More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3092 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3092  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 452 aa  935    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.625534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000768  putative aminotransferase in phosphonate-related cluster  64.56 
 
 		 459 aa  628  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04875  4-aminobutyrate aminotransferase  64.79 
 
 		 459 aa  629  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0547  4-aminobutyrate aminotransferase  63.72 
 
 		 465 aa  600  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207209  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2748  4-aminobutyrate aminotransferase  61.43 
 
 		 468 aa  590  1e-167  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0813  4-aminobutyrate aminotransferase  63.43 
 
 		 459 aa  581  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3420  aminotransferase class-III  54.9 
 
 		 458 aa  496  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  36.63 
 
 		 436 aa  240  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  35.93 
 
 		 459 aa  233  5e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  36.26 
 
 		 456 aa  226  7e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  32.76 
 
 		 444 aa  222  9e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  35.54 
 
 		 448 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  32.72 
 
 		 443 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  32.61 
 
 		 457 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  34.06 
 
 		 446 aa  219  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4042  aminotransferase class-III  32.21 
 
 		 448 aa  216  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.690945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  31.84 
 
 		 446 aa  215  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2159  4-aminobutyrate aminotransferase  31.99 
 
 		 445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  34.76 
 
 		 454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  33.89 
 
 		 450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2626  4-aminobutyrate aminotransferase  33.42 
 
 		 445 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.805613  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  34.39 
 
 		 433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2680  4-aminobutyrate aminotransferase  33.42 
 
 		 445 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  34.39 
 
 		 433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  36.47 
 
 		 462 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  33.33 
 
 		 436 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  36.67 
 
 		 462 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  35.93 
 
 		 461 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  35.93 
 
 		 461 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  35.13 
 
 		 461 aa  213  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07656  conserved hypothetical protein  33.25 
 
 		 452 aa  212  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.346872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  34 
 
 		 432 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1578  aminotransferase class-III  33.26 
 
 		 458 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0270872  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  34.06 
 
 		 448 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  34.06 
 
 		 448 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  33.9 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2583  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  31.16 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406627  hitchhiker  0.00247951 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  33.09 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  35.46 
 
 		 461 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  34.62 
 
 		 464 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  34.62 
 
 		 443 aa  209  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2675  aminotransferase  33.17 
 
 		 433 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  31.91 
 
 		 452 aa  209  7e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4825  aminotransferase class-III  32.03 
 
 		 446 aa  209  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00475157  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  31.51 
 
 		 433 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5803  aminotransferase class-III  32.87 
 
 		 433 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  34.27 
 
 		 456 aa  208  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  33.81 
 
 		 442 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  35.34 
 
 		 438 aa  207  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  32.95 
 
 		 458 aa  207  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  31.35 
 
 		 433 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  34.05 
 
 		 479 aa  207  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  32.79 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  33.02 
 
 		 454 aa  206  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0051  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  31.97 
 
 		 470 aa  205  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0892  hypothetical protein  34.78 
 
 		 448 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0968914 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  34.6 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3443  aminotransferase class-III  32.36 
 
 		 450 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000605746  normal  0.17806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  31.72 
 
 		 464 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5722  hypothetical protein  33.26 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2046  aminotransferase class-III  32.68 
 
 		 433 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000254153 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  32.25 
 
 		 439 aa  203  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  32.79 
 
 		 468 aa  203  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  32.55 
 
 		 454 aa  203  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  32.55 
 
 		 478 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  32.55 
 
 		 454 aa  203  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  33.09 
 
 		 438 aa  203  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  31.88 
 
 		 444 aa  202  8e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  32.55 
 
 		 454 aa  202  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  33.5 
 
 		 448 aa  202  9e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2112  hypothetical protein  32.86 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2139  hypothetical protein  33.1 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2077  hypothetical protein  33.1 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  32.55 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2319  hypothetical protein  33.1 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2073  hypothetical protein  33.1 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  32.65 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2275  hypothetical protein  33.33 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  30.96 
 
 		 464 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2294  hypothetical protein  33.1 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2679  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  30.31 
 
 		 460 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000398425  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  32.57 
 
 		 444 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  35.24 
 
 		 458 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2328  hypothetical protein  33.1 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000223994  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  33.7 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3048  hypothetical protein  33.1 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2402  hypothetical protein  33.1 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  32.43 
 
 		 454 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2960  aminotransferase class-III  31.51 
 
 		 457 aa  201  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0599689  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  34.01 
 
 		 460 aa  201  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1493  aminotransferase class-III  34.8 
 
 		 458 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  32.43 
 
 		 468 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  33.25 
 
 		 445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  30.89 
 
 		 449 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  33.74 
 
 		 462 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  34.66 
 
 		 411 aa  200  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  35.14 
 
 		 448 aa  199  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  35.19 
 
 		 474 aa  199  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0218  aminotransferase class-III  31.43 
 
 		 452 aa  199  9e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  31.46 
 
 		 466 aa  199  9e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>