More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3443 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3443  aminotransferase class-III  100 
 
 
450 aa  940    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000605746  normal  0.17806 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  53.65 
 
 
444 aa  495  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  52.74 
 
 
446 aa  491  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0272  aminotransferase class-III  41.35 
 
 
462 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  41.74 
 
 
464 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  41.51 
 
 
464 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0447  aminotransferase class-III  41.1 
 
 
461 aa  368  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1438  aminotransferase class-III  40.9 
 
 
444 aa  350  2e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0357  hypothetical protein  40.28 
 
 
459 aa  348  9e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0347  hypothetical protein  40.28 
 
 
459 aa  348  9e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0336  hypothetical protein  40.28 
 
 
459 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  41.15 
 
 
435 aa  347  3e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1055  hypothetical protein  40.05 
 
 
463 aa  344  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3118  hypothetical protein  40.83 
 
 
437 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5776  hypothetical protein  40.7 
 
 
484 aa  342  9e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.246423 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0158  hypothetical protein  40.28 
 
 
438 aa  342  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2960  aminotransferase class-III  39.04 
 
 
457 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0599689  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  39.86 
 
 
448 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0034  hypothetical protein  38.6 
 
 
441 aa  335  7e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5722  hypothetical protein  40.27 
 
 
446 aa  334  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0841  aminotransferase class-III  38.76 
 
 
440 aa  334  2e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  40.32 
 
 
448 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  40.32 
 
 
448 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24140  aminotransferase  39.95 
 
 
453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2572  hypothetical protein  39.95 
 
 
437 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1417  4-aminobutyrate aminotransferase  38.93 
 
 
441 aa  312  7.999999999999999e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0532  aminotransferase class-III  37.27 
 
 
444 aa  312  9e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4554  aminotransferase class-III  38.42 
 
 
428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00920  aminotransferase  36.57 
 
 
463 aa  302  8.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  38.39 
 
 
479 aa  292  9e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4062  aminotransferase class-III  36.06 
 
 
443 aa  267  4e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  34.88 
 
 
456 aa  264  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  36.47 
 
 
449 aa  256  5e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  36.26 
 
 
454 aa  256  7e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  36.89 
 
 
437 aa  254  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  36.93 
 
 
444 aa  254  3e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  36.47 
 
 
459 aa  251  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2523  aminotransferase class-III  33.49 
 
 
443 aa  250  4e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  33.79 
 
 
446 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  34.94 
 
 
428 aa  250  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  33.79 
 
 
446 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  33.79 
 
 
446 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  33.79 
 
 
446 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  33.79 
 
 
446 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  34.98 
 
 
450 aa  247  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  35.65 
 
 
448 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  35.65 
 
 
448 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  35.65 
 
 
448 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  36.54 
 
 
442 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  33.33 
 
 
446 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  33.11 
 
 
446 aa  243  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  34.26 
 
 
443 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1002  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  33.41 
 
 
491 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  34.74 
 
 
454 aa  241  2e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  34.66 
 
 
451 aa  241  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  35.93 
 
 
441 aa  239  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8945  aminotransferase  35.73 
 
 
412 aa  239  9e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4329  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  32.44 
 
 
446 aa  239  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656375  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  32.11 
 
 
436 aa  237  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2275  hypothetical protein  32.78 
 
 
436 aa  237  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  36.91 
 
 
457 aa  236  6e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  32.78 
 
 
449 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3048  hypothetical protein  32.54 
 
 
436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  35.92 
 
 
448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4833  beta alanine--pyruvate transaminase  34.28 
 
 
444 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318992  normal  0.116227 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  32.71 
 
 
449 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2656  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  35.01 
 
 
459 aa  234  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  35.46 
 
 
462 aa  233  6e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  32.47 
 
 
449 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  32.47 
 
 
449 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  32.47 
 
 
449 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  32.47 
 
 
449 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  32.47 
 
 
449 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  32.71 
 
 
449 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  35.51 
 
 
450 aa  232  9e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  35.51 
 
 
450 aa  232  9e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  35.51 
 
 
449 aa  232  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  32.52 
 
 
467 aa  232  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2139  hypothetical protein  32.3 
 
 
436 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  35.51 
 
 
449 aa  232  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2077  hypothetical protein  32.3 
 
 
436 aa  232  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  35.51 
 
 
449 aa  232  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2073  hypothetical protein  32.3 
 
 
436 aa  232  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2294  hypothetical protein  32.3 
 
 
436 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2319  hypothetical protein  32.3 
 
 
436 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  33.33 
 
 
461 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2328  hypothetical protein  32.3 
 
 
436 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000223994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  35.9 
 
 
454 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  35.51 
 
 
449 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  35.9 
 
 
454 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  35.51 
 
 
450 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2402  hypothetical protein  32.3 
 
 
436 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  36.38 
 
 
448 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  33.33 
 
 
461 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  37.5 
 
 
460 aa  230  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  33.33 
 
 
461 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  33.65 
 
 
460 aa  230  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1331  aminotransferase  35.21 
 
 
451 aa  230  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1460  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  33.18 
 
 
448 aa  229  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269921  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  34.74 
 
 
456 aa  230  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>