More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2154 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2154  aminotransferase class-III  100 
 
 		 420 aa  870    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0759028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1996  aminotransferase class-III  40.7 
 
 		 434 aa  303  6.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.026551  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  33.42 
 
 		 437 aa  236  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  35.45 
 
 		 446 aa  220  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  33.68 
 
 		 444 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  30.62 
 
 		 428 aa  210  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4042  aminotransferase class-III  31.88 
 
 		 448 aa  206  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.690945  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07656  conserved hypothetical protein  32.86 
 
 		 452 aa  204  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.346872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2275  hypothetical protein  30.83 
 
 		 436 aa  201  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2139  hypothetical protein  31.03 
 
 		 436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2077  hypothetical protein  31.03 
 
 		 436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2073  hypothetical protein  31.03 
 
 		 436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2112  hypothetical protein  31.57 
 
 		 436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177398  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3048  hypothetical protein  30.83 
 
 		 436 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2294  hypothetical protein  31.03 
 
 		 436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  31.58 
 
 		 427 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2319  hypothetical protein  31.03 
 
 		 436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0532  aminotransferase class-III  31.96 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2328  hypothetical protein  31.03 
 
 		 436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000223994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2402  hypothetical protein  31.03 
 
 		 436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1682  hypothetical protein  31.07 
 
 		 436 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63587  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  32.16 
 
 		 436 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0213  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  30.86 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  29.95 
 
 		 479 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.19 
 
 		 399 aa  189  9e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  31.13 
 
 		 474 aa  187  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0539  aminotransferase class-III  32.36 
 
 		 440 aa  186  7e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  31.48 
 
 		 427 aa  186  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  30.51 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  33.99 
 
 		 440 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  31.89 
 
 		 471 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  29.8 
 
 		 393 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  30.5 
 
 		 442 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0926  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  30.05 
 
 		 454 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0888484  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  29.71 
 
 		 442 aa  183  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2244  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  30.43 
 
 		 455 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  31.18 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0700  aminotransferase class-III  29.18 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  30.39 
 
 		 447 aa  180  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  31.48 
 
 		 399 aa  180  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  31.63 
 
 		 432 aa  180  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  32.05 
 
 		 398 aa  179  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  33.82 
 
 		 442 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  28.71 
 
 		 457 aa  178  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2523  aminotransferase class-III  29.48 
 
 		 443 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  29.71 
 
 		 444 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  31.31 
 
 		 398 aa  177  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0564  Acetylornithine transaminase  31.82 
 
 		 461 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.129985 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  31.14 
 
 		 396 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  31.8 
 
 		 394 aa  177  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3329  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  31.64 
 
 		 456 aa  177  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.225117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0158  hypothetical protein  29.3 
 
 		 438 aa  177  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  30.66 
 
 		 467 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  30.22 
 
 		 452 aa  176  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2930  aminotransferase class-III  30.92 
 
 		 460 aa  176  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  29.13 
 
 		 427 aa  175  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4363  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  31.75 
 
 		 468 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174422  normal  0.549644 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  32.26 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  31.58 
 
 		 438 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  31.75 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2679  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  30.28 
 
 		 460 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000398425  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  30.42 
 
 		 461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  32.11 
 
 		 441 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5803  aminotransferase class-III  30.83 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  29.95 
 
 		 462 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  31.59 
 
 		 441 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2897  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  30.96 
 
 		 450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3149  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  30.96 
 
 		 450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0532  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  30.96 
 
 		 450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.301998  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0516  aminotransferase class-III  30.68 
 
 		 459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0984655 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0696  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  30.96 
 
 		 450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.170615  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  32.02 
 
 		 433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2247  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  30.79 
 
 		 455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0119  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  30.96 
 
 		 450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1469  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  30.96 
 
 		 450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2138  putative diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  28.99 
 
 		 967 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00227594  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3719  aminotransferase class-III  29.21 
 
 		 455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  30.68 
 
 		 418 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3784  aminotransferase class-III  31.07 
 
 		 460 aa  174  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  30.35 
 
 		 446 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.49 
 
 		 385 aa  173  5.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0412  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  31.54 
 
 		 465 aa  173  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.481167  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  30.02 
 
 		 418 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  30.02 
 
 		 418 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  30.77 
 
 		 431 aa  172  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  32.53 
 
 		 458 aa  172  6.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  30.79 
 
 		 443 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0514  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  32.58 
 
 		 450 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3854  hypothetical protein  29.64 
 
 		 447 aa  172  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  32.83 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  29.95 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  30.75 
 
 		 396 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  31.03 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  29.95 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2163  hypothetical protein  29.63 
 
 		 473 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000327141  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1450  hypothetical protein  29.63 
 
 		 473 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235478  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2046  aminotransferase class-III  31.77 
 
 		 433 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000254153 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  30.52 
 
 		 451 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  31.59 
 
 		 445 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  31.53 
 
 		 433 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0107565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>