More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2748 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0813  4-aminobutyrate aminotransferase  76.22 
 
 		 459 aa  712    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000768  putative aminotransferase in phosphonate-related cluster  74.89 
 
 		 459 aa  746    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0547  4-aminobutyrate aminotransferase  74.67 
 
 		 465 aa  720    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207209  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04875  4-aminobutyrate aminotransferase  75.78 
 
 		 459 aa  750    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2748  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 468 aa  976    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3092  4-aminobutyrate aminotransferase  61.43 
 
 		 452 aa  593  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.625534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3420  aminotransferase class-III  50.45 
 
 		 458 aa  451  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  32.52 
 
 		 466 aa  220  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  34.43 
 
 		 459 aa  219  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  32.19 
 
 		 428 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  29.27 
 
 		 444 aa  216  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  33.18 
 
 		 447 aa  216  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  33.17 
 
 		 436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  29.79 
 
 		 446 aa  213  7.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  30.57 
 
 		 427 aa  206  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  33.41 
 
 		 448 aa  206  8e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  31.49 
 
 		 460 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  31.57 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4582  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  33.08 
 
 		 405 aa  203  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  31.26 
 
 		 442 aa  204  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  33.65 
 
 		 479 aa  204  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  30.58 
 
 		 456 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  30.58 
 
 		 456 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  31.12 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  32.3 
 
 		 443 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0532  aminotransferase class-III  32.12 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  31.71 
 
 		 441 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  34.5 
 
 		 442 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  30.99 
 
 		 457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  30.99 
 
 		 455 aa  200  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  31.09 
 
 		 432 aa  200  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  31.73 
 
 		 444 aa  200  6e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  33.25 
 
 		 446 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  33.18 
 
 		 445 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2911  hypothetical protein  29.88 
 
 		 454 aa  199  9e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  33.81 
 
 		 444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  33.57 
 
 		 444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  35.66 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  30.22 
 
 		 436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  32.16 
 
 		 448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  32.41 
 
 		 446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  29.62 
 
 		 460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  30.66 
 
 		 454 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  30.33 
 
 		 448 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2112  hypothetical protein  30.7 
 
 		 436 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177398  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  29.47 
 
 		 453 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  29.54 
 
 		 448 aa  197  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  32.46 
 
 		 454 aa  197  3e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  30.29 
 
 		 443 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  31.52 
 
 		 457 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  33.33 
 
 		 444 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4042  aminotransferase class-III  30 
 
 		 448 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.690945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2275  hypothetical protein  30.57 
 
 		 436 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2159  4-aminobutyrate aminotransferase  29.28 
 
 		 445 aa  197  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  30.33 
 
 		 448 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  30.33 
 
 		 448 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2960  aminotransferase class-III  31.19 
 
 		 457 aa  197  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0599689  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  34.07 
 
 		 448 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0344  hypothetical protein  34.36 
 
 		 441 aa  196  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  33.1 
 
 		 444 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  33.1 
 
 		 444 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  30.51 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  33.95 
 
 		 444 aa  196  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  32.63 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  31.34 
 
 		 457 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  30.8 
 
 		 454 aa  195  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  33.1 
 
 		 444 aa  195  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  33.17 
 
 		 442 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3048  hypothetical protein  30.7 
 
 		 436 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  28.5 
 
 		 453 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  33.89 
 
 		 442 aa  194  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2402  hypothetical protein  30.7 
 
 		 436 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2328  hypothetical protein  30.7 
 
 		 436 aa  193  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000223994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  31.02 
 
 		 454 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  31.02 
 
 		 454 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  31.02 
 
 		 478 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2139  hypothetical protein  30.09 
 
 		 436 aa  193  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2077  hypothetical protein  30.09 
 
 		 436 aa  193  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2073  hypothetical protein  30.09 
 
 		 436 aa  193  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2500  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  31.19 
 
 		 452 aa  193  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2319  hypothetical protein  30.09 
 
 		 436 aa  193  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2294  hypothetical protein  30.09 
 
 		 436 aa  193  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2452  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  31.19 
 
 		 452 aa  193  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  31.02 
 
 		 454 aa  192  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  31.19 
 
 		 433 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  31.19 
 
 		 433 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  28.26 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  28.26 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  31.02 
 
 		 454 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  33.02 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  33.17 
 
 		 443 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3443  aminotransferase class-III  30.1 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000605746  normal  0.17806 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  29.13 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  31.19 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  33.57 
 
 		 448 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  30.69 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  31.54 
 
 		 464 aa  191  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  33.57 
 
 		 448 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  33.57 
 
 		 448 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  33.57 
 
 		 448 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>