More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4273 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4273  aminotransferase class-III  100 
 
 		 459 aa  952    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0943  aminotransferase  81.6 
 
 		 460 aa  777    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434836  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2972  aminotransferase class-III  81.15 
 
 		 460 aa  780    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.121159 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0159  aminotransferase  71.4 
 
 		 466 aa  691    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2602  aminotransferase class-III  81.37 
 
 		 459 aa  776    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2042  taurin--pyruvate aminotransferase  75.11 
 
 		 460 aa  739    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.291781 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0051  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  59.47 
 
 		 470 aa  579  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0218  aminotransferase class-III  55.48 
 
 		 452 aa  525  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0516  aminotransferase class-III  54.65 
 
 		 459 aa  483  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0984655 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  39.55 
 
 		 450 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  38.91 
 
 		 450 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  37.61 
 
 		 450 aa  331  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  37.83 
 
 		 449 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  37.61 
 
 		 449 aa  330  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  37.61 
 
 		 450 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  37.83 
 
 		 450 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  37.83 
 
 		 450 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  37.61 
 
 		 449 aa  330  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  37.39 
 
 		 449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1673  aminotransferase  37.61 
 
 		 450 aa  327  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0301264  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3671  aminotransferase  37.39 
 
 		 450 aa  327  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0477751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1331  aminotransferase  37.81 
 
 		 451 aa  324  3e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  39.64 
 
 		 457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  37.41 
 
 		 449 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  36.4 
 
 		 456 aa  276  8e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  35.89 
 
 		 479 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  35.34 
 
 		 449 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  35.51 
 
 		 454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  35.13 
 
 		 459 aa  270  5e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  35.37 
 
 		 450 aa  268  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  35.23 
 
 		 461 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  35.34 
 
 		 468 aa  266  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  37.39 
 
 		 463 aa  265  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  35.41 
 
 		 456 aa  264  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  35.01 
 
 		 461 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  35.01 
 
 		 461 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  34.98 
 
 		 461 aa  260  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  36.65 
 
 		 460 aa  260  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  35.41 
 
 		 467 aa  260  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  35.88 
 
 		 463 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  34.85 
 
 		 451 aa  259  7e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  34.49 
 
 		 454 aa  259  1e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  34.86 
 
 		 468 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  34.27 
 
 		 462 aa  256  5e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  34.49 
 
 		 456 aa  255  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  34.15 
 
 		 463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  33.99 
 
 		 457 aa  253  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  34.68 
 
 		 463 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  35.34 
 
 		 459 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  35.33 
 
 		 457 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  34 
 
 		 448 aa  251  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  35.24 
 
 		 457 aa  251  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  33.69 
 
 		 451 aa  250  3e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  36.11 
 
 		 457 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  35.45 
 
 		 440 aa  249  6e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  33.26 
 
 		 456 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  36.05 
 
 		 445 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  34.37 
 
 		 457 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  34.2 
 
 		 456 aa  248  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  32.47 
 
 		 457 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  33.33 
 
 		 466 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  34.56 
 
 		 467 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  34.13 
 
 		 462 aa  247  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  33.71 
 
 		 453 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  34.9 
 
 		 458 aa  246  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  32.32 
 
 		 455 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  35.75 
 
 		 458 aa  246  9e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  34.91 
 
 		 459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  34.76 
 
 		 442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  34.05 
 
 		 465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  33.48 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  32.62 
 
 		 464 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  33.76 
 
 		 460 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  32.4 
 
 		 460 aa  243  5e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  35.35 
 
 		 452 aa  242  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  33.26 
 
 		 465 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  33.55 
 
 		 460 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  33.26 
 
 		 453 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  31.56 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  33.98 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  33.48 
 
 		 453 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  32.69 
 
 		 469 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  33.03 
 
 		 453 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  34.23 
 
 		 459 aa  240  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  34.8 
 
 		 459 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  34.89 
 
 		 448 aa  239  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  35.61 
 
 		 464 aa  239  5.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  33.77 
 
 		 460 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  33.05 
 
 		 466 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  32.96 
 
 		 460 aa  239  8e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  34.41 
 
 		 442 aa  239  9e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4437  hypothetical protein  32.39 
 
 		 451 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691941  normal  0.936595 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  36.07 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  33.26 
 
 		 452 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  32.22 
 
 		 454 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  35.54 
 
 		 438 aa  237  4e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  34.89 
 
 		 448 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  34.89 
 
 		 448 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  34.89 
 
 		 448 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  34.89 
 
 		 448 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>