More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_8945 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_8945  aminotransferase  100 
 
 
412 aa  860    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41686  predicted protein  66.02 
 
 
430 aa  603  1.0000000000000001e-171  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  37.83 
 
 
446 aa  262  6.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  36.97 
 
 
444 aa  261  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5722  hypothetical protein  35.84 
 
 
446 aa  254  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0336  hypothetical protein  35.99 
 
 
459 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3443  aminotransferase class-III  35.73 
 
 
450 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000605746  normal  0.17806 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0357  hypothetical protein  35.99 
 
 
459 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0347  hypothetical protein  35.99 
 
 
459 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  35.85 
 
 
464 aa  250  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0447  aminotransferase class-III  36.47 
 
 
461 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  35.85 
 
 
464 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  34.62 
 
 
435 aa  246  6.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0272  aminotransferase class-III  35.41 
 
 
462 aa  242  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5776  hypothetical protein  35.34 
 
 
484 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.246423 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3118  hypothetical protein  35.25 
 
 
437 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  36.47 
 
 
448 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  36.47 
 
 
448 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0158  hypothetical protein  37.19 
 
 
438 aa  236  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  35.66 
 
 
448 aa  236  4e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0034  hypothetical protein  36.25 
 
 
441 aa  236  7e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1055  hypothetical protein  35.29 
 
 
463 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24140  aminotransferase  35.87 
 
 
453 aa  229  8e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2960  aminotransferase class-III  33.74 
 
 
457 aa  227  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0599689  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2572  hypothetical protein  34.66 
 
 
437 aa  227  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1417  4-aminobutyrate aminotransferase  37.01 
 
 
441 aa  218  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00920  aminotransferase  34.62 
 
 
463 aa  214  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1438  aminotransferase class-III  33.66 
 
 
444 aa  212  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0797  aminotransferase class-III  33.79 
 
 
461 aa  210  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.277612 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0532  aminotransferase class-III  30.55 
 
 
444 aa  208  2e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410218  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3946  putative aminotransferase  32.94 
 
 
466 aa  203  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118972  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2523  aminotransferase class-III  31.26 
 
 
443 aa  202  9e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0841  aminotransferase class-III  33.5 
 
 
440 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4062  aminotransferase class-III  30.6 
 
 
443 aa  199  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  32.57 
 
 
455 aa  200  5e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  32.3 
 
 
451 aa  199  7e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  33.49 
 
 
450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  33.1 
 
 
450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  32.3 
 
 
460 aa  197  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  30.88 
 
 
459 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  31.67 
 
 
457 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  31.75 
 
 
460 aa  195  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  33.26 
 
 
459 aa  194  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2799  aminotransferase  31.83 
 
 
459 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707111  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  34.44 
 
 
464 aa  193  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  32.71 
 
 
457 aa  192  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  32.94 
 
 
458 aa  192  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  30.71 
 
 
455 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  32.79 
 
 
463 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  31.54 
 
 
454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  32.24 
 
 
443 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  32.15 
 
 
455 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3052  aminotransferase class-III  33.49 
 
 
463 aa  189  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  31.52 
 
 
454 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3261  aminotransferase  30.33 
 
 
460 aa  189  8e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.899637  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  33.18 
 
 
442 aa  189  8e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3993  aminotransferase  30.09 
 
 
460 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  31.59 
 
 
456 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  31.59 
 
 
456 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3738  aminotransferase  31.86 
 
 
461 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  31.69 
 
 
444 aa  188  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  32.32 
 
 
485 aa  187  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  31.53 
 
 
454 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  32.31 
 
 
452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  30.58 
 
 
448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  31.04 
 
 
440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3280  aminotransferase  30.57 
 
 
468 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  32.47 
 
 
470 aa  184  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  30.58 
 
 
448 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  29.95 
 
 
451 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  30.58 
 
 
448 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3557  putative aminotransferase  32.08 
 
 
452 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.936496  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2031  aminotransferase  30.02 
 
 
450 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.670386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  31.37 
 
 
452 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  30.66 
 
 
456 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  30.26 
 
 
459 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  30.35 
 
 
453 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4554  aminotransferase class-III  31.33 
 
 
428 aa  180  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2835  hypothetical protein  30.12 
 
 
467 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.561415  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  30.6 
 
 
436 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  30.17 
 
 
466 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  29.86 
 
 
456 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2986  putative aminotransferase  30.62 
 
 
465 aa  179  8e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3032  aminotransferase class-III  32.63 
 
 
463 aa  179  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.503296  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  32.21 
 
 
462 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3177  hypothetical protein  29.88 
 
 
467 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.060239  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  29.81 
 
 
456 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3814  aminotransferase class-III  31.46 
 
 
460 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3534  hypothetical protein  31.18 
 
 
467 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.631271  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  28.54 
 
 
456 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  29.9 
 
 
457 aa  177  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  30.84 
 
 
448 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0218  aminotransferase class-III  31.48 
 
 
452 aa  177  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  30.86 
 
 
457 aa  177  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4238  aminotransferase class-III  31.38 
 
 
478 aa  176  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0676967  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  31.28 
 
 
471 aa  176  7e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  30.57 
 
 
463 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  30.39 
 
 
459 aa  176  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2033  aminotransferase class-III  30.26 
 
 
455 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  28.03 
 
 
463 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>