More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5722 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5722  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  898    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0272  aminotransferase class-III  63.68 
 
 		 462 aa  572  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0357  hypothetical protein  64.04 
 
 		 459 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0347  hypothetical protein  64.04 
 
 		 459 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0336  hypothetical protein  64.04 
 
 		 459 aa  561  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  61.68 
 
 		 464 aa  553  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2960  aminotransferase class-III  65.29 
 
 		 457 aa  550  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0599689  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  60.09 
 
 		 464 aa  547  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5776  hypothetical protein  61.95 
 
 		 484 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246423 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1055  hypothetical protein  60.61 
 
 		 463 aa  534  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0447  aminotransferase class-III  58.64 
 
 		 461 aa  524  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  59.27 
 
 		 435 aa  523  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3118  hypothetical protein  58.31 
 
 		 437 aa  502  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24140  aminotransferase  57.21 
 
 		 453 aa  481  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1438  aminotransferase class-III  59.02 
 
 		 444 aa  478  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00920  aminotransferase  56.69 
 
 		 463 aa  471  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0158  hypothetical protein  54.4 
 
 		 438 aa  461  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2572  hypothetical protein  55.86 
 
 		 437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0841  aminotransferase class-III  53.36 
 
 		 440 aa  444  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0034  hypothetical protein  53.74 
 
 		 441 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1417  4-aminobutyrate aminotransferase  51.48 
 
 		 441 aa  441  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  46.99 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  45.73 
 
 		 446 aa  415  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  46.26 
 
 		 448 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  46.26 
 
 		 448 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  41.15 
 
 		 448 aa  351  1e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3443  aminotransferase class-III  40.27 
 
 		 450 aa  352  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000605746  normal  0.17806 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0532  aminotransferase class-III  34.85 
 
 		 444 aa  298  2e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4554  aminotransferase class-III  44.04 
 
 		 428 aa  293  4e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4062  aminotransferase class-III  38.21 
 
 		 443 aa  266  8e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2523  aminotransferase class-III  38.1 
 
 		 443 aa  262  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  37.38 
 
 		 479 aa  260  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  37.79 
 
 		 428 aa  260  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8945  aminotransferase  37.29 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  36.77 
 
 		 449 aa  252  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  41.27 
 
 		 459 aa  250  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41686  predicted protein  35.66 
 
 		 430 aa  248  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  37.65 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  37.65 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  37.65 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  37.7 
 
 		 430 aa  243  6e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  36.77 
 
 		 454 aa  242  9e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  34.57 
 
 		 456 aa  241  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  36.89 
 
 		 468 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  36.22 
 
 		 450 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  36.66 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  36.21 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  36.13 
 
 		 454 aa  237  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  36.19 
 
 		 478 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  39.06 
 
 		 454 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  36.19 
 
 		 454 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  39.46 
 
 		 448 aa  236  6e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  36.19 
 
 		 454 aa  236  8e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  36.19 
 
 		 454 aa  236  8e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  36.95 
 
 		 455 aa  236  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  34.09 
 
 		 450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  37.77 
 
 		 426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  37.53 
 
 		 426 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6480  hypothetical protein  38.8 
 
 		 454 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  34.2 
 
 		 446 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  34.2 
 
 		 446 aa  233  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  34.2 
 
 		 446 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  34.2 
 
 		 446 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  35.7 
 
 		 446 aa  233  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  32.45 
 
 		 449 aa  233  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  35.51 
 
 		 454 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  34.69 
 
 		 446 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  32.13 
 
 		 450 aa  231  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  37.53 
 
 		 452 aa  230  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  34.69 
 
 		 446 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  35.7 
 
 		 462 aa  230  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  35.51 
 
 		 479 aa  230  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  36.55 
 
 		 457 aa  229  6e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  39.12 
 
 		 434 aa  229  6e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  37.99 
 
 		 448 aa  229  9e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  35.75 
 
 		 454 aa  228  1e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  34.8 
 
 		 430 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  34.5 
 
 		 449 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  34.5 
 
 		 449 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  35.38 
 
 		 426 aa  227  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  35.17 
 
 		 449 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  38.9 
 
 		 457 aa  227  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  34.5 
 
 		 449 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  35.28 
 
 		 454 aa  227  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  34.5 
 
 		 449 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  36.49 
 
 		 440 aa  227  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  34.5 
 
 		 449 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  34.5 
 
 		 449 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  34.5 
 
 		 449 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  35.38 
 
 		 426 aa  227  4e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  35.38 
 
 		 426 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  34.48 
 
 		 436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  35.38 
 
 		 426 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  35.15 
 
 		 426 aa  226  9e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  38.68 
 
 		 425 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  37.44 
 
 		 442 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  34.92 
 
 		 426 aa  224  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  34.92 
 
 		 426 aa  224  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  38.56 
 
 		 468 aa  224  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  33.26 
 
 		 443 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>