More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1996 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1996  aminotransferase class-III  100 
 
 		 434 aa  875    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.026551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2154  aminotransferase class-III  40.7 
 
 		 420 aa  303  6.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0759028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  35.31 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  35.31 
 
 		 446 aa  252  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  39.13 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  35.48 
 
 		 479 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  39.01 
 
 		 428 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  35.41 
 
 		 437 aa  239  5e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  36.95 
 
 		 436 aa  227  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  38.05 
 
 		 438 aa  226  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  33.65 
 
 		 440 aa  226  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  35.54 
 
 		 461 aa  226  8e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  35.61 
 
 		 461 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1416  acetylornithine aminotransferase  35.59 
 
 		 415 aa  224  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  35.61 
 
 		 461 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  36.39 
 
 		 459 aa  224  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  34.78 
 
 		 436 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  34.4 
 
 		 427 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  34.47 
 
 		 456 aa  220  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3719  aminotransferase class-III  36.34 
 
 		 455 aa  219  7.999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4042  aminotransferase class-III  32.22 
 
 		 448 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.690945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  34.52 
 
 		 446 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  34.43 
 
 		 446 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  34.43 
 
 		 446 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  34.43 
 
 		 446 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  34.28 
 
 		 446 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  34.43 
 
 		 446 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  35.12 
 
 		 445 aa  216  9e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  35.87 
 
 		 449 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  35.87 
 
 		 449 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  35.87 
 
 		 449 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  35.87 
 
 		 449 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  35.87 
 
 		 449 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  34.2 
 
 		 461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  35.63 
 
 		 449 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0653  aminotransferase class-III  35.53 
 
 		 467 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0978357  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  32.23 
 
 		 457 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  33.17 
 
 		 454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  35.14 
 
 		 449 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  35.38 
 
 		 449 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4363  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  35.95 
 
 		 468 aa  210  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174422  normal  0.549644 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  33.58 
 
 		 448 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  33.58 
 
 		 448 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  31.26 
 
 		 454 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  31.13 
 
 		 456 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2930  aminotransferase class-III  34.99 
 
 		 460 aa  208  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  31.13 
 
 		 455 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.25 
 
 		 393 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  31.13 
 
 		 456 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  33.8 
 
 		 403 aa  208  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0348  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.25 
 
 		 395 aa  208  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.276087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  30.31 
 
 		 453 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  34.04 
 
 		 446 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  31.75 
 
 		 446 aa  206  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  35.47 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3443  aminotransferase class-III  30.32 
 
 		 450 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000605746  normal  0.17806 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1964  beta alanine--pyruvate transaminase  35.24 
 
 		 441 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  33.25 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  38.46 
 
 		 432 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  35.66 
 
 		 441 aa  204  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  36.78 
 
 		 436 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  32.67 
 
 		 474 aa  203  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  34.15 
 
 		 448 aa  202  7e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  29.83 
 
 		 453 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.67 
 
 		 391 aa  202  9e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  34.64 
 
 		 448 aa  202  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  29.83 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2722  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.41 
 
 		 389 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.601213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  36.17 
 
 		 451 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  33.25 
 
 		 471 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  36.05 
 
 		 432 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3466  ornithine--oxo-acid transaminase  32.35 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  29.83 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  37.24 
 
 		 442 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1751  adenosylmethionine-8-amino-7- oxononanoateaminotr ansferase  30.19 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000427853  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  32.31 
 
 		 475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  32.29 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  34.26 
 
 		 462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  35.32 
 
 		 431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  30.39 
 
 		 465 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2115  acetylornithine aminotransferase  35.78 
 
 		 411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0193211 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  34.68 
 
 		 403 aa  200  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  34.39 
 
 		 453 aa  200  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0213  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  35.26 
 
 		 457 aa  199  6e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  29.91 
 
 		 455 aa  199  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  33.83 
 
 		 458 aa  199  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  32.75 
 
 		 397 aa  199  9e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  33.18 
 
 		 462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.5 
 
 		 397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3196  aminotransferase class-III  33.01 
 
 		 458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  33.5 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  28.35 
 
 		 457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  31.46 
 
 		 459 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1580  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  33.89 
 
 		 455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2041  aminotransferase  31.1 
 
 		 455 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3460  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.68 
 
 		 388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640133 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  37.94 
 
 		 442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0283  hypothetical protein  33.98 
 
 		 457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0158  hypothetical protein  32.39 
 
 		 438 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  31.05 
 
 		 452 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>