More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2918 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2918  aminotransferase class-III  100 
 
 
435 aa  848    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.337832  normal  0.0522713 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5339  aminotransferase class-III  47.39 
 
 
437 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4493  aminotransferase class-III  48.08 
 
 
436 aa  349  5e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906001  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2626  4-aminobutyrate aminotransferase  31.9 
 
 
445 aa  238  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.805613  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2680  4-aminobutyrate aminotransferase  31.9 
 
 
445 aa  238  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0555  4-aminobutyrate aminotransferase  33.26 
 
 
444 aa  238  2e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.396568  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2159  4-aminobutyrate aminotransferase  31.24 
 
 
445 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0199  4-aminobutyrate aminotransferase  31.51 
 
 
453 aa  235  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00118095  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4825  aminotransferase class-III  38.5 
 
 
446 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00475157  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  35.76 
 
 
453 aa  223  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0387  4-aminobutyrate aminotransferase  32.13 
 
 
450 aa  220  3e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0105989  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  35.61 
 
 
446 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  35.61 
 
 
446 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  35.61 
 
 
446 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1956  4-aminobutyrate aminotransferase  34.35 
 
 
450 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  34.52 
 
 
446 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  33.33 
 
 
430 aa  212  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  36.69 
 
 
432 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  38.21 
 
 
432 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  34.03 
 
 
452 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  32.36 
 
 
431 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  33.65 
 
 
441 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  31.8 
 
 
444 aa  207  3e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  37.47 
 
 
451 aa  207  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  31.54 
 
 
441 aa  206  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  33.74 
 
 
441 aa  206  9e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  32.94 
 
 
461 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  34.96 
 
 
448 aa  205  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3818  4-aminobutyrate aminotransferase  35.09 
 
 
450 aa  203  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104054  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  35.21 
 
 
458 aa  203  4e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  32.28 
 
 
445 aa  203  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  34.59 
 
 
439 aa  202  7e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2798  4-aminobutyrate aminotransferase  34.36 
 
 
456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539792 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3094  4-aminobutyrate aminotransferase  34.9 
 
 
468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  30.3 
 
 
448 aa  199  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0539  aminotransferase class-III  32.46 
 
 
440 aa  199  7.999999999999999e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  33.49 
 
 
434 aa  199  7.999999999999999e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10360  4-aminobutyrate aminotransferase  34.08 
 
 
440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.70128  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  33.86 
 
 
465 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5409  aminotransferase class-III  37.02 
 
 
452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4960  4-aminobutyrate aminotransferase  33.65 
 
 
432 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  33.18 
 
 
465 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4054  aminotransferase  33.9 
 
 
540 aa  196  6e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7835  4-aminobutyrate aminotransferase  33.33 
 
 
443 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0486392 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07656  conserved hypothetical protein  32.95 
 
 
452 aa  194  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.346872  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1308  4-aminobutyrate aminotransferase  36.88 
 
 
450 aa  195  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.518173  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1858  4-aminobutyrate aminotransferase  34.29 
 
 
450 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2993  aminotransferase class-III  34.67 
 
 
436 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  29.72 
 
 
438 aa  193  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2215  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  34.61 
 
 
927 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.360269  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.71 
 
 
401 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1093  4-aminobutyrate aminotransferase  33.73 
 
 
441 aa  191  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0616  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  34.61 
 
 
927 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1647  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  34.61 
 
 
927 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0697  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  34.61 
 
 
927 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1723  4-aminobutyrate aminotransferase  33.58 
 
 
451 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577321  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0662  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  35.48 
 
 
462 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00898604  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2296  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  34.61 
 
 
927 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200957  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1937  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  34.61 
 
 
927 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1732  putative diaminobutyrate--pyruvate aminotransferase/membrane protein  34.61 
 
 
927 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3932  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  34.19 
 
 
470 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0213  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  34.75 
 
 
457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4414  4-aminobutyrate aminotransferase  36.27 
 
 
426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0839  aminotransferase  32.77 
 
 
445 aa  189  5.999999999999999e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.33368  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6480  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  34.09 
 
 
456 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  33.66 
 
 
427 aa  189  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  34.37 
 
 
433 aa  189  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  31.71 
 
 
439 aa  188  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2839  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  32.15 
 
 
493 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000267861  normal  0.189909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3215  aminotransferase class-III  33.88 
 
 
436 aa  188  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26914  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  32.23 
 
 
447 aa  187  2e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  33.81 
 
 
436 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  32.87 
 
 
428 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3146  aminotransferase class-III  35.96 
 
 
408 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.733649  normal  0.0499094 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12609  4-aminobutyrate aminotransferase  32.45 
 
 
449 aa  187  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.20545  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  29.9 
 
 
427 aa  186  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2136  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  32.23 
 
 
488 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.558173  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  33.88 
 
 
431 aa  186  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  33.74 
 
 
446 aa  186  8e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  34.11 
 
 
431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  33.25 
 
 
436 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  30.75 
 
 
459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  34.8 
 
 
433 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  34.58 
 
 
448 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  29.17 
 
 
454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  32.38 
 
 
427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  28.92 
 
 
454 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1048  aminotransferase class-III  33.84 
 
 
462 aa  184  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1946  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  32.01 
 
 
470 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  32.38 
 
 
427 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  28.92 
 
 
478 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3663  4-aminobutyrate aminotransferase  32.7 
 
 
445 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  28.92 
 
 
454 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  32.76 
 
 
446 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  29.17 
 
 
468 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1640  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  34.99 
 
 
463 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  30.26 
 
 
427 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  29.17 
 
 
454 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  29.41 
 
 
418 aa  183  6e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25640  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  33.98 
 
 
464 aa  183  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.987457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>