More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0272 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0272  aminotransferase class-III  100 
 
 		 462 aa  949    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  65.03 
 
 		 464 aa  609  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0336  hypothetical protein  68.81 
 
 		 459 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5776  hypothetical protein  68.66 
 
 		 484 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246423 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1055  hypothetical protein  67.76 
 
 		 463 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0347  hypothetical protein  68.58 
 
 		 459 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0357  hypothetical protein  68.58 
 
 		 459 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  63.88 
 
 		 464 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  66.44 
 
 		 435 aa  593  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0447  aminotransferase class-III  62.58 
 
 		 461 aa  587  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2960  aminotransferase class-III  64.61 
 
 		 457 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0599689  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5722  hypothetical protein  63.68 
 
 		 446 aa  541  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3118  hypothetical protein  58.8 
 
 		 437 aa  532  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0034  hypothetical protein  62.56 
 
 		 441 aa  528  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1438  aminotransferase class-III  61.93 
 
 		 444 aa  530  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0841  aminotransferase class-III  59.59 
 
 		 440 aa  523  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0158  hypothetical protein  60.28 
 
 		 438 aa  514  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24140  aminotransferase  58.76 
 
 		 453 aa  504  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2572  hypothetical protein  59.57 
 
 		 437 aa  491  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00920  aminotransferase  55.36 
 
 		 463 aa  475  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1417  4-aminobutyrate aminotransferase  53.26 
 
 		 441 aa  466  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  44.84 
 
 		 446 aa  409  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  44.39 
 
 		 444 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3443  aminotransferase class-III  41.35 
 
 		 450 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000605746  normal  0.17806 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  45.94 
 
 		 448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  45.94 
 
 		 448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  39.5 
 
 		 448 aa  324  2e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0532  aminotransferase class-III  34.55 
 
 		 444 aa  288  1e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410218  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4062  aminotransferase class-III  39.04 
 
 		 443 aa  269  7e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4554  aminotransferase class-III  36.07 
 
 		 428 aa  268  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2523  aminotransferase class-III  36.43 
 
 		 443 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41686  predicted protein  36.02 
 
 		 430 aa  246  6e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  35.18 
 
 		 454 aa  242  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  38.75 
 
 		 459 aa  238  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  34.07 
 
 		 450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  38.3 
 
 		 442 aa  234  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  35.36 
 
 		 426 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  34.55 
 
 		 428 aa  233  7.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  36.3 
 
 		 448 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  36.3 
 
 		 448 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  36.01 
 
 		 448 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  35.13 
 
 		 426 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  34.4 
 
 		 446 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8945  aminotransferase  35.41 
 
 		 412 aa  229  1e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  32.27 
 
 		 479 aa  227  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  34.17 
 
 		 446 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  34.17 
 
 		 446 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  34.17 
 
 		 446 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  36.87 
 
 		 442 aa  227  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  35.84 
 
 		 454 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  34.73 
 
 		 446 aa  226  7e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  38.92 
 
 		 464 aa  226  9e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  34.29 
 
 		 451 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  34.25 
 
 		 446 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6480  hypothetical protein  35.62 
 
 		 454 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  34.78 
 
 		 446 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  33.65 
 
 		 430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  35.19 
 
 		 440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  36.61 
 
 		 454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2600  aminotransferase class-III  39.34 
 
 		 464 aa  219  7e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  35.32 
 
 		 468 aa  219  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  32.29 
 
 		 443 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  36.81 
 
 		 454 aa  218  1e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  34.87 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  36.52 
 
 		 463 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  34.19 
 
 		 448 aa  217  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  34.34 
 
 		 451 aa  216  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  36.54 
 
 		 448 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  32.72 
 
 		 437 aa  215  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  34.04 
 
 		 425 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  33.03 
 
 		 456 aa  215  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  33.12 
 
 		 466 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  34.65 
 
 		 462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  36.22 
 
 		 444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  31.83 
 
 		 441 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  34 
 
 		 457 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  36.22 
 
 		 441 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  37.57 
 
 		 448 aa  213  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  33.76 
 
 		 452 aa  213  7e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  33.88 
 
 		 449 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  33.88 
 
 		 449 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  33.88 
 
 		 449 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  33.88 
 
 		 449 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  33.88 
 
 		 449 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  33.8 
 
 		 425 aa  213  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  37.53 
 
 		 460 aa  212  9e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  33.8 
 
 		 425 aa  213  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  33.57 
 
 		 430 aa  212  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  35.42 
 
 		 456 aa  212  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  33.88 
 
 		 449 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  32.46 
 
 		 449 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  31.58 
 
 		 463 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  33.88 
 
 		 449 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  33.64 
 
 		 449 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  32.46 
 
 		 449 aa  211  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  32.63 
 
 		 426 aa  210  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  37.5 
 
 		 478 aa  210  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  31.57 
 
 		 457 aa  210  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  34.26 
 
 		 444 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  34.59 
 
 		 448 aa  210  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>