More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0218 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0218  aminotransferase class-III  100 
 
 		 452 aa  934    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0516  aminotransferase class-III  62.81 
 
 		 459 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0984655 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0051  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  57.56 
 
 		 470 aa  543  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0943  aminotransferase  56.92 
 
 		 460 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434836  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4273  aminotransferase class-III  55.48 
 
 		 459 aa  525  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2602  aminotransferase class-III  56.7 
 
 		 459 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2972  aminotransferase class-III  56.7 
 
 		 460 aa  522  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.121159 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2042  taurin--pyruvate aminotransferase  55.8 
 
 		 460 aa  512  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.291781 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0159  aminotransferase  54.72 
 
 		 466 aa  505  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  41.28 
 
 		 450 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  40.13 
 
 		 450 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  40.13 
 
 		 449 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  40.58 
 
 		 449 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  40.13 
 
 		 449 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  40.13 
 
 		 449 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  40.58 
 
 		 450 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  40.58 
 
 		 450 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3671  aminotransferase  40.13 
 
 		 450 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0477751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1673  aminotransferase  40.58 
 
 		 450 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0301264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  40.13 
 
 		 450 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  40.94 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1331  aminotransferase  41.12 
 
 		 451 aa  360  3e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  41.1 
 
 		 449 aa  360  4e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  40.32 
 
 		 457 aa  358  9.999999999999999e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  38.77 
 
 		 451 aa  306  5.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  37.42 
 
 		 454 aa  297  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  37.42 
 
 		 450 aa  296  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  38.02 
 
 		 451 aa  293  3e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  35.57 
 
 		 456 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  37.18 
 
 		 449 aa  285  9e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  35.78 
 
 		 456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  36.52 
 
 		 455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  36.57 
 
 		 456 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  36.34 
 
 		 456 aa  283  5.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  35.25 
 
 		 479 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  36.66 
 
 		 458 aa  277  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  35.6 
 
 		 459 aa  277  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  36.96 
 
 		 457 aa  276  5e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  33.77 
 
 		 459 aa  275  9e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  34.82 
 
 		 463 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  35.95 
 
 		 459 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  37.59 
 
 		 454 aa  269  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  36.04 
 
 		 456 aa  269  8.999999999999999e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  35.14 
 
 		 467 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  36.74 
 
 		 463 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  34.92 
 
 		 456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  35.9 
 
 		 453 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  35.43 
 
 		 457 aa  266  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  38.83 
 
 		 460 aa  266  7e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  40 
 
 		 466 aa  265  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  36.36 
 
 		 463 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  37.3 
 
 		 465 aa  263  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  34.31 
 
 		 465 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  33.19 
 
 		 457 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  34.51 
 
 		 462 aa  261  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  34.83 
 
 		 461 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  33.26 
 
 		 465 aa  261  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  35.59 
 
 		 456 aa  260  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  35.43 
 
 		 460 aa  260  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  35.7 
 
 		 452 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  33.84 
 
 		 455 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6578  hypothetical protein  34.09 
 
 		 465 aa  259  8e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204775  normal  0.0135068 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  34.09 
 
 		 465 aa  259  9e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  34.09 
 
 		 465 aa  259  9e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  34.15 
 
 		 451 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  34.53 
 
 		 461 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  35.83 
 
 		 454 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  34.86 
 
 		 459 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  34.53 
 
 		 461 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  35.7 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  33.93 
 
 		 465 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  35.92 
 
 		 463 aa  257  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  37.5 
 
 		 457 aa  257  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  35.7 
 
 		 452 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  35.14 
 
 		 455 aa  257  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  35.28 
 
 		 468 aa  256  4e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  35.75 
 
 		 469 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  36.64 
 
 		 467 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  36.73 
 
 		 440 aa  256  8e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  34.95 
 
 		 457 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  34.27 
 
 		 453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  35.46 
 
 		 468 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  34.5 
 
 		 453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  37.31 
 
 		 468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6015  hypothetical protein  35.14 
 
 		 462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  33.77 
 
 		 468 aa  254  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  35.22 
 
 		 456 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  34.83 
 
 		 456 aa  254  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  34.03 
 
 		 453 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  35.8 
 
 		 466 aa  254  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  35.22 
 
 		 456 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  33.33 
 
 		 460 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  34.63 
 
 		 443 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  33.63 
 
 		 454 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  33.18 
 
 		 485 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  35.19 
 
 		 450 aa  253  6e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  34.22 
 
 		 458 aa  252  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  33.18 
 
 		 463 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  35.5 
 
 		 442 aa  252  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  36.2 
 
 		 460 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>