More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000768 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04875  4-aminobutyrate aminotransferase  96.73 
 
 		 459 aa  937    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2748  4-aminobutyrate aminotransferase  74.89 
 
 		 468 aa  740    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000768  putative aminotransferase in phosphonate-related cluster  100 
 
 		 459 aa  962    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0813  4-aminobutyrate aminotransferase  82.14 
 
 		 459 aa  795    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0547  4-aminobutyrate aminotransferase  74.17 
 
 		 465 aa  741    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207209  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3092  4-aminobutyrate aminotransferase  64.56 
 
 		 452 aa  628  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.625534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3420  aminotransferase class-III  48.87 
 
 		 458 aa  461  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  33.5 
 
 		 436 aa  224  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  35.66 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  33.5 
 
 		 445 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  34.39 
 
 		 428 aa  220  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  33.33 
 
 		 447 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4042  aminotransferase class-III  31.81 
 
 		 448 aa  210  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.690945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  35.22 
 
 		 459 aa  210  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  29.55 
 
 		 444 aa  210  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  32.49 
 
 		 444 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  33.01 
 
 		 454 aa  206  6e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  31.46 
 
 		 441 aa  206  8e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  35.79 
 
 		 442 aa  205  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  31.88 
 
 		 444 aa  205  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  28.84 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0532  aminotransferase class-III  31.89 
 
 		 444 aa  203  4e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410218  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  31.35 
 
 		 464 aa  203  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2159  4-aminobutyrate aminotransferase  29.33 
 
 		 445 aa  203  6e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  34.15 
 
 		 444 aa  203  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  33.89 
 
 		 445 aa  203  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  33.82 
 
 		 444 aa  203  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  32.58 
 
 		 447 aa  202  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  33.9 
 
 		 444 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  30.21 
 
 		 442 aa  202  8e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07656  conserved hypothetical protein  31.3 
 
 		 452 aa  202  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.346872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4582  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  32.66 
 
 		 405 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  29.42 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  33.58 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  33.58 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00079  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  32.78 
 
 		 403 aa  201  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  33.33 
 
 		 441 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  34.51 
 
 		 450 aa  200  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  31.05 
 
 		 448 aa  199  6e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  30.79 
 
 		 464 aa  199  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  32.03 
 
 		 458 aa  199  9e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  31.48 
 
 		 432 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  33.65 
 
 		 442 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  33.41 
 
 		 442 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  34.4 
 
 		 448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  30.67 
 
 		 450 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  30.41 
 
 		 479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  33.18 
 
 		 448 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  32.7 
 
 		 444 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002275  acetylornithine aminotransferase/N-succinyl-L,L-diaminopimelate aminotransferase/succinylornithine transaminase  32.08 
 
 		 403 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  30.33 
 
 		 436 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  33.82 
 
 		 444 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  30.37 
 
 		 394 aa  196  7e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2626  4-aminobutyrate aminotransferase  28.07 
 
 		 445 aa  196  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.805613  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0218  aminotransferase class-III  30.59 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5803  aminotransferase class-III  29.84 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2112  hypothetical protein  30.94 
 
 		 436 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177398  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2680  4-aminobutyrate aminotransferase  28.07 
 
 		 445 aa  196  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  30 
 
 		 460 aa  195  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  30.95 
 
 		 460 aa  195  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  29.83 
 
 		 433 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  29.33 
 
 		 466 aa  195  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  29.9 
 
 		 433 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3704  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  30.75 
 
 		 405 aa  194  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  32.25 
 
 		 413 aa  194  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  30.05 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  30.05 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0245  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  30.75 
 
 		 405 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110716  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  32.71 
 
 		 446 aa  194  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  30.05 
 
 		 433 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  31.6 
 
 		 437 aa  193  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2275  hypothetical protein  29.9 
 
 		 436 aa  193  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  33.33 
 
 		 443 aa  193  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  30.36 
 
 		 457 aa  192  7e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  26.77 
 
 		 443 aa  192  9e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  30.92 
 
 		 474 aa  192  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  29.87 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  33.25 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  32.05 
 
 		 462 aa  192  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  33.25 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  33.25 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3947  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  30.5 
 
 		 405 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.89 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0347  hypothetical protein  31.18 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0357  hypothetical protein  31.18 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  33.25 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2195  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.72 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3048  hypothetical protein  30.51 
 
 		 436 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  28.8 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4620  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  32.1 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  30.58 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  28.95 
 
 		 465 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  29.56 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  30 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1787  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  29.47 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  33.49 
 
 		 464 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0344  hypothetical protein  34.37 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3154  hypothetical protein  33.25 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0839  aminotransferase  28.92 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.33368  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0336  hypothetical protein  31.18 
 
 		 459 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>