More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0357 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  79.82 
 
 
464 aa  760    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5776  hypothetical protein  83.55 
 
 
484 aa  761    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.246423 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  79.44 
 
 
464 aa  759    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0357  hypothetical protein  100 
 
 
459 aa  938    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0336  hypothetical protein  99.56 
 
 
459 aa  935    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  71.2 
 
 
435 aa  648    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0347  hypothetical protein  100 
 
 
459 aa  938    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0447  aminotransferase class-III  73.85 
 
 
461 aa  699    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1055  hypothetical protein  84.04 
 
 
463 aa  773    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0272  aminotransferase class-III  67.26 
 
 
462 aa  632  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2960  aminotransferase class-III  64.2 
 
 
457 aa  567  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0599689  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1438  aminotransferase class-III  63.57 
 
 
444 aa  553  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5722  hypothetical protein  63.1 
 
 
446 aa  549  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00920  aminotransferase  60.36 
 
 
463 aa  537  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24140  aminotransferase  61.38 
 
 
453 aa  529  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3118  hypothetical protein  60 
 
 
437 aa  528  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0841  aminotransferase class-III  61.77 
 
 
440 aa  522  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0158  hypothetical protein  59.95 
 
 
438 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0034  hypothetical protein  60.33 
 
 
441 aa  512  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2572  hypothetical protein  61.97 
 
 
437 aa  514  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1417  4-aminobutyrate aminotransferase  56.15 
 
 
441 aa  498  1e-140  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  43.85 
 
 
444 aa  399  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  42.69 
 
 
446 aa  392  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3443  aminotransferase class-III  40.28 
 
 
450 aa  358  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000605746  normal  0.17806 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  44.65 
 
 
448 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  44.65 
 
 
448 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  39 
 
 
448 aa  341  2e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0532  aminotransferase class-III  34.4 
 
 
444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410218  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4062  aminotransferase class-III  37.62 
 
 
443 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41686  predicted protein  36.36 
 
 
430 aa  267  2.9999999999999995e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2523  aminotransferase class-III  36.6 
 
 
443 aa  260  4e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4554  aminotransferase class-III  39.12 
 
 
428 aa  260  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8945  aminotransferase  36.06 
 
 
412 aa  246  8e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  35.02 
 
 
455 aa  242  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  36.47 
 
 
446 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  34.17 
 
 
454 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  36.23 
 
 
446 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  36.23 
 
 
446 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  36.23 
 
 
446 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  36.65 
 
 
446 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  39.59 
 
 
442 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  34.83 
 
 
449 aa  236  6e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  33.11 
 
 
450 aa  236  7e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  36.17 
 
 
446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  34.76 
 
 
459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  37.39 
 
 
442 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  36.04 
 
 
457 aa  233  5e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  36.47 
 
 
446 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  33.57 
 
 
428 aa  232  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  32.67 
 
 
456 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  36.28 
 
 
448 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  34.51 
 
 
479 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  36.28 
 
 
448 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  36.28 
 
 
448 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  32.45 
 
 
463 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  33.19 
 
 
466 aa  230  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  35.31 
 
 
449 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  35.31 
 
 
449 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  35.31 
 
 
449 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  35.31 
 
 
449 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  35.31 
 
 
449 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  35.31 
 
 
449 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  31.72 
 
 
474 aa  229  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  35.15 
 
 
449 aa  228  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  33.64 
 
 
441 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  35.07 
 
 
426 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  35.07 
 
 
426 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  33.56 
 
 
456 aa  226  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  35.07 
 
 
449 aa  226  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  32.73 
 
 
454 aa  225  1e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  35.53 
 
 
454 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  31.79 
 
 
460 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  31.45 
 
 
450 aa  225  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  33.41 
 
 
430 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  35.25 
 
 
436 aa  224  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  31.9 
 
 
450 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  33.33 
 
 
457 aa  224  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  33.73 
 
 
448 aa  223  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  34.68 
 
 
451 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0051  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  32.74 
 
 
470 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  32.97 
 
 
452 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6480  hypothetical protein  35.31 
 
 
454 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  35.19 
 
 
458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3177  hypothetical protein  35.88 
 
 
467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.060239  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  34.98 
 
 
440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  34.99 
 
 
460 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  35.9 
 
 
457 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  33.49 
 
 
456 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  33.7 
 
 
460 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  33.49 
 
 
456 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3534  hypothetical protein  35.65 
 
 
467 aa  220  5e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.631271  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  32.94 
 
 
437 aa  219  7.999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  33.49 
 
 
452 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  33.03 
 
 
443 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2835  hypothetical protein  34.61 
 
 
467 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.561415  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  36.8 
 
 
442 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  31.6 
 
 
459 aa  218  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  33.88 
 
 
451 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  32.49 
 
 
449 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  32.3 
 
 
457 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>