More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5089 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  100 
 
 		 451 aa  904    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  70.28 
 
 		 433 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  70.7 
 
 		 433 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2675  aminotransferase  70.74 
 
 		 433 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  70.51 
 
 		 433 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  69.82 
 
 		 433 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  70.28 
 
 		 433 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  70.28 
 
 		 433 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2046  aminotransferase class-III  70.11 
 
 		 433 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000254153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2878  aminotransferase class-III  67.67 
 
 		 434 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19268  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4825  aminotransferase class-III  62.47 
 
 		 446 aa  550  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00475157  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5803  aminotransferase class-III  62.44 
 
 		 433 aa  545  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5409  aminotransferase class-III  62.38 
 
 		 452 aa  537  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  59.26 
 
 		 436 aa  528  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  61.94 
 
 		 432 aa  524  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3251  aminotransferase class-III  58.45 
 
 		 428 aa  495  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0839  aminotransferase  53.95 
 
 		 445 aa  490  1e-137  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.33368  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07656  conserved hypothetical protein  52.01 
 
 		 452 aa  468  9.999999999999999e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.346872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1466  aminotransferase  73.82 
 
 		 329 aa  411  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  35.18 
 
 		 454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  36.71 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  34.94 
 
 		 479 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  34.94 
 
 		 454 aa  243  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  34.46 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  34.87 
 
 		 454 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  34.62 
 
 		 478 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  34.22 
 
 		 454 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  34.62 
 
 		 454 aa  239  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  34.62 
 
 		 454 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  34.62 
 
 		 454 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  33.57 
 
 		 438 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  35.15 
 
 		 465 aa  232  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  34.3 
 
 		 454 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  36.43 
 
 		 440 aa  231  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  36.75 
 
 		 418 aa  230  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  34.47 
 
 		 448 aa  229  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  34.78 
 
 		 430 aa  229  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  36.21 
 
 		 428 aa  229  7e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  35.48 
 
 		 441 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  36.87 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  35.44 
 
 		 439 aa  226  7e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  33.48 
 
 		 448 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  33.48 
 
 		 448 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  33.33 
 
 		 441 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  34.2 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  35.85 
 
 		 453 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  32.55 
 
 		 452 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  34.2 
 
 		 432 aa  223  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  34.46 
 
 		 465 aa  223  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  35.96 
 
 		 437 aa  223  6e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  36.12 
 
 		 425 aa  222  9e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  36.21 
 
 		 428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  35.8 
 
 		 441 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0662  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  37.47 
 
 		 462 aa  219  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00898604  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  32.94 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  35.82 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  33.82 
 
 		 448 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  33.57 
 
 		 427 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  34.81 
 
 		 419 aa  217  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  34.42 
 
 		 436 aa  217  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  34.46 
 
 		 439 aa  216  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  32.63 
 
 		 434 aa  216  7e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  33.57 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  34.81 
 
 		 474 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  34.04 
 
 		 425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  34.04 
 
 		 425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  33.81 
 
 		 426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  32.61 
 
 		 435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  33.81 
 
 		 426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  33.49 
 
 		 970 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  34.04 
 
 		 425 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  34.47 
 
 		 427 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  34.75 
 
 		 425 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  33.89 
 
 		 425 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514602 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  32.61 
 
 		 426 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1889  4-aminobutyrate aminotransferase  35.14 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148357  normal  0.0202633 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4054  aminotransferase  36.96 
 
 		 540 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  32.61 
 
 		 426 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  32.77 
 
 		 426 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  32.61 
 
 		 426 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2002  4-aminobutyrate aminotransferase  34.62 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607298 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  32.69 
 
 		 430 aa  211  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0848  4-aminobutyrate aminotransferase  34.96 
 
 		 425 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  34.88 
 
 		 436 aa  211  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  33.02 
 
 		 426 aa  210  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2626  4-aminobutyrate aminotransferase  30.34 
 
 		 445 aa  210  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.805613  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2680  4-aminobutyrate aminotransferase  30.34 
 
 		 445 aa  210  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  32.69 
 
 		 426 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  32.69 
 
 		 426 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  33.99 
 
 		 430 aa  209  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  34.04 
 
 		 448 aa  209  8e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  35.66 
 
 		 975 aa  209  8e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  34.29 
 
 		 438 aa  209  8e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2124  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  33.57 
 
 		 410 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.975893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  32.45 
 
 		 461 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  32.13 
 
 		 426 aa  208  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2159  4-aminobutyrate aminotransferase  30.48 
 
 		 445 aa  207  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4664  4-aminobutyrate aminotransferase  34.3 
 
 		 428 aa  207  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  34.07 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1289  4-aminobutyrate aminotransferase  32.46 
 
 		 426 aa  207  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>