More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0034 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0034  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  907    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0158  hypothetical protein  70.51 
 
 		 438 aa  644    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1438  aminotransferase class-III  66.2 
 
 		 444 aa  608  1e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24140  aminotransferase  63.91 
 
 		 453 aa  593  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0841  aminotransferase class-III  65.17 
 
 		 440 aa  582  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2572  hypothetical protein  62.68 
 
 		 437 aa  542  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1417  4-aminobutyrate aminotransferase  59.67 
 
 		 441 aa  542  1e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0272  aminotransferase class-III  62.56 
 
 		 462 aa  528  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  61.05 
 
 		 435 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0447  aminotransferase class-III  59.63 
 
 		 461 aa  506  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1055  hypothetical protein  59.81 
 
 		 463 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0336  hypothetical protein  60.47 
 
 		 459 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0347  hypothetical protein  60.47 
 
 		 459 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0357  hypothetical protein  60.47 
 
 		 459 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  57.14 
 
 		 464 aa  487  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5776  hypothetical protein  58.45 
 
 		 484 aa  488  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246423 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  56.91 
 
 		 464 aa  478  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2960  aminotransferase class-III  53.27 
 
 		 457 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0599689  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00920  aminotransferase  53 
 
 		 463 aa  433  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5722  hypothetical protein  53.74 
 
 		 446 aa  420  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3118  hypothetical protein  50.12 
 
 		 437 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  46.15 
 
 		 444 aa  387  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  45.93 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3443  aminotransferase class-III  38.6 
 
 		 450 aa  335  5.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000605746  normal  0.17806 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  44.03 
 
 		 448 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  44.03 
 
 		 448 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  39.82 
 
 		 448 aa  319  7.999999999999999e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0532  aminotransferase class-III  33.41 
 
 		 444 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4554  aminotransferase class-III  37.32 
 
 		 428 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  37.05 
 
 		 454 aa  251  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0051  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  33.92 
 
 		 470 aa  247  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  34.78 
 
 		 465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  34.19 
 
 		 474 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  35.12 
 
 		 457 aa  242  9e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  35.97 
 
 		 450 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41686  predicted protein  34.21 
 
 		 430 aa  236  5.0000000000000005e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  33.71 
 
 		 449 aa  236  6e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2523  aminotransferase class-III  33.33 
 
 		 443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6644  hypothetical protein  34.14 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  35.09 
 
 		 479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  33.7 
 
 		 465 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  34.38 
 
 		 459 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  33.71 
 
 		 458 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  34.55 
 
 		 457 aa  230  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  34.92 
 
 		 457 aa  229  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  33.85 
 
 		 456 aa  229  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2972  aminotransferase class-III  32.54 
 
 		 460 aa  229  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.121159 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6140  hypothetical protein  34.35 
 
 		 464 aa  229  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0159356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2602  aminotransferase class-III  32.1 
 
 		 459 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0943  aminotransferase  32.1 
 
 		 460 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434836  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  33.84 
 
 		 467 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6024  hypothetical protein  33.92 
 
 		 464 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  34.61 
 
 		 459 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4273  aminotransferase class-III  32.37 
 
 		 459 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5780  hypothetical protein  33.48 
 
 		 464 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5799  hypothetical protein  33.26 
 
 		 464 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267871  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6163  hypothetical protein  33.26 
 
 		 464 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  33.77 
 
 		 468 aa  225  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  33.12 
 
 		 457 aa  225  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  36.43 
 
 		 431 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4062  aminotransferase class-III  32.85 
 
 		 443 aa  223  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3858  hypothetical protein  31.96 
 
 		 469 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  34.26 
 
 		 463 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  34.37 
 
 		 451 aa  223  6e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  31.13 
 
 		 463 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  35.25 
 
 		 428 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8945  aminotransferase  36.25 
 
 		 412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  32.1 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  37.18 
 
 		 442 aa  221  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  35.04 
 
 		 440 aa  220  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  33.19 
 
 		 463 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  34.01 
 
 		 459 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0218  aminotransferase class-III  31.49 
 
 		 452 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  36.79 
 
 		 433 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  31.91 
 
 		 460 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  34.19 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3854  hypothetical protein  34.88 
 
 		 447 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.293116 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07656  conserved hypothetical protein  32.3 
 
 		 452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.346872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  33.26 
 
 		 437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  36.19 
 
 		 442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  31.41 
 
 		 460 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  33.65 
 
 		 448 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  33.96 
 
 		 446 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  32.56 
 
 		 430 aa  216  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  33.72 
 
 		 446 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  33.72 
 
 		 446 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  33.96 
 
 		 446 aa  216  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  33.72 
 
 		 446 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3095  aminotransferase class-III  32.24 
 
 		 459 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  32.24 
 
 		 441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0516  aminotransferase class-III  33.87 
 
 		 459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0984655 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  34.06 
 
 		 446 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  34.85 
 
 		 451 aa  213  7e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  34.99 
 
 		 454 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2945  aminotransferase class-III  31.02 
 
 		 455 aa  212  9e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0260997  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  31.59 
 
 		 449 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3718  hypothetical protein  32.6 
 
 		 455 aa  212  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.072939 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  33.48 
 
 		 457 aa  212  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  31.74 
 
 		 449 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  31.59 
 
 		 450 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>