More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4825 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5409  aminotransferase class-III  79.21 
 
 
452 aa  699    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4825  aminotransferase class-III  100 
 
 
446 aa  900    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00475157  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3251  aminotransferase class-III  69.79 
 
 
428 aa  587  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  65.51 
 
 
436 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2675  aminotransferase  66.2 
 
 
433 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  66.27 
 
 
433 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  65.88 
 
 
433 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5803  aminotransferase class-III  66.04 
 
 
433 aa  569  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413013  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  66.11 
 
 
433 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  66.9 
 
 
432 aa  567  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  65.4 
 
 
433 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  65.64 
 
 
433 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  65.64 
 
 
433 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2878  aminotransferase class-III  67.45 
 
 
434 aa  553  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19268  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2046  aminotransferase class-III  65.51 
 
 
433 aa  553  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000254153 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  62.47 
 
 
451 aa  550  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0839  aminotransferase  57.65 
 
 
445 aa  546  1e-154  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.33368  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07656  conserved hypothetical protein  54.4 
 
 
452 aa  499  1e-140  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.346872  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1466  aminotransferase  64.86 
 
 
329 aa  368  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5339  aminotransferase class-III  36.82 
 
 
437 aa  249  9e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  33.8 
 
 
438 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  38.68 
 
 
418 aa  230  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  34.12 
 
 
439 aa  228  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  35.47 
 
 
440 aa  228  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  32.27 
 
 
448 aa  218  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  32.28 
 
 
478 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  32.29 
 
 
454 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  32.29 
 
 
454 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  32.29 
 
 
454 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  32.29 
 
 
454 aa  216  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  32.65 
 
 
465 aa  216  8e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  32.05 
 
 
468 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2918  aminotransferase class-III  38.5 
 
 
435 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.337832  normal  0.0522713 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  30.82 
 
 
441 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  31.81 
 
 
454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  32.05 
 
 
479 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  31.81 
 
 
454 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0158  hypothetical protein  33.41 
 
 
438 aa  213  5.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0662  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  37 
 
 
462 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00898604  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  32.78 
 
 
437 aa  213  5.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  32.26 
 
 
465 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  32.7 
 
 
436 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  32.02 
 
 
445 aa  212  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2159  4-aminobutyrate aminotransferase  29.93 
 
 
445 aa  211  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4493  aminotransferase class-III  36.54 
 
 
436 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906001  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  32.28 
 
 
448 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  32.28 
 
 
448 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  33.7 
 
 
457 aa  211  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  32.52 
 
 
427 aa  210  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  31.16 
 
 
454 aa  210  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  31.8 
 
 
454 aa  210  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  32.79 
 
 
435 aa  209  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3092  4-aminobutyrate aminotransferase  32.03 
 
 
452 aa  209  8e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.625534  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2680  4-aminobutyrate aminotransferase  29.7 
 
 
445 aa  209  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  32.46 
 
 
448 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2626  4-aminobutyrate aminotransferase  29.7 
 
 
445 aa  209  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.805613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  33.89 
 
 
441 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  32.25 
 
 
461 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00920  aminotransferase  31.55 
 
 
463 aa  207  4e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  32.86 
 
 
428 aa  207  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  34.27 
 
 
453 aa  207  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  31.8 
 
 
464 aa  206  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  32.66 
 
 
434 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  31.82 
 
 
464 aa  206  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0034  hypothetical protein  31.26 
 
 
441 aa  206  7e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1438  aminotransferase class-III  34.14 
 
 
444 aa  206  7e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  33.09 
 
 
474 aa  206  9e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  31.8 
 
 
445 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  32.74 
 
 
450 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  32.63 
 
 
444 aa  204  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24140  aminotransferase  32.27 
 
 
453 aa  204  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  33.57 
 
 
419 aa  203  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  31.77 
 
 
434 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  33.89 
 
 
448 aa  203  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.09 
 
 
397 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  31.93 
 
 
430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1858  4-aminobutyrate aminotransferase  34.77 
 
 
450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3663  4-aminobutyrate aminotransferase  33.81 
 
 
445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  33.58 
 
 
430 aa  200  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5722  hypothetical protein  33.81 
 
 
446 aa  201  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  33.74 
 
 
981 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  33.74 
 
 
981 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  30.95 
 
 
452 aa  200  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  30.97 
 
 
450 aa  200  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  33.74 
 
 
981 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  32.3 
 
 
417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  32.06 
 
 
448 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1956  4-aminobutyrate aminotransferase  32.94 
 
 
450 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  34.43 
 
 
446 aa  197  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  32.29 
 
 
461 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  32.29 
 
 
461 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  32.62 
 
 
973 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  31.83 
 
 
432 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5225  aminotransferase class-III  34.32 
 
 
427 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  31.85 
 
 
461 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  33.41 
 
 
447 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3443  aminotransferase class-III  30.57 
 
 
450 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000605746  normal  0.17806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0336  hypothetical protein  31.89 
 
 
459 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0347  hypothetical protein  31.89 
 
 
459 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0564  Acetylornithine transaminase  34.05 
 
 
461 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.129985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>