More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3118 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3118  hypothetical protein  100 
 
 
437 aa  875    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0272  aminotransferase class-III  58.8 
 
 
462 aa  532  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  59.07 
 
 
464 aa  529  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  59.53 
 
 
464 aa  530  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2960  aminotransferase class-III  62.24 
 
 
457 aa  518  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0599689  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0336  hypothetical protein  60 
 
 
459 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0357  hypothetical protein  60 
 
 
459 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0347  hypothetical protein  60 
 
 
459 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  57.58 
 
 
435 aa  504  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0447  aminotransferase class-III  57.24 
 
 
461 aa  504  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1055  hypothetical protein  56.9 
 
 
463 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5776  hypothetical protein  58.08 
 
 
484 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.246423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5722  hypothetical protein  58.31 
 
 
446 aa  474  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00920  aminotransferase  55.68 
 
 
463 aa  455  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0841  aminotransferase class-III  54.12 
 
 
440 aa  450  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24140  aminotransferase  54.37 
 
 
453 aa  441  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1438  aminotransferase class-III  54.55 
 
 
444 aa  433  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2572  hypothetical protein  52.57 
 
 
437 aa  431  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0158  hypothetical protein  51.77 
 
 
438 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0034  hypothetical protein  50.12 
 
 
441 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1417  4-aminobutyrate aminotransferase  48.36 
 
 
441 aa  410  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  42.19 
 
 
446 aa  356  5.999999999999999e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  41.96 
 
 
444 aa  350  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3443  aminotransferase class-III  40.83 
 
 
450 aa  343  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000605746  normal  0.17806 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  46.03 
 
 
448 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  46.03 
 
 
448 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  38.16 
 
 
448 aa  298  1e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4062  aminotransferase class-III  40.63 
 
 
443 aa  286  5e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0532  aminotransferase class-III  34.55 
 
 
444 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410218  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2523  aminotransferase class-III  38.72 
 
 
443 aa  269  8e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4554  aminotransferase class-III  41.99 
 
 
428 aa  266  7e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41686  predicted protein  37.53 
 
 
430 aa  251  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  37.13 
 
 
454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  36.16 
 
 
449 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  35.6 
 
 
456 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  36.22 
 
 
450 aa  234  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  37.3 
 
 
448 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  37.3 
 
 
448 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  37.3 
 
 
448 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  34.72 
 
 
448 aa  233  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  35.46 
 
 
446 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  35.78 
 
 
446 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  34.64 
 
 
428 aa  231  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  36.03 
 
 
446 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  35.78 
 
 
446 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  35.78 
 
 
446 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  35.78 
 
 
446 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  36.3 
 
 
445 aa  230  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  33.89 
 
 
459 aa  228  1e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8945  aminotransferase  35.25 
 
 
412 aa  228  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  35.51 
 
 
440 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  34.05 
 
 
478 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  33.65 
 
 
468 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  34.05 
 
 
454 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  34.05 
 
 
454 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  35.29 
 
 
446 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  34.05 
 
 
454 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  33.65 
 
 
454 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  33.95 
 
 
449 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  33.95 
 
 
449 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  33.95 
 
 
449 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  33.95 
 
 
449 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  33.95 
 
 
449 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  35.85 
 
 
456 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  33.81 
 
 
454 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  33.95 
 
 
449 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  35.85 
 
 
456 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  32.43 
 
 
454 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  37.5 
 
 
457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  33.57 
 
 
479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  33.92 
 
 
446 aa  221  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  33.87 
 
 
449 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  35.38 
 
 
444 aa  220  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  34.13 
 
 
430 aa  219  5e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  33.72 
 
 
449 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  35.68 
 
 
448 aa  219  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3166  hypothetical protein  34.82 
 
 
457 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  35.35 
 
 
447 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  34.2 
 
 
456 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  35.98 
 
 
444 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  34.02 
 
 
457 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  33.33 
 
 
454 aa  217  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  35.19 
 
 
444 aa  216  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  32.77 
 
 
441 aa  216  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  34.6 
 
 
447 aa  216  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  33.81 
 
 
444 aa  216  9e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  35.98 
 
 
444 aa  216  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  35.75 
 
 
444 aa  216  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  35.94 
 
 
451 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  37.2 
 
 
446 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  33.18 
 
 
458 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  37.7 
 
 
448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  37.7 
 
 
448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  37.7 
 
 
448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  37.7 
 
 
448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  35.6 
 
 
454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  32.89 
 
 
457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  36.89 
 
 
442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  33.7 
 
 
451 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  32.76 
 
 
463 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>