More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0067 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2916  aminotransferase class-III  78.7 
 
 		 448 aa  737    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0048  aminotransferase class-III  76.07 
 
 		 458 aa  712    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1546  aminotransferase class-III  80.27 
 
 		 448 aa  749    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.634671  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0067  aminotransferase class-III  100 
 
 		 447 aa  920    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2498  aminotransferase class-III  82.62 
 
 		 446 aa  758    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2403  aminotransferase class-III  82.88 
 
 		 447 aa  754    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.634591  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5426  aminotransferase class-III  53.83 
 
 		 442 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341099  normal  0.107268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5225  aminotransferase class-III  52.24 
 
 		 427 aa  465  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0414  aminotransferase  53.25 
 
 		 416 aa  465  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2224  aminotransferase class-III  52.66 
 
 		 434 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  52.87 
 
 		 433 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2538  aminotransferase class-III  52.28 
 
 		 434 aa  448  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043195  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5905  aminotransferase class-III  51.15 
 
 		 465 aa  435  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1796  aminotransferase class-III  50 
 
 		 436 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3009  aminotransferase  50.8 
 
 		 443 aa  427  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1272  aminotransferase class-III  47.29 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0982  aminotransferase class-III  51.51 
 
 		 436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4354  aminotransferase  47.27 
 
 		 427 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1957  aminotransferase class-III  49.77 
 
 		 436 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1165  aminotransferase, class III  47.28 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  46.48 
 
 		 427 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0312  aminotransferase  49.31 
 
 		 436 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1377  aminotransferase  46.08 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427783  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  42.12 
 
 		 1016 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  42.52 
 
 		 1023 aa  337  3.9999999999999995e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  42.28 
 
 		 1049 aa  334  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  43.1 
 
 		 978 aa  332  7.000000000000001e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3343  aminotransferase class-III  42.99 
 
 		 413 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.65062 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  41.81 
 
 		 1018 aa  323  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  41.63 
 
 		 1015 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  40.24 
 
 		 1015 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  40.67 
 
 		 1015 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  38.08 
 
 		 994 aa  279  8e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  35.68 
 
 		 966 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  35.45 
 
 		 976 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  35.8 
 
 		 1003 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  35.45 
 
 		 910 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  35.87 
 
 		 973 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  35.19 
 
 		 973 aa  273  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  35.41 
 
 		 970 aa  273  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  35.45 
 
 		 976 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52110  hypothetical protein  40.1 
 
 		 427 aa  271  2e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  35.28 
 
 		 970 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  35.96 
 
 		 970 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  36.34 
 
 		 448 aa  270  5e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  35.9 
 
 		 981 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  34.8 
 
 		 975 aa  266  5.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  35 
 
 		 977 aa  266  7e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  35.81 
 
 		 981 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  35.81 
 
 		 981 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  34.75 
 
 		 967 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  35.87 
 
 		 974 aa  253  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  33.57 
 
 		 437 aa  237  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  33.65 
 
 		 436 aa  230  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  29.78 
 
 		 478 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  31.1 
 
 		 454 aa  216  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  31.1 
 
 		 454 aa  216  9e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  31.1 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  31.1 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  29.74 
 
 		 468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  30.71 
 
 		 479 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  31.19 
 
 		 454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  30.49 
 
 		 454 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  30.48 
 
 		 454 aa  211  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  31.46 
 
 		 436 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  31.73 
 
 		 431 aa  206  6e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  29.16 
 
 		 448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  32.75 
 
 		 430 aa  200  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  29.28 
 
 		 454 aa  199  7e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  32.13 
 
 		 434 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  31.34 
 
 		 428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  31.35 
 
 		 432 aa  194  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  31.58 
 
 		 431 aa  193  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  32.94 
 
 		 431 aa  192  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0827  aminotransferase class-III  33.66 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  30.43 
 
 		 430 aa  190  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  32.39 
 
 		 430 aa  189  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  30.53 
 
 		 426 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  29.11 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  34.41 
 
 		 418 aa  189  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  30.29 
 
 		 426 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  32.14 
 
 		 419 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  33 
 
 		 427 aa  187  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  31.78 
 
 		 428 aa  187  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  31.63 
 
 		 433 aa  186  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  33 
 
 		 474 aa  186  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  31.15 
 
 		 430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  33.76 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  32.68 
 
 		 417 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  30.6 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  27.19 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  29.81 
 
 		 461 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  32.27 
 
 		 457 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  32.49 
 
 		 433 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5803  aminotransferase class-III  30.92 
 
 		 433 aa  183  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.86 
 
 		 391 aa  182  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  28.67 
 
 		 430 aa  182  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  30.48 
 
 		 451 aa  182  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  30.88 
 
 		 445 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.16 
 
 		 402 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0960288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>