More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4554 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4554  aminotransferase class-III  100 
 
 		 428 aa  859    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  42.96 
 
 		 444 aa  360  3e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  41.5 
 
 		 446 aa  353  2.9999999999999997e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3443  aminotransferase class-III  38.8 
 
 		 450 aa  320  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000605746  normal  0.17806 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  39.08 
 
 		 448 aa  307  3e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5722  hypothetical protein  40.37 
 
 		 446 aa  289  6e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  42.03 
 
 		 464 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2960  aminotransferase class-III  41.91 
 
 		 457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0599689  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  42.03 
 
 		 464 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0272  aminotransferase class-III  36.64 
 
 		 462 aa  275  8e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0158  hypothetical protein  39.53 
 
 		 438 aa  275  9e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1055  hypothetical protein  39.34 
 
 		 463 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2572  hypothetical protein  44.64 
 
 		 437 aa  272  8.000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3118  hypothetical protein  39.53 
 
 		 437 aa  270  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0841  aminotransferase class-III  40.81 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1438  aminotransferase class-III  43.92 
 
 		 444 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0034  hypothetical protein  37.56 
 
 		 441 aa  267  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  39.95 
 
 		 448 aa  266  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  39.95 
 
 		 448 aa  266  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5776  hypothetical protein  35.96 
 
 		 484 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246423 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24140  aminotransferase  39.44 
 
 		 453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1417  4-aminobutyrate aminotransferase  36.13 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  36.56 
 
 		 435 aa  253  5.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0532  aminotransferase class-III  31.8 
 
 		 444 aa  253  6e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410218  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0336  hypothetical protein  35.73 
 
 		 459 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0357  hypothetical protein  35.73 
 
 		 459 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0347  hypothetical protein  35.73 
 
 		 459 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0447  aminotransferase class-III  35.79 
 
 		 461 aa  246  4e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  36.15 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  35.38 
 
 		 446 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  35.38 
 
 		 446 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  35.38 
 
 		 446 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  35.14 
 
 		 446 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  35.61 
 
 		 446 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  34.98 
 
 		 449 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  34.98 
 
 		 449 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  34.98 
 
 		 449 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  34.98 
 
 		 449 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  34.98 
 
 		 449 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  35.61 
 
 		 446 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  34.98 
 
 		 449 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  34.98 
 
 		 449 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  35.21 
 
 		 449 aa  239  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  38.98 
 
 		 457 aa  233  6e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  35.42 
 
 		 448 aa  233  7.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00920  aminotransferase  36.34 
 
 		 463 aa  230  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  36.16 
 
 		 456 aa  227  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7631  omega amino acid--pyruvate transaminase  38.58 
 
 		 445 aa  224  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3410  beta alanine--pyruvate transaminase  36.59 
 
 		 441 aa  224  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1370  beta alanine--pyruvate transaminase  35.91 
 
 		 448 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424959  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2709  beta alanine--pyruvate transaminase  35.81 
 
 		 443 aa  221  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0655117  normal  0.245576 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2042  beta alanine--pyruvate transaminase  35 
 
 		 441 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  34.99 
 
 		 436 aa  220  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1898  beta alanine--pyruvate transaminase  36.34 
 
 		 435 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422888  normal  0.144142 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  37.7 
 
 		 448 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  37.7 
 
 		 448 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  35.39 
 
 		 454 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0894  beta alanine--pyruvate transaminase  36.15 
 
 		 447 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1742  beta alanine--pyruvate transaminase  35.99 
 
 		 441 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  37.7 
 
 		 448 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2523  aminotransferase class-III  35.23 
 
 		 443 aa  217  4e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  35.02 
 
 		 428 aa  217  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  36.01 
 
 		 454 aa  216  7e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  32.85 
 
 		 437 aa  215  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  36.16 
 
 		 479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  32.94 
 
 		 443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  42.06 
 
 		 459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0229  beta alanine--pyruvate transaminase  34.71 
 
 		 437 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.946492  normal  0.224107 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0926  beta alanine--pyruvate transaminase  34.53 
 
 		 442 aa  213  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3157  beta alanine--pyruvate transaminase  34.35 
 
 		 445 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381748  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3287  omega amino acid--pyruvate transaminase  34.49 
 
 		 445 aa  212  9e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0765  beta alanine--pyruvate transaminase  36.49 
 
 		 445 aa  212  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1456  beta alanine--pyruvate transaminase  34.71 
 
 		 445 aa  212  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.736746  normal  0.822879 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1366  beta alanine--pyruvate transaminase  33.49 
 
 		 441 aa  212  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.528214 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1460  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  37.17 
 
 		 448 aa  212  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269921  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1294  beta alanine--pyruvate transaminase  34.71 
 
 		 445 aa  212  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4833  beta alanine--pyruvate transaminase  33.79 
 
 		 444 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318992  normal  0.116227 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2537  beta alanine--pyruvate transaminase  35.39 
 
 		 445 aa  211  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6089  omega amino acid--pyruvate transaminase  34.32 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1092  beta alanine--pyruvate transaminase  33.49 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00103831  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  36.73 
 
 		 442 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3162  beta alanine--pyruvate transaminase  34.16 
 
 		 445 aa  211  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1078  beta alanine--pyruvate transaminase  35.31 
 
 		 444 aa  210  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3898  beta alanine--pyruvate transaminase  34.03 
 
 		 444 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1186  beta alanine--pyruvate transaminase  33.49 
 
 		 454 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0383535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3203  beta alanine--pyruvate transaminase  33.49 
 
 		 454 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70160  omega amino acid--pyruvate transaminase  34.55 
 
 		 444 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1184  beta alanine--pyruvate transaminase  35.1 
 
 		 448 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0905648 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2317  omega amino acid--pyruvate transaminase  34.03 
 
 		 442 aa  209  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414372  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1152  beta alanine--pyruvate transaminase  33.26 
 
 		 454 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0463634  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  34.42 
 
 		 450 aa  209  9e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1002  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  34.38 
 
 		 491 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1084  beta alanine--pyruvate transaminase  33.49 
 
 		 445 aa  208  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000566845  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1722  beta alanine--pyruvate transaminase  34.26 
 
 		 447 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899211  normal  0.216023 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  33.57 
 
 		 450 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  34.22 
 
 		 450 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  35.98 
 
 		 450 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  35.98 
 
 		 450 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  35.98 
 
 		 449 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  35.98 
 
 		 449 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>