More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0290 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  68.49 
 
 		 910 aa  1268    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  45.22 
 
 		 967 aa  769    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  70.76 
 
 		 970 aa  1407    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  66.36 
 
 		 976 aa  1302    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  68.01 
 
 		 976 aa  1320    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  70.45 
 
 		 970 aa  1395    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  53.89 
 
 		 974 aa  982    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  100 
 
 		 970 aa  1971    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  58.09 
 
 		 973 aa  1099    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  47.15 
 
 		 981 aa  849    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  58.29 
 
 		 975 aa  1092    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  47.15 
 
 		 981 aa  849    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  47.15 
 
 		 981 aa  846    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  67.53 
 
 		 966 aa  1302    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  45.68 
 
 		 977 aa  766    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  57.38 
 
 		 973 aa  1093    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  34.03 
 
 		 1003 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  35.3 
 
 		 994 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  32.14 
 
 		 978 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  32.84 
 
 		 1015 aa  406  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  32.81 
 
 		 1015 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  32.15 
 
 		 1015 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  40.67 
 
 		 1023 aa  329  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  40.44 
 
 		 1049 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  39.82 
 
 		 1016 aa  316  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2224  aminotransferase class-III  36.19 
 
 		 434 aa  298  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  37.01 
 
 		 1018 aa  297  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1165  aminotransferase, class III  39.1 
 
 		 427 aa  296  9e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  36.62 
 
 		 427 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52110  hypothetical protein  41.22 
 
 		 427 aa  287  8e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2538  aminotransferase class-III  36.43 
 
 		 434 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043195  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5225  aminotransferase class-III  37.41 
 
 		 427 aa  285  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0414  aminotransferase  37.56 
 
 		 416 aa  280  7e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2498  aminotransferase class-III  35.76 
 
 		 446 aa  275  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4354  aminotransferase  35.22 
 
 		 427 aa  272  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0067  aminotransferase class-III  35.41 
 
 		 447 aa  273  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2403  aminotransferase class-III  34.82 
 
 		 447 aa  270  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.634591  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  39.37 
 
 		 448 aa  266  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0048  aminotransferase class-III  34.68 
 
 		 458 aa  264  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5426  aminotransferase class-III  36.13 
 
 		 442 aa  264  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341099  normal  0.107268 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1546  aminotransferase class-III  34.04 
 
 		 448 aa  263  8.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.634671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3009  aminotransferase  37.32 
 
 		 443 aa  261  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2916  aminotransferase class-III  33.33 
 
 		 448 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1272  aminotransferase class-III  34.35 
 
 		 424 aa  259  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  35.39 
 
 		 433 aa  259  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1796  aminotransferase class-III  35.53 
 
 		 436 aa  258  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1377  aminotransferase  36.08 
 
 		 429 aa  257  8e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427783  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1957  aminotransferase class-III  38.39 
 
 		 436 aa  247  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0982  aminotransferase class-III  37.15 
 
 		 436 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5905  aminotransferase class-III  34.79 
 
 		 465 aa  244  7.999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0312  aminotransferase  37.91 
 
 		 436 aa  239  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3343  aminotransferase class-III  34.52 
 
 		 413 aa  234  6e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.65062 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  35.01 
 
 		 437 aa  231  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  33.49 
 
 		 451 aa  213  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  32.78 
 
 		 436 aa  211  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  32.04 
 
 		 432 aa  206  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2675  aminotransferase  31.26 
 
 		 433 aa  207  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2878  aminotransferase class-III  34.96 
 
 		 434 aa  207  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19268  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  32.27 
 
 		 433 aa  206  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  32.33 
 
 		 433 aa  205  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  31.88 
 
 		 433 aa  202  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  31.88 
 
 		 433 aa  202  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  31.65 
 
 		 433 aa  201  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  31.78 
 
 		 440 aa  200  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  34 
 
 		 431 aa  198  4.0000000000000005e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2046  aminotransferase class-III  31.42 
 
 		 433 aa  198  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000254153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  31.78 
 
 		 426 aa  198  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  31.19 
 
 		 433 aa  197  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  31.54 
 
 		 426 aa  197  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  30.61 
 
 		 425 aa  196  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  32.1 
 
 		 428 aa  195  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  31.6 
 
 		 461 aa  194  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4825  aminotransferase class-III  30.96 
 
 		 446 aa  194  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00475157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  31.39 
 
 		 436 aa  193  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5803  aminotransferase class-III  30.18 
 
 		 433 aa  192  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413013  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  30.84 
 
 		 425 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  30.84 
 
 		 425 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5339  aminotransferase class-III  32.29 
 
 		 437 aa  191  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  30.9 
 
 		 436 aa  190  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  34.24 
 
 		 400 aa  190  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  30.3 
 
 		 433 aa  190  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5409  aminotransferase class-III  31.22 
 
 		 452 aa  189  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2159  4-aminobutyrate aminotransferase  27.59 
 
 		 445 aa  189  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  30.37 
 
 		 425 aa  188  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  31.36 
 
 		 445 aa  187  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  30.63 
 
 		 427 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0910  4-aminobutyrate aminotransferase  31.62 
 
 		 425 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000169324  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  32.7 
 
 		 430 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  29.67 
 
 		 425 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  31.92 
 
 		 444 aa  186  3e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  32.42 
 
 		 446 aa  184  7e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  32.45 
 
 		 426 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  31.63 
 
 		 427 aa  184  9.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.96 
 
 		 397 aa  184  9.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  32.11 
 
 		 395 aa  183  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  31.83 
 
 		 440 aa  183  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2636  4-aminobutyrate aminotransferase  30.88 
 
 		 425 aa  183  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0429  4-aminobutyrate aminotransferase  32.47 
 
 		 433 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286831  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  32.15 
 
 		 418 aa  181  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  32.47 
 
 		 459 aa  181  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>