More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1417 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1417  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 
441 aa  918    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1438  aminotransferase class-III  60.97 
 
 
444 aa  549  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24140  aminotransferase  61.7 
 
 
453 aa  546  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0034  hypothetical protein  59.67 
 
 
441 aa  542  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0158  hypothetical protein  59.91 
 
 
438 aa  521  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0841  aminotransferase class-III  59.34 
 
 
440 aa  518  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2572  hypothetical protein  57.21 
 
 
437 aa  504  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1055  hypothetical protein  56.94 
 
 
463 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  56.47 
 
 
435 aa  491  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0336  hypothetical protein  56.31 
 
 
459 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0347  hypothetical protein  56.07 
 
 
459 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0357  hypothetical protein  56.07 
 
 
459 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  53.38 
 
 
464 aa  480  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0447  aminotransferase class-III  53.21 
 
 
461 aa  478  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  53.38 
 
 
464 aa  475  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5776  hypothetical protein  55.12 
 
 
484 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.246423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0272  aminotransferase class-III  53.26 
 
 
462 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00920  aminotransferase  52.67 
 
 
463 aa  441  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2960  aminotransferase class-III  52.33 
 
 
457 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0599689  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5722  hypothetical protein  51.48 
 
 
446 aa  420  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3118  hypothetical protein  48.36 
 
 
437 aa  410  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  43.53 
 
 
444 aa  360  3e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  43.06 
 
 
446 aa  355  8.999999999999999e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3443  aminotransferase class-III  38.93 
 
 
450 aa  312  7.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000605746  normal  0.17806 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  40.47 
 
 
448 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  40.47 
 
 
448 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  35.57 
 
 
448 aa  285  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0532  aminotransferase class-III  36.73 
 
 
444 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4554  aminotransferase class-III  36.28 
 
 
428 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  33.8 
 
 
448 aa  233  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  35.87 
 
 
457 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  34.17 
 
 
479 aa  232  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4062  aminotransferase class-III  35.38 
 
 
443 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  36.12 
 
 
454 aa  230  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  32.82 
 
 
450 aa  226  8e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  35.93 
 
 
450 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4273  aminotransferase class-III  34.23 
 
 
459 aa  225  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  34.2 
 
 
440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  32.01 
 
 
450 aa  221  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2972  aminotransferase class-III  33.33 
 
 
460 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.121159 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41686  predicted protein  34.35 
 
 
430 aa  220  3.9999999999999997e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  35.33 
 
 
457 aa  219  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  32.33 
 
 
450 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  32.09 
 
 
450 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  32.33 
 
 
449 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  32.33 
 
 
449 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  32.72 
 
 
448 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  32.33 
 
 
449 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  34.92 
 
 
441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  33.65 
 
 
456 aa  217  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2042  taurin--pyruvate aminotransferase  32.29 
 
 
460 aa  216  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.291781 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1673  aminotransferase  31.92 
 
 
450 aa  216  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0301264  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  33.02 
 
 
445 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  32.49 
 
 
448 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  32.49 
 
 
448 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  34.43 
 
 
454 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3671  aminotransferase  32.01 
 
 
450 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0477751  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  32.09 
 
 
449 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  32.09 
 
 
450 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0943  aminotransferase  32.66 
 
 
460 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434836  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2602  aminotransferase class-III  32.66 
 
 
459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2523  aminotransferase class-III  33.33 
 
 
443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  34.59 
 
 
479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  34.91 
 
 
451 aa  215  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  32.86 
 
 
428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  34.36 
 
 
454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  33.72 
 
 
446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  34.36 
 
 
454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  31.96 
 
 
443 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  34.12 
 
 
454 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0051  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  33.86 
 
 
470 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  34.36 
 
 
468 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  34.11 
 
 
448 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  34.62 
 
 
451 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  33.86 
 
 
444 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  33.86 
 
 
444 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  34.01 
 
 
449 aa  213  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  33.26 
 
 
459 aa  213  7e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  34.12 
 
 
478 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  32.8 
 
 
446 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  32.8 
 
 
446 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  32.65 
 
 
446 aa  212  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  33.64 
 
 
444 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  34.12 
 
 
454 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  32.8 
 
 
446 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  33.64 
 
 
444 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  34.12 
 
 
454 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  33.64 
 
 
444 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  33.77 
 
 
465 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  32.8 
 
 
446 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  32.8 
 
 
446 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  33.89 
 
 
454 aa  211  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  33.41 
 
 
444 aa  211  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  32.57 
 
 
446 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  32.86 
 
 
450 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0218  aminotransferase class-III  31.6 
 
 
452 aa  209  8e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  34.19 
 
 
444 aa  209  8e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  33.41 
 
 
444 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  34.12 
 
 
454 aa  209  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  32.23 
 
 
474 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>