More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0941 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  100 
 
 		 431 aa  872    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  57.92 
 
 		 430 aa  481  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  54.72 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  55.56 
 
 		 431 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  54.83 
 
 		 433 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2993  aminotransferase class-III  57.73 
 
 		 436 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3669  aminotransferase class-III  55.5 
 
 		 443 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.445293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  54.59 
 
 		 431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3215  aminotransferase class-III  57.49 
 
 		 436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0686  aminotransferase  56.16 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  51.41 
 
 		 436 aa  417  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  38.11 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  41.56 
 
 		 448 aa  276  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  37.88 
 
 		 430 aa  266  5e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  37.15 
 
 		 427 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  38.43 
 
 		 434 aa  256  6e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3009  aminotransferase  39.13 
 
 		 443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  38.1 
 
 		 431 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1796  aminotransferase class-III  37.5 
 
 		 436 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  35.7 
 
 		 436 aa  252  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  38.52 
 
 		 441 aa  249  6e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  35.05 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  36.16 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  37.09 
 
 		 441 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5426  aminotransferase class-III  37.74 
 
 		 442 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341099  normal  0.107268 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  37.39 
 
 		 465 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1165  aminotransferase, class III  35.41 
 
 		 427 aa  237  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  34.69 
 
 		 428 aa  234  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  35.03 
 
 		 433 aa  233  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  35.08 
 
 		 1023 aa  232  9e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2224  aminotransferase class-III  35.58 
 
 		 434 aa  232  9e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2538  aminotransferase class-III  36.17 
 
 		 434 aa  232  9e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043195  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  35.58 
 
 		 444 aa  231  1e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  34.6 
 
 		 452 aa  231  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  35.37 
 
 		 465 aa  230  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  34.78 
 
 		 1016 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  34.35 
 
 		 1018 aa  228  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  34.47 
 
 		 1049 aa  228  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4354  aminotransferase  34.05 
 
 		 427 aa  226  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  34.8 
 
 		 461 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  34.88 
 
 		 440 aa  225  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  34.63 
 
 		 1015 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  35.01 
 
 		 426 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  33.99 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  35.5 
 
 		 426 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  33.26 
 
 		 441 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  35.5 
 
 		 426 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  35.37 
 
 		 442 aa  224  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5225  aminotransferase class-III  35.89 
 
 		 427 aa  224  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  35.01 
 
 		 426 aa  223  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  34.63 
 
 		 1015 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  36.47 
 
 		 978 aa  223  6e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  35.01 
 
 		 426 aa  223  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  35.01 
 
 		 426 aa  223  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  34.25 
 
 		 1015 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  34.94 
 
 		 426 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  36.14 
 
 		 419 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  35.6 
 
 		 442 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3343  aminotransferase class-III  37.41 
 
 		 413 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.65062 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0414  aminotransferase  34.5 
 
 		 416 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  34.94 
 
 		 426 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  34.94 
 
 		 426 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  35.77 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  31.55 
 
 		 445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  35.48 
 
 		 434 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  34.93 
 
 		 394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.04 
 
 		 401 aa  220  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  36.5 
 
 		 418 aa  219  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  34.24 
 
 		 448 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.34 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  35.43 
 
 		 427 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  34.48 
 
 		 426 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  34.65 
 
 		 425 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5663  4-aminobutyrate aminotransferase  37.35 
 
 		 429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  35.2 
 
 		 427 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  35.2 
 
 		 427 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  34.65 
 
 		 425 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  34.65 
 
 		 425 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  35.56 
 
 		 399 aa  216  4e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  35.05 
 
 		 430 aa  217  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  36.41 
 
 		 446 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  36.41 
 
 		 446 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  36.41 
 
 		 446 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1377  aminotransferase  33.33 
 
 		 429 aa  216  5.9999999999999996e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427783  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  35.9 
 
 		 427 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2989  4-aminobutyrate aminotransferase  35.2 
 
 		 427 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0883038 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  34.33 
 
 		 390 aa  216  8e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  33.49 
 
 		 981 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  33.09 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4356  4-aminobutyrate aminotransferase  35.89 
 
 		 426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363071 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  34.29 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  35.41 
 
 		 446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  33.25 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  34.11 
 
 		 425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  35.87 
 
 		 425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6300  4-aminobutyrate aminotransferase  35.12 
 
 		 426 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2602  4-aminobutyrate aminotransferase  39.15 
 
 		 433 aa  213  4.9999999999999996e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  32.03 
 
 		 388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  31.69 
 
 		 454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  33.09 
 
 		 432 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>