More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5114 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5803  aminotransferase class-III  75.93 
 
 		 433 aa  691    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  100 
 
 		 436 aa  883    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  78.57 
 
 		 432 aa  687    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4825  aminotransferase class-III  65.51 
 
 		 446 aa  583  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00475157  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5409  aminotransferase class-III  63.57 
 
 		 452 aa  568  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3251  aminotransferase class-III  65.96 
 
 		 428 aa  566  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  62.94 
 
 		 433 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2675  aminotransferase  63.27 
 
 		 433 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  63.29 
 
 		 433 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  61.97 
 
 		 433 aa  551  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  61.88 
 
 		 433 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  61.74 
 
 		 433 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  61.88 
 
 		 433 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2878  aminotransferase class-III  62.7 
 
 		 434 aa  547  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19268  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2046  aminotransferase class-III  62.8 
 
 		 433 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000254153 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  59.26 
 
 		 451 aa  528  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0839  aminotransferase  54.35 
 
 		 445 aa  506  9.999999999999999e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.33368  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07656  conserved hypothetical protein  52.8 
 
 		 452 aa  498  1e-140  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.346872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1466  aminotransferase  66.18 
 
 		 329 aa  378  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  32.69 
 
 		 454 aa  244  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  33.18 
 
 		 438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  35.59 
 
 		 439 aa  242  7.999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  33.01 
 
 		 454 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  32.77 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  32.77 
 
 		 478 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  32.77 
 
 		 454 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  32.69 
 
 		 479 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  32.77 
 
 		 454 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  32.77 
 
 		 454 aa  240  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  32.77 
 
 		 454 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  32.45 
 
 		 454 aa  237  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  34.75 
 
 		 436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  36.09 
 
 		 465 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  32.13 
 
 		 454 aa  231  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  34.55 
 
 		 448 aa  230  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  34.56 
 
 		 440 aa  227  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  34.7 
 
 		 430 aa  226  5.0000000000000005e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  32.78 
 
 		 452 aa  226  5.0000000000000005e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  33.41 
 
 		 437 aa  226  6e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  35.17 
 
 		 438 aa  224  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  33.78 
 
 		 446 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  35.01 
 
 		 465 aa  223  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  31.41 
 
 		 441 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  32.49 
 
 		 457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  33.25 
 
 		 448 aa  220  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  34.27 
 
 		 444 aa  220  3e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  34.13 
 
 		 441 aa  220  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  33.82 
 
 		 428 aa  219  7e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  33.17 
 
 		 445 aa  218  1e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  32.6 
 
 		 446 aa  215  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0213  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  36.94 
 
 		 457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  33.57 
 
 		 453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  32.2 
 
 		 427 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  33.81 
 
 		 447 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3092  4-aminobutyrate aminotransferase  33.33 
 
 		 452 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.625534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  33.74 
 
 		 474 aa  213  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  32.12 
 
 		 444 aa  213  7.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5339  aminotransferase class-III  33.81 
 
 		 437 aa  212  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  32.19 
 
 		 434 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0848  4-aminobutyrate aminotransferase  33.98 
 
 		 425 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0429  4-aminobutyrate aminotransferase  34.19 
 
 		 433 aa  209  6e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286831  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2924  4-aminobutyrate aminotransferase  32.29 
 
 		 450 aa  209  7e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.647687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2583  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  34.35 
 
 		 458 aa  209  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406627  hitchhiker  0.00247951 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3663  4-aminobutyrate aminotransferase  35.02 
 
 		 445 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  31.5 
 
 		 464 aa  209  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0564  Acetylornithine transaminase  32.94 
 
 		 461 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.129985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  31.28 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2680  4-aminobutyrate aminotransferase  31.03 
 
 		 445 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2626  4-aminobutyrate aminotransferase  31.03 
 
 		 445 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.805613  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  33.49 
 
 		 434 aa  207  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  31.49 
 
 		 461 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2679  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  33.02 
 
 		 460 aa  207  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000398425  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  34.78 
 
 		 448 aa  206  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2355  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  33.73 
 
 		 460 aa  206  8e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0339571  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.43 
 
 		 397 aa  206  9e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0547  4-aminobutyrate aminotransferase  32.1 
 
 		 465 aa  205  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207209  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4664  4-aminobutyrate aminotransferase  31.88 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  34.59 
 
 		 418 aa  204  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2060  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  33.49 
 
 		 460 aa  204  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00222981  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  32.56 
 
 		 450 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  31.03 
 
 		 464 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1956  4-aminobutyrate aminotransferase  33.49 
 
 		 450 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  30 
 
 		 453 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  31.34 
 
 		 450 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0034  hypothetical protein  30.73 
 
 		 441 aa  204  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2713  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  33.57 
 
 		 458 aa  203  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000482772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5722  hypothetical protein  31.7 
 
 		 446 aa  203  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  30.99 
 
 		 448 aa  203  5e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1996  aminotransferase class-III  36.78 
 
 		 434 aa  203  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.026551  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4677  4-aminobutyrate aminotransferase  33.33 
 
 		 422 aa  202  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300302  normal  0.0763833 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  32.18 
 
 		 426 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  31.58 
 
 		 449 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  34.84 
 
 		 441 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  31.58 
 
 		 450 aa  202  9e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0662  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  34.89 
 
 		 462 aa  202  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00898604  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3094  4-aminobutyrate aminotransferase  32.07 
 
 		 468 aa  202  9e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0007  aminotransferase class-III  31.35 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.383992  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  31.94 
 
 		 426 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3118  hypothetical protein  34.22 
 
 		 437 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  31.08 
 
 		 435 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>