More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4418 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2046  aminotransferase class-III  92.84 
 
 		 433 aa  794    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000254153 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  99.54 
 
 		 433 aa  870    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  94.69 
 
 		 433 aa  833    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  95.38 
 
 		 433 aa  837    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2675  aminotransferase  92.84 
 
 		 433 aa  818    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  95.38 
 
 		 433 aa  836    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2878  aminotransferase class-III  74.42 
 
 		 434 aa  637    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19268  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  100 
 
 		 433 aa  874    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  95.38 
 
 		 433 aa  836    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  70.51 
 
 		 451 aa  614  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5409  aminotransferase class-III  67.52 
 
 		 452 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4825  aminotransferase class-III  66.11 
 
 		 446 aa  570  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00475157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  63.29 
 
 		 436 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5803  aminotransferase class-III  62.9 
 
 		 433 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  61.77 
 
 		 432 aa  523  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3251  aminotransferase class-III  61.5 
 
 		 428 aa  515  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0839  aminotransferase  56.4 
 
 		 445 aa  502  1e-141  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.33368  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07656  conserved hypothetical protein  52.89 
 
 		 452 aa  485  1e-136  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.346872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1466  aminotransferase  83.21 
 
 		 329 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  34.35 
 
 		 438 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  36.26 
 
 		 440 aa  238  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  36.39 
 
 		 439 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  36.48 
 
 		 418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  35.47 
 
 		 425 aa  232  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  34.55 
 
 		 465 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  34.29 
 
 		 445 aa  229  8e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  35.48 
 
 		 448 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  35.75 
 
 		 437 aa  228  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0662  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  37.39 
 
 		 462 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00898604  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  32.12 
 
 		 479 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  33.96 
 
 		 430 aa  226  5.0000000000000005e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  31.87 
 
 		 478 aa  226  7e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  31.87 
 
 		 468 aa  226  8e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  31.87 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  31.63 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  31.87 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  31.87 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  31.63 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  31.87 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  31.89 
 
 		 441 aa  223  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  34.29 
 
 		 434 aa  223  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  31.87 
 
 		 454 aa  223  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  34.05 
 
 		 434 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  34.22 
 
 		 448 aa  220  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  34.55 
 
 		 465 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  32.69 
 
 		 428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  34.77 
 
 		 436 aa  219  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  34.29 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  33.33 
 
 		 461 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  31.31 
 
 		 454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  34.79 
 
 		 474 aa  217  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  33.98 
 
 		 435 aa  216  7e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  32.46 
 
 		 444 aa  216  9e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  33.01 
 
 		 427 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  34.53 
 
 		 448 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  33.82 
 
 		 441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.49 
 
 		 397 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  33.74 
 
 		 419 aa  213  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1787  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  33.73 
 
 		 409 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  33.65 
 
 		 448 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  33.65 
 
 		 448 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4074  aminotransferase class-III  34.78 
 
 		 443 aa  212  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  32.8 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  34.98 
 
 		 447 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  33.71 
 
 		 402 aa  211  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  32.13 
 
 		 438 aa  211  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3663  4-aminobutyrate aminotransferase  34.46 
 
 		 445 aa  210  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  31.34 
 
 		 452 aa  210  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  32.77 
 
 		 427 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1775  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  34.52 
 
 		 411 aa  209  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664584  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1558  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  33.81 
 
 		 411 aa  209  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  34.04 
 
 		 973 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  33.48 
 
 		 451 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3092  4-aminobutyrate aminotransferase  31.51 
 
 		 452 aa  208  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.625534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2785  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  34.53 
 
 		 410 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0591  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  34.53 
 
 		 410 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1736  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  34.53 
 
 		 410 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143405  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2425  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  34.53 
 
 		 410 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725646  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2847  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  34.53 
 
 		 410 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4054  aminotransferase  36.32 
 
 		 540 aa  209  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0701  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  34.69 
 
 		 410 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520056  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  34.31 
 
 		 445 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2866  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  34.53 
 
 		 410 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02741  hypothetical protein  35.42 
 
 		 963 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  33.8 
 
 		 973 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003101  diaminobutyrate-pyruvate transaminase/L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  35.19 
 
 		 958 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  34.12 
 
 		 975 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4042  aminotransferase class-III  31.4 
 
 		 448 aa  207  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.690945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  32.36 
 
 		 430 aa  207  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2727  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  34.29 
 
 		 410 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1180  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  34.45 
 
 		 410 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  32.36 
 
 		 396 aa  207  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  31.91 
 
 		 426 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  32.27 
 
 		 970 aa  206  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  31.91 
 
 		 426 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2124  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  33.97 
 
 		 410 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.975893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4291  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  34.69 
 
 		 410 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0309  hypothetical protein  33.1 
 
 		 450 aa  206  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  34.93 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  32.61 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>