More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0622 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  100 
 
 
448 aa  920    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  46.01 
 
 
1016 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  45.33 
 
 
1023 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  45.1 
 
 
1049 aa  351  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  46.02 
 
 
436 aa  344  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  46.12 
 
 
978 aa  343  5e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  44.14 
 
 
1018 aa  342  7e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  42.44 
 
 
1015 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  42.22 
 
 
1015 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  42.44 
 
 
1015 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  42.86 
 
 
994 aa  323  3e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  40.18 
 
 
437 aa  323  5e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  40.92 
 
 
1003 aa  311  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  41.48 
 
 
981 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  41.48 
 
 
981 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  41.48 
 
 
981 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  40.45 
 
 
973 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  40.49 
 
 
973 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1165  aminotransferase, class III  40.56 
 
 
427 aa  299  6e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2403  aminotransferase class-III  39.9 
 
 
447 aa  298  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.634591  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  39.58 
 
 
427 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5225  aminotransferase class-III  41.36 
 
 
427 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  39.72 
 
 
970 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0048  aminotransferase class-III  37.97 
 
 
458 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  39.41 
 
 
966 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0414  aminotransferase  41.49 
 
 
416 aa  289  6e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  39.76 
 
 
970 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  40.32 
 
 
975 aa  286  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4354  aminotransferase  40.47 
 
 
427 aa  286  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2498  aminotransferase class-III  38.95 
 
 
446 aa  286  5e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  38.27 
 
 
976 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  41.56 
 
 
431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  38.27 
 
 
910 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  41.67 
 
 
974 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  37.19 
 
 
977 aa  280  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5426  aminotransferase class-III  38.48 
 
 
442 aa  279  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341099  normal  0.107268 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2916  aminotransferase class-III  37.47 
 
 
448 aa  279  7e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1546  aminotransferase class-III  37.23 
 
 
448 aa  277  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.634671  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0067  aminotransferase class-III  36.34 
 
 
447 aa  277  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  37.1 
 
 
976 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  39.37 
 
 
970 aa  275  9e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  37.62 
 
 
967 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  40.2 
 
 
431 aa  273  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3009  aminotransferase  39.15 
 
 
443 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  39.2 
 
 
433 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1272  aminotransferase class-III  37.07 
 
 
424 aa  268  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1796  aminotransferase class-III  39.05 
 
 
436 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2538  aminotransferase class-III  38.59 
 
 
434 aa  266  7e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043195  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  39.3 
 
 
431 aa  265  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  39.91 
 
 
433 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2224  aminotransferase class-III  37.68 
 
 
434 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3215  aminotransferase class-III  40.88 
 
 
436 aa  262  8e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26914  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  39.77 
 
 
431 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52110  hypothetical protein  40.58 
 
 
427 aa  258  1e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2993  aminotransferase class-III  41.26 
 
 
436 aa  256  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  38.5 
 
 
430 aa  255  9e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  39.64 
 
 
430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5905  aminotransferase class-III  37.21 
 
 
465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  37.16 
 
 
436 aa  254  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1377  aminotransferase  38.03 
 
 
429 aa  249  5e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427783  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  37.2 
 
 
465 aa  243  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  37.92 
 
 
452 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0686  aminotransferase  38.76 
 
 
429 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  36.84 
 
 
465 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3669  aminotransferase class-III  39.19 
 
 
443 aa  240  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.445293  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07656  conserved hypothetical protein  35.11 
 
 
452 aa  238  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.346872  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  34.87 
 
 
451 aa  236  9e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  35.34 
 
 
433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2675  aminotransferase  35.34 
 
 
433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  36.36 
 
 
461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  35.1 
 
 
433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  35.1 
 
 
433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  35.12 
 
 
428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1957  aminotransferase class-III  38 
 
 
436 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.796788  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  34.61 
 
 
433 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0312  aminotransferase  38.23 
 
 
436 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  34.61 
 
 
433 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  33.65 
 
 
436 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4825  aminotransferase class-III  33.17 
 
 
446 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00475157  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  34.38 
 
 
433 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  37.07 
 
 
441 aa  227  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3251  aminotransferase class-III  36.21 
 
 
428 aa  226  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  35.5 
 
 
439 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0982  aminotransferase class-III  37.53 
 
 
436 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  35.23 
 
 
439 aa  225  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  32.87 
 
 
468 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  32.87 
 
 
454 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  32.87 
 
 
454 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3343  aminotransferase class-III  35.9 
 
 
413 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.65062 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  32.87 
 
 
478 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  32.41 
 
 
454 aa  224  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  32.64 
 
 
454 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  32.87 
 
 
454 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  32.87 
 
 
454 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2046  aminotransferase class-III  35.34 
 
 
433 aa  223  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000254153 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  32.64 
 
 
479 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  36.81 
 
 
446 aa  222  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  31.63 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  35.8 
 
 
445 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  36.63 
 
 
434 aa  220  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>