More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5409 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4825  aminotransferase class-III  78.12 
 
 		 446 aa  705    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00475157  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5409  aminotransferase class-III  100 
 
 		 452 aa  906    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  67.52 
 
 		 433 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  67.52 
 
 		 433 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  63.57 
 
 		 436 aa  568  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  67.21 
 
 		 433 aa  569  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2675  aminotransferase  66.51 
 
 		 433 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  67.21 
 
 		 433 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  67.21 
 
 		 433 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  67.21 
 
 		 433 aa  571  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3251  aminotransferase class-III  69.62 
 
 		 428 aa  563  1.0000000000000001e-159  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  66.59 
 
 		 432 aa  556  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2878  aminotransferase class-III  69.01 
 
 		 434 aa  555  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19268  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5803  aminotransferase class-III  64.72 
 
 		 433 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2046  aminotransferase class-III  66.04 
 
 		 433 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000254153 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  62.38 
 
 		 451 aa  536  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0839  aminotransferase  56.4 
 
 		 445 aa  526  1e-148  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.33368  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07656  conserved hypothetical protein  52.46 
 
 		 452 aa  483  1e-135  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.346872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1466  aminotransferase  68.1 
 
 		 329 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  36.98 
 
 		 440 aa  238  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  33.41 
 
 		 438 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  35.49 
 
 		 439 aa  231  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5339  aminotransferase class-III  37.29 
 
 		 437 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  38.33 
 
 		 418 aa  225  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  34.01 
 
 		 465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  34.42 
 
 		 465 aa  219  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  34.84 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  36.57 
 
 		 437 aa  215  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  32.77 
 
 		 445 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  31.28 
 
 		 452 aa  213  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4493  aminotransferase class-III  37.77 
 
 		 436 aa  212  9e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906001  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  31.73 
 
 		 441 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0034  hypothetical protein  31.96 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  33.25 
 
 		 448 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  33.18 
 
 		 448 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  33.04 
 
 		 434 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  34.74 
 
 		 441 aa  209  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  30.81 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  30.57 
 
 		 454 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  30.81 
 
 		 454 aa  208  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  32.14 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  30.81 
 
 		 478 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  30.81 
 
 		 479 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  35.41 
 
 		 453 aa  208  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  30.81 
 
 		 454 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  30.81 
 
 		 454 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  30.81 
 
 		 454 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  34.14 
 
 		 435 aa  207  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  32.7 
 
 		 436 aa  206  9e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  30.33 
 
 		 454 aa  206  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  32.78 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  30.57 
 
 		 454 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  31.55 
 
 		 445 aa  203  4e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  33.01 
 
 		 427 aa  202  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0158  hypothetical protein  32.29 
 
 		 438 aa  202  7e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  32.39 
 
 		 444 aa  202  8e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  30 
 
 		 454 aa  201  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  33.97 
 
 		 428 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  33.17 
 
 		 430 aa  199  7.999999999999999e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5722  hypothetical protein  33.73 
 
 		 446 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  34.45 
 
 		 448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  32.11 
 
 		 973 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  32.96 
 
 		 439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  33.93 
 
 		 981 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  33.93 
 
 		 981 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  33.56 
 
 		 981 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  32.52 
 
 		 448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  32.52 
 
 		 448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  33.11 
 
 		 450 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  31.21 
 
 		 461 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0564  Acetylornithine transaminase  34.76 
 
 		 461 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.129985 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  34.82 
 
 		 447 aa  196  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  32.52 
 
 		 442 aa  196  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  32.02 
 
 		 474 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  34.52 
 
 		 434 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00920  aminotransferase  31.98 
 
 		 463 aa  194  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  33.26 
 
 		 434 aa  194  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  32.22 
 
 		 456 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2680  4-aminobutyrate aminotransferase  28.71 
 
 		 445 aa  193  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.09 
 
 		 397 aa  193  5e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2626  4-aminobutyrate aminotransferase  28.71 
 
 		 445 aa  193  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.805613  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3092  4-aminobutyrate aminotransferase  31.7 
 
 		 452 aa  193  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.625534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5225  aminotransferase class-III  35.49 
 
 		 427 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  33.66 
 
 		 438 aa  192  8e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0662  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  36.58 
 
 		 462 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00898604  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4054  aminotransferase  35.68 
 
 		 540 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  32.68 
 
 		 427 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  33.25 
 
 		 431 aa  192  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2918  aminotransferase class-III  37.01 
 
 		 435 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.337832  normal  0.0522713 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2159  4-aminobutyrate aminotransferase  29.31 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  31.34 
 
 		 464 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3118  hypothetical protein  33.18 
 
 		 437 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  32.02 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  31.35 
 
 		 448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2583  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  33.18 
 
 		 458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406627  hitchhiker  0.00247951 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  34.8 
 
 		 978 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  31.3 
 
 		 425 aa  190  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  31.4 
 
 		 430 aa  190  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  33.57 
 
 		 446 aa  190  5e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  32.04 
 
 		 432 aa  190  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>