More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4205 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  90.44 
 
 		 973 aa  1809    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  57.07 
 
 		 910 aa  1003    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  100 
 
 		 973 aa  1972    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  58.97 
 
 		 970 aa  1113    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  47.82 
 
 		 977 aa  811    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  57.32 
 
 		 970 aa  1072    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  58.09 
 
 		 970 aa  1099    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  61.48 
 
 		 974 aa  1182    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  55.42 
 
 		 966 aa  1038    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  55.6 
 
 		 976 aa  1040    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  64.55 
 
 		 975 aa  1230    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  47.66 
 
 		 981 aa  849    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  47.71 
 
 		 981 aa  855    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  47.08 
 
 		 967 aa  811    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  55.79 
 
 		 976 aa  1046    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  47.71 
 
 		 981 aa  855    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  34.85 
 
 		 978 aa  461  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  34.67 
 
 		 994 aa  439  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  32.27 
 
 		 1003 aa  435  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  31.99 
 
 		 1049 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  33.01 
 
 		 1018 aa  426  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  32.21 
 
 		 1016 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  31.98 
 
 		 1023 aa  418  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  31.38 
 
 		 1015 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  31.48 
 
 		 1015 aa  393  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  30.73 
 
 		 1015 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  38.03 
 
 		 427 aa  301  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1165  aminotransferase, class III  38.77 
 
 		 427 aa  297  6e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5225  aminotransferase class-III  38.82 
 
 		 427 aa  295  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  40.49 
 
 		 448 aa  294  6e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2224  aminotransferase class-III  37.85 
 
 		 434 aa  293  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2498  aminotransferase class-III  38.24 
 
 		 446 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52110  hypothetical protein  40.64 
 
 		 427 aa  288  4e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2538  aminotransferase class-III  36.88 
 
 		 434 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043195  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2916  aminotransferase class-III  36.38 
 
 		 448 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1546  aminotransferase class-III  36.71 
 
 		 448 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.634671  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0414  aminotransferase  38 
 
 		 416 aa  283  7.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0048  aminotransferase class-III  35.61 
 
 		 458 aa  280  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2403  aminotransferase class-III  36.58 
 
 		 447 aa  278  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.634591  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4354  aminotransferase  35.83 
 
 		 427 aa  274  7e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0067  aminotransferase class-III  35.87 
 
 		 447 aa  273  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1377  aminotransferase  37.68 
 
 		 429 aa  271  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427783  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1272  aminotransferase class-III  35.61 
 
 		 424 aa  270  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5426  aminotransferase class-III  37.01 
 
 		 442 aa  268  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341099  normal  0.107268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1796  aminotransferase class-III  34.88 
 
 		 436 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3009  aminotransferase  38.53 
 
 		 443 aa  261  6e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  36.1 
 
 		 433 aa  259  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3343  aminotransferase class-III  36.64 
 
 		 413 aa  252  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.65062 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5905  aminotransferase class-III  35.45 
 
 		 465 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1957  aminotransferase class-III  38.25 
 
 		 436 aa  241  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0312  aminotransferase  38.8 
 
 		 436 aa  239  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0982  aminotransferase class-III  36.67 
 
 		 436 aa  224  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  33.72 
 
 		 437 aa  220  8.999999999999998e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  34.42 
 
 		 436 aa  212  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  33.8 
 
 		 433 aa  207  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  33.8 
 
 		 433 aa  207  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  33.98 
 
 		 451 aa  204  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  32.86 
 
 		 433 aa  199  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  32.79 
 
 		 433 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  32.79 
 
 		 433 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  34.29 
 
 		 431 aa  198  5.000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  32.52 
 
 		 436 aa  197  8.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2675  aminotransferase  32.32 
 
 		 433 aa  197  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  32.39 
 
 		 433 aa  194  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2878  aminotransferase class-III  34.88 
 
 		 434 aa  194  9e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19268  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  33.57 
 
 		 430 aa  193  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  31.96 
 
 		 428 aa  193  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  32.77 
 
 		 432 aa  192  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  32.52 
 
 		 445 aa  191  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  31.28 
 
 		 461 aa  190  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4825  aminotransferase class-III  31.68 
 
 		 446 aa  190  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00475157  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2046  aminotransferase class-III  32.48 
 
 		 433 aa  190  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000254153 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5803  aminotransferase class-III  30.93 
 
 		 433 aa  187  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5409  aminotransferase class-III  31.62 
 
 		 452 aa  187  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  31.11 
 
 		 452 aa  187  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  30.93 
 
 		 436 aa  185  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0429  4-aminobutyrate aminotransferase  33.26 
 
 		 433 aa  184  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286831  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2993  aminotransferase class-III  33.97 
 
 		 436 aa  182  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  31.41 
 
 		 431 aa  180  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  31.35 
 
 		 426 aa  179  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  31.18 
 
 		 431 aa  179  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  30.48 
 
 		 419 aa  177  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  30.44 
 
 		 427 aa  177  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  30.14 
 
 		 426 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  30.73 
 
 		 440 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  30.7 
 
 		 433 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  30.71 
 
 		 430 aa  175  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  30.16 
 
 		 427 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  32.21 
 
 		 446 aa  175  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  29.91 
 
 		 426 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.81 
 
 		 393 aa  176  2.9999999999999996e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3215  aminotransferase class-III  32.61 
 
 		 436 aa  175  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26914  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  31.08 
 
 		 418 aa  174  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  32.62 
 
 		 422 aa  174  6.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  31.41 
 
 		 431 aa  174  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.25 
 
 		 391 aa  174  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.26 
 
 		 398 aa  174  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  30.99 
 
 		 403 aa  173  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  29.81 
 
 		 427 aa  173  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3669  aminotransferase class-III  32.02 
 
 		 443 aa  173  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.445293  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>