More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0516 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0516  aminotransferase class-III  100 
 
 		 459 aa  945    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0984655 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0218  aminotransferase class-III  62.28 
 
 		 452 aa  581  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2602  aminotransferase class-III  54.41 
 
 		 459 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2972  aminotransferase class-III  55.07 
 
 		 460 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.121159 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0943  aminotransferase  54.41 
 
 		 460 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434836  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4273  aminotransferase class-III  54.3 
 
 		 459 aa  489  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0051  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  52.25 
 
 		 470 aa  484  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2042  taurin--pyruvate aminotransferase  52.9 
 
 		 460 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.291781 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0159  aminotransferase  52.27 
 
 		 466 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  42.98 
 
 		 457 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  42.21 
 
 		 450 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  40.67 
 
 		 449 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  40.67 
 
 		 450 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  41.15 
 
 		 450 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  40.45 
 
 		 450 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  40.22 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  40.22 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  40.22 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  40.22 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  39.78 
 
 		 450 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3671  aminotransferase  39.78 
 
 		 450 aa  364  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0477751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1673  aminotransferase  39.78 
 
 		 450 aa  363  2e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0301264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  40.76 
 
 		 449 aa  362  9e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1331  aminotransferase  41.14 
 
 		 451 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  37.31 
 
 		 451 aa  291  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  36.92 
 
 		 449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  37.02 
 
 		 479 aa  283  5.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  38.51 
 
 		 454 aa  280  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  37.92 
 
 		 451 aa  279  8e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  38.51 
 
 		 450 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  38.87 
 
 		 456 aa  273  7e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  35.98 
 
 		 459 aa  269  8e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  37.84 
 
 		 465 aa  269  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  37.5 
 
 		 465 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  37.36 
 
 		 465 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  37.14 
 
 		 457 aa  264  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  34.2 
 
 		 456 aa  263  4.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6578  hypothetical protein  36.84 
 
 		 465 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204775  normal  0.0135068 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  36.34 
 
 		 465 aa  262  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  35.2 
 
 		 458 aa  262  8.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  35.89 
 
 		 464 aa  262  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  34.16 
 
 		 448 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  37.26 
 
 		 442 aa  260  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  36.34 
 
 		 460 aa  260  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  34.01 
 
 		 454 aa  259  6e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  36.4 
 
 		 465 aa  259  8e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  36.4 
 
 		 465 aa  259  8e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  34.57 
 
 		 456 aa  257  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  35.2 
 
 		 463 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  32.74 
 
 		 456 aa  257  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  33.62 
 
 		 456 aa  256  8e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  35.75 
 
 		 462 aa  255  9e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  35.5 
 
 		 463 aa  256  9e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  33.48 
 
 		 456 aa  254  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  34.24 
 
 		 461 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  34.24 
 
 		 461 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  33.48 
 
 		 456 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  35.54 
 
 		 458 aa  253  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  34.88 
 
 		 455 aa  252  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4437  hypothetical protein  35.19 
 
 		 451 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691941  normal  0.936595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  34.99 
 
 		 462 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  35.24 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  35.16 
 
 		 463 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6015  hypothetical protein  37.5 
 
 		 462 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  36.47 
 
 		 448 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  33.79 
 
 		 461 aa  250  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  36.47 
 
 		 448 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  35.01 
 
 		 469 aa  250  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  34.12 
 
 		 468 aa  249  6e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  35.65 
 
 		 467 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  35.11 
 
 		 443 aa  249  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  36.24 
 
 		 448 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  33.64 
 
 		 444 aa  248  2e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  33.7 
 
 		 456 aa  247  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  34.37 
 
 		 460 aa  246  8e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  36.83 
 
 		 468 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  34.48 
 
 		 457 aa  245  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  33.91 
 
 		 463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  35.95 
 
 		 460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  34.37 
 
 		 460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  34.59 
 
 		 464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  34.22 
 
 		 456 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  35 
 
 		 454 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  34.57 
 
 		 457 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2542  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  33.48 
 
 		 449 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00207797  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  35.35 
 
 		 466 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  35.9 
 
 		 445 aa  243  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  35.43 
 
 		 440 aa  243  5e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  34.39 
 
 		 448 aa  243  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  34.31 
 
 		 461 aa  243  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  36.28 
 
 		 452 aa  243  6e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  32.61 
 
 		 466 aa  243  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  36.26 
 
 		 442 aa  243  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  34.08 
 
 		 459 aa  243  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4329  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  32.02 
 
 		 446 aa  242  9e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656375  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1166  hypothetical protein  34.23 
 
 		 452 aa  242  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41749  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  34.09 
 
 		 455 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  35.9 
 
 		 442 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  34.42 
 
 		 458 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2247  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  33.63 
 
 		 455 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>