More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1142 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A3154  hypothetical protein  85.78 
 
 
448 aa  764    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  95.25 
 
 
442 aa  855    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3268  hypothetical protein  85.55 
 
 
448 aa  762    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  74.94 
 
 
450 aa  654    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  85.78 
 
 
448 aa  766    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  85.78 
 
 
448 aa  766    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  85.78 
 
 
448 aa  766    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  73.24 
 
 
441 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1483  hypothetical protein  85.55 
 
 
448 aa  762    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  88.21 
 
 
445 aa  797    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  85.78 
 
 
448 aa  766    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  83.9 
 
 
444 aa  763    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  85.49 
 
 
444 aa  773    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  86.7 
 
 
448 aa  771    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  83.9 
 
 
444 aa  762    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  891    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0344  hypothetical protein  74.38 
 
 
441 aa  658    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  84.13 
 
 
444 aa  764    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  84.13 
 
 
444 aa  764    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  83.45 
 
 
444 aa  758    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  73.68 
 
 
451 aa  652    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  82.99 
 
 
444 aa  755    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3345  hypothetical protein  74.48 
 
 
451 aa  652    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  66.29 
 
 
440 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3854  hypothetical protein  65.16 
 
 
447 aa  598  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  65.7 
 
 
446 aa  585  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  67.44 
 
 
446 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  65.43 
 
 
443 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  63.76 
 
 
444 aa  572  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  64.43 
 
 
443 aa  567  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  61.54 
 
 
442 aa  552  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  62.76 
 
 
447 aa  551  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3685  hypothetical protein  65.3 
 
 
442 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  62.78 
 
 
447 aa  550  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3803  hypothetical protein  64.38 
 
 
442 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3798  hypothetical protein  63.34 
 
 
441 aa  538  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3480  hypothetical protein  64.16 
 
 
442 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.634829  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  60.59 
 
 
444 aa  525  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  58.82 
 
 
444 aa  506  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  55.56 
 
 
443 aa  505  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00991  aminotransferase, class III (AFU_orthologue; AFUA_1G16810)  48.15 
 
 
448 aa  402  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.47575  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06930  conserved hypothetical protein  47.48 
 
 
447 aa  389  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38281  aminotransferase  46.81 
 
 
461 aa  378  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722642  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06180  class III aminotransferase, putative  43.58 
 
 
469 aa  334  2e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0804287  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  43.15 
 
 
442 aa  324  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  41.61 
 
 
455 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3905  aminotransferase  42.63 
 
 
451 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.57399  decreased coverage  0.00444917 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0831  aminotransferase class-III  43.1 
 
 
470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2094  aminotransferase class-III  35.63 
 
 
459 aa  303  5.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0920345  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  38.6 
 
 
451 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2275  hypothetical protein  38.08 
 
 
436 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3048  hypothetical protein  37.85 
 
 
436 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2139  hypothetical protein  38.08 
 
 
436 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2077  hypothetical protein  38.08 
 
 
436 aa  287  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2073  hypothetical protein  38.08 
 
 
436 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2319  hypothetical protein  38.08 
 
 
436 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2294  hypothetical protein  38.08 
 
 
436 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2934  hypothetical protein  38.64 
 
 
466 aa  288  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.913582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  40.19 
 
 
459 aa  288  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2328  hypothetical protein  38.08 
 
 
436 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000223994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2402  hypothetical protein  38.08 
 
 
436 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  42.42 
 
 
456 aa  286  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1177  aminotransferase class-III  41.76 
 
 
444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2111  aminotransferase class-III  38.85 
 
 
453 aa  283  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683698  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1682  hypothetical protein  37.62 
 
 
436 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2112  hypothetical protein  37.38 
 
 
436 aa  280  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177398  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  39.26 
 
 
455 aa  279  6e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  36.72 
 
 
471 aa  279  8e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  37.38 
 
 
459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  39.27 
 
 
448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  39.27 
 
 
448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35479  aminotransferase  35.86 
 
 
465 aa  274  2.0000000000000002e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  39.04 
 
 
448 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1751  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  34.17 
 
 
446 aa  274  3e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000427853  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  39.77 
 
 
456 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  38.93 
 
 
458 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  38.07 
 
 
463 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  36.82 
 
 
466 aa  273  6e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2857  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  38.07 
 
 
451 aa  272  9e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6095  hypothetical protein  39.34 
 
 
465 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4329  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  33.94 
 
 
446 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656375  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  39.05 
 
 
449 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  38.19 
 
 
456 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  36.34 
 
 
458 aa  270  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  36.18 
 
 
470 aa  270  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  38.71 
 
 
457 aa  269  7e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  38.33 
 
 
449 aa  269  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  37.44 
 
 
459 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  39.39 
 
 
456 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  39.39 
 
 
456 aa  268  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  39.39 
 
 
456 aa  268  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6568  hypothetical protein  38.55 
 
 
469 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.475128 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  38.1 
 
 
449 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  38.1 
 
 
449 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3049  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  34.1 
 
 
449 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.512098  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  38.1 
 
 
449 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  38.1 
 
 
449 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  38.1 
 
 
449 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  38.1 
 
 
449 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  37.62 
 
 
446 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>