More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2288 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  100 
 
 		 442 aa  891    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  46.62 
 
 		 447 aa  355  7.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  45.7 
 
 		 447 aa  349  7e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  45.12 
 
 		 443 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  44.88 
 
 		 443 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  43.81 
 
 		 440 aa  342  5.999999999999999e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  44.47 
 
 		 444 aa  342  8e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  44.9 
 
 		 444 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  43.15 
 
 		 444 aa  338  1.9999999999999998e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  44.14 
 
 		 446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  42.57 
 
 		 446 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  44.52 
 
 		 442 aa  333  4e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  43.38 
 
 		 445 aa  332  8e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3803  hypothetical protein  46.26 
 
 		 442 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3480  hypothetical protein  45.8 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.634829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3854  hypothetical protein  43.15 
 
 		 447 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  42.69 
 
 		 444 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  43.38 
 
 		 442 aa  326  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  43.55 
 
 		 448 aa  325  9e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  43.15 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  43.09 
 
 		 448 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  43.09 
 
 		 448 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  43.09 
 
 		 448 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  43.09 
 
 		 448 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  43.25 
 
 		 444 aa  322  8e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  42.01 
 
 		 444 aa  322  8e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1483  hypothetical protein  42.86 
 
 		 448 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3268  hypothetical protein  42.86 
 
 		 448 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3154  hypothetical protein  42.86 
 
 		 448 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3685  hypothetical protein  45.12 
 
 		 442 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  42.24 
 
 		 444 aa  318  9e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0344  hypothetical protein  44.16 
 
 		 441 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  41.78 
 
 		 444 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  38.9 
 
 		 443 aa  316  6e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3798  hypothetical protein  44.06 
 
 		 441 aa  316  6e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  41.55 
 
 		 444 aa  315  9e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  41.55 
 
 		 444 aa  315  9e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2275  hypothetical protein  38.12 
 
 		 436 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2139  hypothetical protein  38.12 
 
 		 436 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2077  hypothetical protein  38.12 
 
 		 436 aa  310  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2073  hypothetical protein  38.12 
 
 		 436 aa  310  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  44.13 
 
 		 441 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2294  hypothetical protein  38.12 
 
 		 436 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2319  hypothetical protein  38.12 
 
 		 436 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3048  hypothetical protein  37.88 
 
 		 436 aa  310  5e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2328  hypothetical protein  38.12 
 
 		 436 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000223994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2402  hypothetical protein  38.12 
 
 		 436 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  38.48 
 
 		 455 aa  309  8e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  43.18 
 
 		 450 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  43.64 
 
 		 451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3345  hypothetical protein  42.95 
 
 		 451 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2112  hypothetical protein  37.41 
 
 		 436 aa  302  9e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177398  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1682  hypothetical protein  36.94 
 
 		 436 aa  301  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63587  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00991  aminotransferase, class III (AFU_orthologue; AFUA_1G16810)  37.91 
 
 		 448 aa  299  6e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.47575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38281  aminotransferase  37.9 
 
 		 461 aa  298  9e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3075  aminotransferase class-III  43.58 
 
 		 437 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116582  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3905  aminotransferase  38.64 
 
 		 451 aa  287  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.57399  decreased coverage  0.00444917 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  37.28 
 
 		 479 aa  286  5e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  40 
 
 		 454 aa  279  8e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06930  conserved hypothetical protein  35.48 
 
 		 447 aa  276  4e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0831  aminotransferase class-III  38.26 
 
 		 470 aa  276  4e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2094  aminotransferase class-III  36.11 
 
 		 459 aa  274  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0920345  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1177  aminotransferase class-III  41.86 
 
 		 444 aa  273  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2111  aminotransferase class-III  41.52 
 
 		 453 aa  272  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  38.06 
 
 		 449 aa  270  4e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  39.62 
 
 		 459 aa  268  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  38.86 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  38.15 
 
 		 450 aa  261  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0516  aminotransferase class-III  37.26 
 
 		 459 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0984655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  37.5 
 
 		 454 aa  260  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  38.82 
 
 		 461 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  38.82 
 
 		 461 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  38.08 
 
 		 456 aa  259  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  38.9 
 
 		 461 aa  259  7e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  36 
 
 		 450 aa  259  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  37.62 
 
 		 466 aa  259  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  37.38 
 
 		 450 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  38.79 
 
 		 462 aa  257  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  41.31 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  37.5 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  40.1 
 
 		 458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  36.43 
 
 		 457 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  38.89 
 
 		 461 aa  253  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  37.79 
 
 		 456 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  35.5 
 
 		 465 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  38.79 
 
 		 456 aa  252  8.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0218  aminotransferase class-III  35.5 
 
 		 452 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  37.56 
 
 		 460 aa  252  9.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  39.73 
 
 		 462 aa  251  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  37.73 
 
 		 460 aa  252  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  37.5 
 
 		 458 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  38.53 
 
 		 463 aa  251  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  36.79 
 
 		 457 aa  250  4e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  35.87 
 
 		 456 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  35.87 
 
 		 456 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  38.46 
 
 		 464 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  38.02 
 
 		 428 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  34.68 
 
 		 451 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  38.48 
 
 		 452 aa  248  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  39.44 
 
 		 457 aa  248  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>