More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1430 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  909    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  909    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0272  aminotransferase class-III  45.94 
 
 		 462 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  44.88 
 
 		 464 aa  346  4e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  44.19 
 
 		 464 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0447  aminotransferase class-III  43.32 
 
 		 461 aa  342  9e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  42.06 
 
 		 444 aa  341  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5722  hypothetical protein  45.56 
 
 		 446 aa  340  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0158  hypothetical protein  45.71 
 
 		 438 aa  340  4e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3118  hypothetical protein  46.03 
 
 		 437 aa  339  8e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2960  aminotransferase class-III  47.41 
 
 		 457 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0599689  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  45.56 
 
 		 435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  40.7 
 
 		 446 aa  334  2e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24140  aminotransferase  45.27 
 
 		 453 aa  332  7.000000000000001e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3443  aminotransferase class-III  40.32 
 
 		 450 aa  332  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000605746  normal  0.17806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1055  hypothetical protein  42.86 
 
 		 463 aa  330  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0357  hypothetical protein  44.65 
 
 		 459 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0347  hypothetical protein  44.65 
 
 		 459 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0336  hypothetical protein  44.86 
 
 		 459 aa  326  5e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5776  hypothetical protein  43.36 
 
 		 484 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246423 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0034  hypothetical protein  44.03 
 
 		 441 aa  319  6e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0841  aminotransferase class-III  45.09 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1438  aminotransferase class-III  44.42 
 
 		 444 aa  307  3e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00920  aminotransferase  43.56 
 
 		 463 aa  297  2e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1417  4-aminobutyrate aminotransferase  40.47 
 
 		 441 aa  295  9e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2572  hypothetical protein  43.13 
 
 		 437 aa  295  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  40 
 
 		 448 aa  292  6e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4062  aminotransferase class-III  39 
 
 		 443 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2523  aminotransferase class-III  39.62 
 
 		 443 aa  272  1e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0532  aminotransferase class-III  35.06 
 
 		 444 aa  264  2e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4554  aminotransferase class-III  39.86 
 
 		 428 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  37.28 
 
 		 456 aa  256  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  35.11 
 
 		 452 aa  254  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  35.96 
 
 		 479 aa  250  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  37.74 
 
 		 459 aa  243  6e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  35.28 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  38.46 
 
 		 462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  34.25 
 
 		 450 aa  233  6e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  37.95 
 
 		 428 aa  233  8.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  37.05 
 
 		 446 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  35.01 
 
 		 445 aa  229  7e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  36.22 
 
 		 447 aa  229  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  33.76 
 
 		 465 aa  229  7e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  35.65 
 
 		 446 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  36.56 
 
 		 448 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  33.87 
 
 		 450 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  35.9 
 
 		 448 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  35.9 
 
 		 448 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  38.89 
 
 		 454 aa  226  6e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  35.66 
 
 		 448 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  33.48 
 
 		 451 aa  226  8e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5857  hypothetical protein  37.03 
 
 		 465 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  33.95 
 
 		 446 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  34.51 
 
 		 437 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  36.41 
 
 		 457 aa  224  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  36.51 
 
 		 430 aa  225  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  33.95 
 
 		 446 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6095  hypothetical protein  36.79 
 
 		 465 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  33.95 
 
 		 446 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  33.72 
 
 		 446 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  35.47 
 
 		 440 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8945  aminotransferase  36.24 
 
 		 412 aa  222  8e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  33.82 
 
 		 474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  34.06 
 
 		 465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  33.95 
 
 		 448 aa  221  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  34.88 
 
 		 462 aa  220  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  35.22 
 
 		 465 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  33.72 
 
 		 446 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  35.62 
 
 		 451 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6578  hypothetical protein  36.08 
 
 		 465 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204775  normal  0.0135068 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  37.44 
 
 		 439 aa  219  5e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  34.64 
 
 		 446 aa  220  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  36.08 
 
 		 465 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1898  beta alanine--pyruvate transaminase  36.21 
 
 		 435 aa  219  6e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422888  normal  0.144142 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  36.08 
 
 		 465 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  35.65 
 
 		 456 aa  219  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  39.02 
 
 		 426 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  34.11 
 
 		 426 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1166  hypothetical protein  32.67 
 
 		 452 aa  218  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  34.11 
 
 		 426 aa  219  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  33.94 
 
 		 438 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  34.47 
 
 		 444 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  35.85 
 
 		 458 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  35.08 
 
 		 456 aa  219  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  34.11 
 
 		 426 aa  219  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  34.52 
 
 		 442 aa  219  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  34.11 
 
 		 426 aa  219  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  34.11 
 
 		 426 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  34.11 
 
 		 426 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0218  aminotransferase class-III  32.44 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  33.72 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2247  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  34.65 
 
 		 455 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3480  hypothetical protein  36.28 
 
 		 442 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.634829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  34.29 
 
 		 451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  33.87 
 
 		 426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  34.27 
 
 		 444 aa  217  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  36.67 
 
 		 460 aa  217  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  34.32 
 
 		 444 aa  217  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3345  hypothetical protein  35.51 
 
 		 451 aa  217  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6015  hypothetical protein  35.63 
 
 		 462 aa  216  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>