More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4627 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  889    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0357  hypothetical protein  71.23 
 
 		 459 aa  628  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0347  hypothetical protein  71.23 
 
 		 459 aa  628  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0336  hypothetical protein  71 
 
 		 459 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  69.44 
 
 		 464 aa  622  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  67.82 
 
 		 464 aa  616  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1055  hypothetical protein  68.4 
 
 		 463 aa  615  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5776  hypothetical protein  69.61 
 
 		 484 aa  609  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0272  aminotransferase class-III  66.44 
 
 		 462 aa  593  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0447  aminotransferase class-III  65.38 
 
 		 461 aa  590  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1438  aminotransferase class-III  65.95 
 
 		 444 aa  555  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24140  aminotransferase  63.76 
 
 		 453 aa  543  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0841  aminotransferase class-III  62.76 
 
 		 440 aa  537  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2960  aminotransferase class-III  61.2 
 
 		 457 aa  533  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0599689  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0158  hypothetical protein  60.93 
 
 		 438 aa  529  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0034  hypothetical protein  61.05 
 
 		 441 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00920  aminotransferase  59.49 
 
 		 463 aa  510  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2572  hypothetical protein  62.47 
 
 		 437 aa  509  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5722  hypothetical protein  59.27 
 
 		 446 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3118  hypothetical protein  57.58 
 
 		 437 aa  504  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1417  4-aminobutyrate aminotransferase  56.47 
 
 		 441 aa  491  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  44.29 
 
 		 444 aa  385  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  43.75 
 
 		 446 aa  381  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3443  aminotransferase class-III  41.15 
 
 		 450 aa  347  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000605746  normal  0.17806 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  45.56 
 
 		 448 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  45.56 
 
 		 448 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  37.18 
 
 		 448 aa  298  2e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0532  aminotransferase class-III  34.02 
 
 		 444 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410218  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4062  aminotransferase class-III  36.04 
 
 		 443 aa  263  4e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2523  aminotransferase class-III  36.21 
 
 		 443 aa  260  4e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  36.05 
 
 		 428 aa  250  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4554  aminotransferase class-III  39.82 
 
 		 428 aa  247  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41686  predicted protein  33.98 
 
 		 430 aa  247  3e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  33.63 
 
 		 456 aa  238  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  36.94 
 
 		 451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8945  aminotransferase  34.62 
 
 		 412 aa  234  3e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  36.78 
 
 		 442 aa  233  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  34.61 
 
 		 459 aa  233  5e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  35.48 
 
 		 430 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  35.36 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  35.7 
 
 		 455 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  35.52 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  32.94 
 
 		 437 aa  227  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  32.37 
 
 		 454 aa  226  6e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  34.62 
 
 		 433 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  32.63 
 
 		 474 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5803  aminotransferase class-III  35.84 
 
 		 433 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  33.98 
 
 		 433 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  33.98 
 
 		 433 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  33.1 
 
 		 479 aa  223  7e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  34.72 
 
 		 465 aa  222  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  33.87 
 
 		 454 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  35.33 
 
 		 442 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  35.43 
 
 		 465 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  35.14 
 
 		 454 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  36.47 
 
 		 448 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  36.47 
 
 		 448 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  35.49 
 
 		 461 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6578  hypothetical protein  35.33 
 
 		 465 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204775  normal  0.0135068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  35.28 
 
 		 446 aa  219  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  33.18 
 
 		 456 aa  219  7e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  34.15 
 
 		 465 aa  219  8.999999999999998e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  35.33 
 
 		 465 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  35.33 
 
 		 465 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  35.28 
 
 		 446 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  35.23 
 
 		 465 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  35.28 
 
 		 446 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  33.49 
 
 		 448 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6480  hypothetical protein  34.91 
 
 		 454 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  35.28 
 
 		 446 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  32.24 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  33.89 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  35.99 
 
 		 448 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  35.27 
 
 		 444 aa  217  4e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  32.23 
 
 		 463 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2675  aminotransferase  33.98 
 
 		 433 aa  217  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  33.03 
 
 		 457 aa  217  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  36.61 
 
 		 444 aa  216  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  36.55 
 
 		 441 aa  216  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  34.88 
 
 		 448 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  35.05 
 
 		 446 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  36.38 
 
 		 478 aa  216  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  33.25 
 
 		 433 aa  216  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  33.98 
 
 		 433 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  33.98 
 
 		 433 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  33.89 
 
 		 449 aa  215  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  35.23 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  34.39 
 
 		 447 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  35.28 
 
 		 446 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  35.23 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  32.72 
 
 		 450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  34.83 
 
 		 444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  32.61 
 
 		 451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  29.29 
 
 		 450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  33.64 
 
 		 451 aa  213  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  34.9 
 
 		 443 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  34.51 
 
 		 449 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  30.77 
 
 		 441 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  31.32 
 
 		 449 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  30.16 
 
 		 450 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>