More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2972 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4273  aminotransferase class-III  81.15 
 
 		 459 aa  793    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0943  aminotransferase  96.52 
 
 		 460 aa  911    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434836  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2972  aminotransferase class-III  100 
 
 		 460 aa  957    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.121159 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0159  aminotransferase  71.24 
 
 		 466 aa  702    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2042  taurin--pyruvate aminotransferase  76.77 
 
 		 460 aa  739    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.291781 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2602  aminotransferase class-III  96.73 
 
 		 459 aa  910    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0051  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  58.37 
 
 		 470 aa  573  1.0000000000000001e-162  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0218  aminotransferase class-III  56.7 
 
 		 452 aa  529  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0516  aminotransferase class-III  55.66 
 
 		 459 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0984655 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  41.15 
 
 		 450 aa  353  5e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  40.67 
 
 		 450 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  37.09 
 
 		 450 aa  325  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  37.97 
 
 		 449 aa  323  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  37.53 
 
 		 450 aa  324  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  37.53 
 
 		 450 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  37.97 
 
 		 449 aa  323  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  38.19 
 
 		 449 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  37.97 
 
 		 449 aa  323  5e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  37.09 
 
 		 450 aa  323  5e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3671  aminotransferase  37.09 
 
 		 450 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0477751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  40.72 
 
 		 457 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  38.78 
 
 		 449 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1331  aminotransferase  39.05 
 
 		 451 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1673  aminotransferase  37.31 
 
 		 450 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0301264  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  38.21 
 
 		 479 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  37.53 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  36.68 
 
 		 454 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  38.29 
 
 		 463 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  36.03 
 
 		 450 aa  273  6e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  35.75 
 
 		 449 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  35.84 
 
 		 461 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  35.84 
 
 		 461 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  35.84 
 
 		 461 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  35.09 
 
 		 451 aa  266  4e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  35.24 
 
 		 463 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  34.71 
 
 		 454 aa  266  5e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  35.46 
 
 		 460 aa  264  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  35.67 
 
 		 456 aa  264  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  35.18 
 
 		 459 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  36.1 
 
 		 461 aa  261  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  34.84 
 
 		 456 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  33.69 
 
 		 467 aa  259  7e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  35.06 
 
 		 462 aa  258  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  36.14 
 
 		 468 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  34.16 
 
 		 448 aa  257  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  34.93 
 
 		 455 aa  257  4e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  33.98 
 
 		 468 aa  257  4e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  35.51 
 
 		 456 aa  256  5e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  33.55 
 
 		 460 aa  256  9e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  33.05 
 
 		 464 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  35.4 
 
 		 462 aa  254  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  34.29 
 
 		 451 aa  253  5.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  34.33 
 
 		 465 aa  253  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  35.75 
 
 		 440 aa  253  7e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  34.68 
 
 		 459 aa  252  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  34 
 
 		 456 aa  252  8.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  34.07 
 
 		 459 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  33.76 
 
 		 463 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  36.24 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  36.03 
 
 		 457 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  36.63 
 
 		 458 aa  250  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  38.22 
 
 		 457 aa  249  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  33.41 
 
 		 467 aa  249  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  32.62 
 
 		 469 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  34.21 
 
 		 466 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  33.86 
 
 		 448 aa  248  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  38.64 
 
 		 454 aa  247  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  35.31 
 
 		 468 aa  247  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  33.4 
 
 		 463 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  32.96 
 
 		 458 aa  246  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  32.27 
 
 		 453 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  34.62 
 
 		 446 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  32.73 
 
 		 457 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  35.48 
 
 		 464 aa  245  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  35.12 
 
 		 456 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  34.65 
 
 		 460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  34.57 
 
 		 460 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  34.97 
 
 		 448 aa  244  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  33.91 
 
 		 457 aa  244  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  34.26 
 
 		 456 aa  243  7e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4437  hypothetical protein  34.22 
 
 		 451 aa  243  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691941  normal  0.936595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  33.33 
 
 		 459 aa  243  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  34.9 
 
 		 456 aa  242  7.999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  31.82 
 
 		 453 aa  242  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  34.06 
 
 		 459 aa  242  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  34.24 
 
 		 446 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  34.24 
 
 		 446 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  34.24 
 
 		 446 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  32.05 
 
 		 453 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  31.82 
 
 		 453 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  30.74 
 
 		 466 aa  242  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  34.39 
 
 		 446 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  34.24 
 
 		 446 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1166  hypothetical protein  32.1 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41749  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  31.56 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  34.84 
 
 		 446 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  32.43 
 
 		 455 aa  240  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  34.42 
 
 		 458 aa  239  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  34.77 
 
 		 449 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  32.27 
 
 		 454 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>