More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2960 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2960  aminotransferase class-III  100 
 
 
457 aa  923    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0599689  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0272  aminotransferase class-III  64.61 
 
 
462 aa  603  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  64.43 
 
 
464 aa  581  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  63.97 
 
 
464 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0357  hypothetical protein  64.2 
 
 
459 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0347  hypothetical protein  64.2 
 
 
459 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0336  hypothetical protein  64.43 
 
 
459 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0447  aminotransferase class-III  60.96 
 
 
461 aa  565  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5776  hypothetical protein  62.41 
 
 
484 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.246423 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1055  hypothetical protein  60.61 
 
 
463 aa  549  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  61.43 
 
 
435 aa  550  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5722  hypothetical protein  65.29 
 
 
446 aa  547  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3118  hypothetical protein  62.24 
 
 
437 aa  546  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1438  aminotransferase class-III  58.47 
 
 
444 aa  490  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24140  aminotransferase  58.64 
 
 
453 aa  483  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0841  aminotransferase class-III  55.61 
 
 
440 aa  466  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0034  hypothetical protein  52.86 
 
 
441 aa  462  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00920  aminotransferase  55.21 
 
 
463 aa  461  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0158  hypothetical protein  54.38 
 
 
438 aa  461  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2572  hypothetical protein  56.6 
 
 
437 aa  460  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1417  4-aminobutyrate aminotransferase  52.56 
 
 
441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  42.76 
 
 
446 aa  389  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  42.2 
 
 
444 aa  385  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  47.66 
 
 
448 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  47.66 
 
 
448 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3443  aminotransferase class-III  39.04 
 
 
450 aa  351  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000605746  normal  0.17806 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  38.44 
 
 
448 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0532  aminotransferase class-III  33.93 
 
 
444 aa  297  2e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4554  aminotransferase class-III  46.45 
 
 
428 aa  293  6e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4062  aminotransferase class-III  39.52 
 
 
443 aa  278  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2523  aminotransferase class-III  36.1 
 
 
443 aa  257  3e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  36.05 
 
 
468 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  39.84 
 
 
448 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  39.84 
 
 
448 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  35.81 
 
 
454 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  39.84 
 
 
448 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  35.96 
 
 
454 aa  249  7e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  35.58 
 
 
478 aa  249  9e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  35.58 
 
 
454 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  35.75 
 
 
479 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  35.58 
 
 
454 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  35.58 
 
 
454 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  35.35 
 
 
454 aa  247  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  35.8 
 
 
428 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  35.51 
 
 
454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41686  predicted protein  35.51 
 
 
430 aa  243  7e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  34.51 
 
 
430 aa  240  2.9999999999999997e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  34.91 
 
 
454 aa  239  8e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  33.18 
 
 
437 aa  239  9e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  35.56 
 
 
455 aa  237  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  34.11 
 
 
448 aa  236  8e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  32.48 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  35.76 
 
 
426 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  35.39 
 
 
479 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  35.53 
 
 
426 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  35.51 
 
 
444 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  36.95 
 
 
434 aa  231  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  37.5 
 
 
442 aa  229  6e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  34.92 
 
 
440 aa  229  7e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1929  aminotransferase class-III  36.81 
 
 
464 aa  229  8e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  33.62 
 
 
456 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  33.1 
 
 
443 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8945  aminotransferase  34.52 
 
 
412 aa  227  3e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  35.07 
 
 
425 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  33.97 
 
 
454 aa  227  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  36.88 
 
 
454 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  38.02 
 
 
459 aa  228  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  35.78 
 
 
432 aa  227  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.65 
 
 
391 aa  227  4e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  36.04 
 
 
442 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  34.35 
 
 
448 aa  226  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  33.18 
 
 
446 aa  226  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  33.18 
 
 
446 aa  226  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  33.18 
 
 
446 aa  226  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  34.83 
 
 
425 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  34.83 
 
 
425 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  33.18 
 
 
446 aa  225  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  34.2 
 
 
430 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  35.75 
 
 
446 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6480  hypothetical protein  36.65 
 
 
454 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  36.02 
 
 
446 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  31.1 
 
 
466 aa  223  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  35.96 
 
 
457 aa  223  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  32.79 
 
 
426 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  33.02 
 
 
426 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.480055 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  32.86 
 
 
426 aa  223  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  32.79 
 
 
426 aa  223  7e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  32.86 
 
 
426 aa  223  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  34.39 
 
 
465 aa  223  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  32.22 
 
 
450 aa  223  8e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  33.18 
 
 
452 aa  222  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  35.07 
 
 
438 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  31.83 
 
 
436 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  34.12 
 
 
446 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  34.12 
 
 
425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  32.55 
 
 
426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  32.55 
 
 
426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  33.33 
 
 
445 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1332  aminotransferase class-III  37.5 
 
 
460 aa  220  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.531603  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  33.65 
 
 
449 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>