More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0447 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  73.74 
 
 		 464 aa  702    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0447  aminotransferase class-III  100 
 
 		 461 aa  943    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0336  hypothetical protein  74.29 
 
 		 459 aa  669    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  74.84 
 
 		 464 aa  711    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0357  hypothetical protein  73.85 
 
 		 459 aa  666    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5776  hypothetical protein  73.64 
 
 		 484 aa  670    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246423 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1055  hypothetical protein  73.78 
 
 		 463 aa  679    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0347  hypothetical protein  73.85 
 
 		 459 aa  666    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  65.38 
 
 		 435 aa  590  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0272  aminotransferase class-III  62.58 
 
 		 462 aa  587  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00920  aminotransferase  60.98 
 
 		 463 aa  551  1e-155  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2960  aminotransferase class-III  60.96 
 
 		 457 aa  544  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0599689  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0841  aminotransferase class-III  60.55 
 
 		 440 aa  528  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1438  aminotransferase class-III  58.93 
 
 		 444 aa  520  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24140  aminotransferase  59.5 
 
 		 453 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0034  hypothetical protein  59.63 
 
 		 441 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0158  hypothetical protein  58.8 
 
 		 438 aa  504  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5722  hypothetical protein  58.41 
 
 		 446 aa  502  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3118  hypothetical protein  57.24 
 
 		 437 aa  504  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2572  hypothetical protein  58.1 
 
 		 437 aa  479  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1417  4-aminobutyrate aminotransferase  53.21 
 
 		 441 aa  478  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  44.8 
 
 		 444 aa  397  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  43.54 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3443  aminotransferase class-III  41.1 
 
 		 450 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000605746  normal  0.17806 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  43.32 
 
 		 448 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  43.32 
 
 		 448 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  39.18 
 
 		 448 aa  323  3e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0532  aminotransferase class-III  34.17 
 
 		 444 aa  266  5.999999999999999e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410218  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41686  predicted protein  36.18 
 
 		 430 aa  248  1e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2523  aminotransferase class-III  35.68 
 
 		 443 aa  247  3e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4554  aminotransferase class-III  35.79 
 
 		 428 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  35.88 
 
 		 479 aa  243  7.999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4062  aminotransferase class-III  35.27 
 
 		 443 aa  239  6.999999999999999e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8945  aminotransferase  36.47 
 
 		 412 aa  237  3e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  34.66 
 
 		 454 aa  236  7e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  35.54 
 
 		 459 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  34.05 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  34.97 
 
 		 430 aa  231  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  33.33 
 
 		 463 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  34.8 
 
 		 446 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  34.29 
 
 		 457 aa  229  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  35.49 
 
 		 451 aa  229  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  34.57 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  34.16 
 
 		 450 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  34.43 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  34.57 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  34.8 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  34.57 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  34.57 
 
 		 446 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  34.25 
 
 		 449 aa  227  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  35.43 
 
 		 455 aa  227  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  35.9 
 
 		 457 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  35 
 
 		 448 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  35 
 
 		 448 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  34.84 
 
 		 449 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  34.84 
 
 		 449 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  34.84 
 
 		 449 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  34.84 
 
 		 449 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  34.84 
 
 		 449 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  34.84 
 
 		 449 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  34.38 
 
 		 449 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  34.91 
 
 		 454 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  33.12 
 
 		 474 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  34.91 
 
 		 468 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  32.96 
 
 		 456 aa  223  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  34.43 
 
 		 454 aa  223  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  34.52 
 
 		 448 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  34.43 
 
 		 478 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  34.43 
 
 		 454 aa  223  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  37.26 
 
 		 448 aa  223  7e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  34.43 
 
 		 454 aa  223  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2691  hypothetical protein  34.52 
 
 		 457 aa  223  8e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  34.1 
 
 		 428 aa  223  8e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  33.48 
 
 		 458 aa  222  9e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  35.06 
 
 		 444 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  34.6 
 
 		 454 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  34.2 
 
 		 454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  34.76 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  34.61 
 
 		 449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  35.41 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  34.35 
 
 		 479 aa  221  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  34.3 
 
 		 454 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  33.72 
 
 		 448 aa  219  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  36.75 
 
 		 445 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  37.03 
 
 		 464 aa  219  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  34.59 
 
 		 426 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  34.13 
 
 		 454 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6480  hypothetical protein  34.07 
 
 		 454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  31.92 
 
 		 466 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  34.59 
 
 		 426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  33.8 
 
 		 441 aa  217  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  31.71 
 
 		 454 aa  217  4e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  34.79 
 
 		 443 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  31.81 
 
 		 437 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  33.88 
 
 		 454 aa  216  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  33.33 
 
 		 459 aa  216  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  32.53 
 
 		 460 aa  216  9e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  33.03 
 
 		 459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  34.2 
 
 		 436 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  34.12 
 
 		 440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>