More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0051 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0051  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  100 
 
 
470 aa  977    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4273  aminotransferase class-III  59.47 
 
 
459 aa  579  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0943  aminotransferase  59.73 
 
 
460 aa  578  1e-164  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434836  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2042  taurin--pyruvate aminotransferase  58.8 
 
 
460 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.291781 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2602  aminotransferase class-III  59.5 
 
 
459 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2972  aminotransferase class-III  58.37 
 
 
460 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.121159 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0159  aminotransferase  59.38 
 
 
466 aa  566  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0218  aminotransferase class-III  57.56 
 
 
452 aa  543  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0516  aminotransferase class-III  52.38 
 
 
459 aa  482  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0984655 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  40.98 
 
 
450 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  41.56 
 
 
450 aa  360  3e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  41.33 
 
 
449 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  41.33 
 
 
449 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  41.55 
 
 
450 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  41.11 
 
 
449 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  41.11 
 
 
449 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  40.89 
 
 
450 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  41.11 
 
 
450 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  40.62 
 
 
450 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1673  aminotransferase  40.62 
 
 
450 aa  354  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0301264  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3671  aminotransferase  40.4 
 
 
450 aa  354  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0477751  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  40.35 
 
 
457 aa  350  4e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1331  aminotransferase  41.59 
 
 
451 aa  348  9e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  42.66 
 
 
449 aa  348  9e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  39.17 
 
 
456 aa  317  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  38.27 
 
 
449 aa  295  9e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  39.07 
 
 
451 aa  293  5e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  36.8 
 
 
467 aa  290  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  38.6 
 
 
451 aa  290  4e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  38.29 
 
 
450 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  37.53 
 
 
465 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  37.3 
 
 
459 aa  288  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  38.24 
 
 
454 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  37.64 
 
 
459 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  37.15 
 
 
465 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  36.52 
 
 
469 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  36.16 
 
 
479 aa  276  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  35.68 
 
 
467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  35.96 
 
 
449 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  36.59 
 
 
463 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  36.07 
 
 
444 aa  273  4.0000000000000004e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  34.69 
 
 
468 aa  272  7e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  36.38 
 
 
466 aa  272  8.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  36.73 
 
 
460 aa  272  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  35.81 
 
 
449 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  35.81 
 
 
449 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  35.81 
 
 
449 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  35.81 
 
 
449 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  35.81 
 
 
449 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  35.97 
 
 
454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  35.81 
 
 
449 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  35.81 
 
 
449 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  36.38 
 
 
463 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  36.32 
 
 
468 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  35.15 
 
 
446 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  35.15 
 
 
446 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  35.15 
 
 
446 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  35.15 
 
 
446 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  35.92 
 
 
457 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  35.15 
 
 
446 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  36.26 
 
 
446 aa  266  8e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  36.14 
 
 
453 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  34.78 
 
 
468 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  36.05 
 
 
446 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  34.92 
 
 
446 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  34.36 
 
 
457 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  35.32 
 
 
461 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  35.32 
 
 
461 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  35.7 
 
 
455 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  34.79 
 
 
462 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  35.7 
 
 
453 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  35.84 
 
 
453 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  37.34 
 
 
464 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  37.34 
 
 
464 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  36.51 
 
 
455 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  37.47 
 
 
464 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  35.1 
 
 
461 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  33.78 
 
 
448 aa  258  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  35.48 
 
 
453 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  36.28 
 
 
454 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  37.47 
 
 
464 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  37.34 
 
 
464 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  34.92 
 
 
457 aa  256  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  35.51 
 
 
460 aa  256  8e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  36.4 
 
 
464 aa  256  9e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2091  hypothetical protein  34.27 
 
 
473 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  35.49 
 
 
463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  34.27 
 
 
457 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  36.45 
 
 
448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  35.09 
 
 
464 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  36.67 
 
 
448 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  36.67 
 
 
448 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  36.55 
 
 
458 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  35.93 
 
 
454 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  35.49 
 
 
456 aa  252  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  33.77 
 
 
456 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  34.36 
 
 
456 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  34.02 
 
 
456 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  34.02 
 
 
456 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1450  hypothetical protein  34.06 
 
 
473 aa  250  5e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>