More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_24140 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_24140  aminotransferase  100 
 
 		 453 aa  914    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1438  aminotransferase class-III  73.39 
 
 		 444 aa  651    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0841  aminotransferase class-III  70.19 
 
 		 440 aa  610  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2572  hypothetical protein  72.62 
 
 		 437 aa  606  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0034  hypothetical protein  63.91 
 
 		 441 aa  593  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0158  hypothetical protein  66.82 
 
 		 438 aa  589  1e-167  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1417  4-aminobutyrate aminotransferase  61.7 
 
 		 441 aa  547  1e-154  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  63.76 
 
 		 435 aa  542  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  59.82 
 
 		 464 aa  528  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  60.09 
 
 		 464 aa  528  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1055  hypothetical protein  61.7 
 
 		 463 aa  524  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0447  aminotransferase class-III  59.5 
 
 		 461 aa  515  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0336  hypothetical protein  61.57 
 
 		 459 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0357  hypothetical protein  61.34 
 
 		 459 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0347  hypothetical protein  61.34 
 
 		 459 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5776  hypothetical protein  61.02 
 
 		 484 aa  510  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0272  aminotransferase class-III  58.76 
 
 		 462 aa  504  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2960  aminotransferase class-III  58.41 
 
 		 457 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0599689  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5722  hypothetical protein  57.21 
 
 		 446 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00920  aminotransferase  55.63 
 
 		 463 aa  450  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3118  hypothetical protein  54.37 
 
 		 437 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  41.72 
 
 		 444 aa  346  4e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  41.53 
 
 		 446 aa  342  8e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  45.27 
 
 		 448 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  45.27 
 
 		 448 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3443  aminotransferase class-III  39 
 
 		 450 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000605746  normal  0.17806 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  38.76 
 
 		 448 aa  298  2e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0532  aminotransferase class-III  32.04 
 
 		 444 aa  263  6e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4554  aminotransferase class-III  42.86 
 
 		 428 aa  254  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4062  aminotransferase class-III  36.52 
 
 		 443 aa  249  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2523  aminotransferase class-III  35.73 
 
 		 443 aa  248  1e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  36.6 
 
 		 459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  36.28 
 
 		 456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  36.53 
 
 		 428 aa  234  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  36.55 
 
 		 454 aa  232  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  36.45 
 
 		 448 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  36.45 
 
 		 448 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  36.21 
 
 		 448 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41686  predicted protein  34.69 
 
 		 430 aa  229  9e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  36.36 
 
 		 450 aa  229  9e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  36.61 
 
 		 457 aa  229  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  33.33 
 
 		 474 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  34.96 
 
 		 446 aa  227  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  34.1 
 
 		 479 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  35.1 
 
 		 449 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  35.1 
 
 		 449 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  35.1 
 
 		 449 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  35.1 
 
 		 449 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  35.1 
 
 		 449 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  35.1 
 
 		 449 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  33.65 
 
 		 446 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  35.1 
 
 		 449 aa  224  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  35.48 
 
 		 451 aa  223  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  35.09 
 
 		 445 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  33.65 
 
 		 446 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  33.65 
 
 		 446 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  33.65 
 
 		 446 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  33.71 
 
 		 450 aa  223  8e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  34.87 
 
 		 437 aa  223  8e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  34.47 
 
 		 446 aa  223  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  35.15 
 
 		 451 aa  222  9e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  34.37 
 
 		 453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  31.76 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  34.86 
 
 		 449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  34.37 
 
 		 453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  34.86 
 
 		 446 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  34.13 
 
 		 453 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  36.72 
 
 		 440 aa  219  8.999999999999998e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  32.37 
 
 		 463 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  33.41 
 
 		 465 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1166  hypothetical protein  34.08 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41749  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0051  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  31.86 
 
 		 470 aa  218  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  33.56 
 
 		 449 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  37.47 
 
 		 447 aa  217  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  35.41 
 
 		 464 aa  217  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  33.8 
 
 		 448 aa  216  8e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  33.65 
 
 		 453 aa  216  9e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  33.11 
 
 		 452 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  33.17 
 
 		 455 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  32.94 
 
 		 454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  34.88 
 
 		 444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  33.17 
 
 		 445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2145  hypothetical protein  32 
 
 		 465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.456692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  36.47 
 
 		 443 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8945  aminotransferase  35.87 
 
 		 412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  35.09 
 
 		 430 aa  214  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  32.82 
 
 		 463 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  35.28 
 
 		 443 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  35.05 
 
 		 444 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  35.05 
 
 		 444 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  32.82 
 
 		 460 aa  213  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  33.94 
 
 		 459 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0344  hypothetical protein  34.23 
 
 		 441 aa  213  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  34.23 
 
 		 463 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4437  hypothetical protein  33.63 
 
 		 451 aa  213  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691941  normal  0.936595 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  32.18 
 
 		 450 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  34.63 
 
 		 444 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  35.21 
 
 		 427 aa  212  9e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  35.71 
 
 		 444 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  34.83 
 
 		 455 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>