3048  hypothetical protein  35.42 
 
 		 436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3075  aminotransferase class-III  41.44 
 
 		 437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2328  hypothetical protein  35.19 
 
 		 436 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000223994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2402  hypothetical protein  35.19 
 
 		 436 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2139  hypothetical protein  35.19 
 
 		 436 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2077  hypothetical protein  35.19 
 
 		 436 aa  269  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2073  hypothetical protein  35.19 
 
 		 436 aa  269  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2319  hypothetical protein  35.19 
 
 		 436 aa  269  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2294  hypothetical protein  35.19 
 
 		 436 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  36.3 
 
 		 458 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  36.32 
 
 		 461 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  36.32 
 
 		 461 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2247  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  36.32 
 
 		 455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  37.41 
 
 		 456 aa  266  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  36.32 
 
 		 461 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  37.39 
 
 		 456 aa  266  8e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5668  hypothetical protein  39.44 
 
 		 457 aa  265  8.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0122  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  34.38 
 
 		 452 aa  265  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000591474  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  36.32 
 
 		 463 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2112  hypothetical protein  34.72 
 
 		 436 aa  265  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177398  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  37.5 
 
 		 449 aa  265  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  40.49 
 
 		 466 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2200  putative aminotransferase  37.12 
 
 		 461 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.534345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2078  putative aminotransferase  37.12 
 
 		 461 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  37.04 
 
 		 449 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  37.04 
 
 		 449 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  37.04 
 
 		 449 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  37.04 
 
 		 449 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1108  putative aminotransferase  36.66 
 
 		 465 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  36.32 
 
 		 459 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  38.22 
 
 		 448 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  35 
 
 		 466 aa  264  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  37.04 
 
 		 449 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>