More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2042 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2602  aminotransferase class-III  77.21 
 
 		 459 aa  725    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2042  taurin--pyruvate aminotransferase  100 
 
 		 460 aa  957    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.291781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0943  aminotransferase  76.99 
 
 		 460 aa  724    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434836  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4273  aminotransferase class-III  75.11 
 
 		 459 aa  739    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2972  aminotransferase class-III  76.77 
 
 		 460 aa  725    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.121159 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0159  aminotransferase  76.03 
 
 		 466 aa  727    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0051  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  58.8 
 
 		 470 aa  577  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0218  aminotransferase class-III  55.8 
 
 		 452 aa  512  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0516  aminotransferase class-III  52.7 
 
 		 459 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0984655 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  40.27 
 
 		 450 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  40 
 
 		 450 aa  340  4e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  37.42 
 
 		 450 aa  317  3e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  38.08 
 
 		 449 aa  316  4e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  37.86 
 
 		 449 aa  317  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  38.08 
 
 		 450 aa  316  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  37.86 
 
 		 449 aa  316  5e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  38.08 
 
 		 450 aa  316  5e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  37.86 
 
 		 449 aa  316  7e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  37.64 
 
 		 450 aa  315  9e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3671  aminotransferase  37.42 
 
 		 450 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0477751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1673  aminotransferase  37.64 
 
 		 450 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0301264  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  39.42 
 
 		 457 aa  311  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1331  aminotransferase  38.41 
 
 		 451 aa  310  4e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  37.3 
 
 		 449 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  37.31 
 
 		 456 aa  276  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  37.99 
 
 		 454 aa  276  8e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  36.87 
 
 		 449 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  36.6 
 
 		 479 aa  272  8.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  37.81 
 
 		 463 aa  270  5e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  35.42 
 
 		 456 aa  269  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  36.89 
 
 		 459 aa  267  2e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  37.34 
 
 		 457 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  36.84 
 
 		 450 aa  266  5e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  36.4 
 
 		 460 aa  263  6.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  35.28 
 
 		 467 aa  261  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  35.23 
 
 		 455 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  34.97 
 
 		 448 aa  258  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  38.31 
 
 		 458 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  34.42 
 
 		 451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  34.95 
 
 		 463 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  36.38 
 
 		 456 aa  253  6e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  35.06 
 
 		 454 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  35.39 
 
 		 468 aa  252  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  35.17 
 
 		 457 aa  250  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  33.18 
 
 		 457 aa  250  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  35.01 
 
 		 463 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  35.75 
 
 		 440 aa  250  5e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02700  putative aminotransferase  33.4 
 
 		 460 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0755258 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4437  hypothetical protein  33.99 
 
 		 451 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691941  normal  0.936595 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  34.27 
 
 		 469 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  33.79 
 
 		 457 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  34.29 
 
 		 451 aa  248  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  35.5 
 
 		 467 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  34.64 
 
 		 456 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  35.44 
 
 		 462 aa  247  4e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  33.83 
 
 		 464 aa  246  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0307  putative aminotransferase  33.19 
 
 		 460 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  34.97 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  34.19 
 
 		 465 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3217  aminotransferase  36.16 
 
 		 449 aa  244  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  32.22 
 
 		 455 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  34.9 
 
 		 461 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  33.03 
 
 		 471 aa  243  6e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  35.41 
 
 		 458 aa  243  6e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  34.76 
 
 		 457 aa  243  7e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  34.94 
 
 		 464 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  36.46 
 
 		 458 aa  242  7.999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  34.08 
 
 		 445 aa  242  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  35.75 
 
 		 464 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  34.05 
 
 		 463 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  34.29 
 
 		 459 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  33.78 
 
 		 448 aa  242  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  35.75 
 
 		 464 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  34.68 
 
 		 461 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  34.68 
 
 		 461 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  34.44 
 
 		 456 aa  242  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  33.77 
 
 		 465 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  35.1 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  34.29 
 
 		 459 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  34.33 
 
 		 466 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  33.19 
 
 		 459 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  34.68 
 
 		 457 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  32.53 
 
 		 460 aa  240  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  31.73 
 
 		 455 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1166  hypothetical protein  32.46 
 
 		 452 aa  239  5e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41749  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  34.78 
 
 		 442 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  31.8 
 
 		 466 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  35.57 
 
 		 464 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  35.79 
 
 		 464 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  32.95 
 
 		 453 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  34.41 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  33.41 
 
 		 468 aa  237  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  33.91 
 
 		 468 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  35.44 
 
 		 459 aa  236  8e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  33.69 
 
 		 460 aa  236  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  33.62 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  33.89 
 
 		 464 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  33.99 
 
 		 459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  33.48 
 
 		 470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  34.56 
 
 		 456 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>