More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04875 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2748  4-aminobutyrate aminotransferase  75.78 
 
 		 468 aa  744    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0547  4-aminobutyrate aminotransferase  74.17 
 
 		 465 aa  739    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207209  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0813  4-aminobutyrate aminotransferase  82.31 
 
 		 459 aa  791    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04875  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 459 aa  960    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000768  putative aminotransferase in phosphonate-related cluster  96.73 
 
 		 459 aa  937    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3092  4-aminobutyrate aminotransferase  64.79 
 
 		 452 aa  629  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.625534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3420  aminotransferase class-III  49.32 
 
 		 458 aa  463  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  35.14 
 
 		 436 aa  229  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  34.31 
 
 		 445 aa  223  7e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  34.39 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  32.96 
 
 		 447 aa  217  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  33.86 
 
 		 443 aa  216  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  30.35 
 
 		 444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  34.29 
 
 		 459 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  32.29 
 
 		 442 aa  210  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  33.03 
 
 		 444 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4582  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  32.66 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  32.85 
 
 		 454 aa  207  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  36.51 
 
 		 442 aa  207  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  29.41 
 
 		 446 aa  206  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  31.71 
 
 		 441 aa  206  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4042  aminotransferase class-III  31.33 
 
 		 448 aa  206  9e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.690945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  31.12 
 
 		 464 aa  206  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0532  aminotransferase class-III  31.89 
 
 		 444 aa  205  1e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410218  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00079  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  33.49 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  32.11 
 
 		 446 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07656  conserved hypothetical protein  31.54 
 
 		 452 aa  204  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.346872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  30.75 
 
 		 464 aa  204  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  31.48 
 
 		 444 aa  203  6e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2159  4-aminobutyrate aminotransferase  29.33 
 
 		 445 aa  203  7e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2112  hypothetical protein  31.23 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177398  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  31.72 
 
 		 432 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2275  hypothetical protein  32.05 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  34.15 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  33.49 
 
 		 444 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  30.81 
 
 		 448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  34.74 
 
 		 450 aa  199  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  32.52 
 
 		 447 aa  199  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3704  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.25 
 
 		 405 aa  199  7e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0245  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31.25 
 
 		 405 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110716  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  34.67 
 
 		 441 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  30.49 
 
 		 436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  34.05 
 
 		 443 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  32.94 
 
 		 444 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  32.94 
 
 		 444 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  32.94 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002275  acetylornithine aminotransferase/N-succinyl-L,L-diaminopimelate aminotransferase/succinylornithine transaminase  32.55 
 
 		 403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1787  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  30.68 
 
 		 409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  31.75 
 
 		 403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3048  hypothetical protein  30.99 
 
 		 436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2328  hypothetical protein  30.99 
 
 		 436 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000223994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2139  hypothetical protein  31.57 
 
 		 436 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2077  hypothetical protein  31.57 
 
 		 436 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2073  hypothetical protein  31.57 
 
 		 436 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  33.65 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3947  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0285  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  33 
 
 		 413 aa  197  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2294  hypothetical protein  31.57 
 
 		 436 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  31.39 
 
 		 458 aa  197  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2319  hypothetical protein  31.57 
 
 		 436 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2402  hypothetical protein  30.99 
 
 		 436 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  30.86 
 
 		 457 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  31.11 
 
 		 450 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2195  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  32.45 
 
 		 403 aa  196  8.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  29.83 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0357  hypothetical protein  31.41 
 
 		 459 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  34.07 
 
 		 448 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0344  hypothetical protein  35.31 
 
 		 441 aa  196  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0347  hypothetical protein  31.41 
 
 		 459 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0218  aminotransferase class-III  31.28 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0336  hypothetical protein  31.41 
 
 		 459 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  32.7 
 
 		 444 aa  195  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2680  4-aminobutyrate aminotransferase  27.84 
 
 		 445 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  29.39 
 
 		 465 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  33.41 
 
 		 444 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2626  4-aminobutyrate aminotransferase  27.84 
 
 		 445 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.805613  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  31.09 
 
 		 479 aa  195  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  30 
 
 		 460 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0950  hypothetical protein  33.1 
 
 		 448 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.927487  normal  0.694624 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  32.94 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  29.66 
 
 		 433 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2960  aminotransferase class-III  30.05 
 
 		 457 aa  193  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0599689  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  27.21 
 
 		 443 aa  193  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  33.41 
 
 		 442 aa  193  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0368  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  31 
 
 		 406 aa  192  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  31.11 
 
 		 400 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  30.48 
 
 		 427 aa  192  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1673  aminotransferase  29.14 
 
 		 450 aa  192  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0301264  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  31.69 
 
 		 452 aa  192  8e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  30.48 
 
 		 460 aa  192  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  28.92 
 
 		 449 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4620  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  32.35 
 
 		 406 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  33.01 
 
 		 442 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  30.12 
 
 		 394 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  28.92 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  29.14 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  29.33 
 
 		 466 aa  192  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  31.6 
 
 		 437 aa  192  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1055  hypothetical protein  31.28 
 
 		 463 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  29.36 
 
 		 450 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>