More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6010 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  61.64 
 
 		 975 aa  1194    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  53.08 
 
 		 910 aa  923    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  45.58 
 
 		 981 aa  795    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  55.08 
 
 		 970 aa  1033    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  55.38 
 
 		 970 aa  1040    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  53.89 
 
 		 970 aa  1001    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  60.76 
 
 		 973 aa  1197    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  45.7 
 
 		 967 aa  771    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  61.48 
 
 		 973 aa  1203    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  52.94 
 
 		 976 aa  964    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  47.26 
 
 		 977 aa  786    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  45.48 
 
 		 981 aa  795    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  100 
 
 		 974 aa  1981    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  52.63 
 
 		 976 aa  966    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  45.58 
 
 		 981 aa  795    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  53.07 
 
 		 966 aa  981    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  36.15 
 
 		 994 aa  463  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  33.98 
 
 		 978 aa  430  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  31.84 
 
 		 1016 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  31.75 
 
 		 1003 aa  422  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  30.5 
 
 		 1023 aa  404  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  30.32 
 
 		 1049 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1015 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  30.3 
 
 		 1015 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  29.94 
 
 		 1015 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  38.03 
 
 		 427 aa  300  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  35.79 
 
 		 1018 aa  295  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1165  aminotransferase, class III  38.08 
 
 		 427 aa  294  5e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2224  aminotransferase class-III  37.5 
 
 		 434 aa  294  5e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2538  aminotransferase class-III  38.06 
 
 		 434 aa  292  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043195  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52110  hypothetical protein  42.05 
 
 		 427 aa  291  5.0000000000000004e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  41.67 
 
 		 448 aa  288  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2916  aminotransferase class-III  35.73 
 
 		 448 aa  280  9e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0414  aminotransferase  38.95 
 
 		 416 aa  280  9e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2403  aminotransferase class-III  36.97 
 
 		 447 aa  280  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.634591  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1546  aminotransferase class-III  36.12 
 
 		 448 aa  278  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.634671  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1796  aminotransferase class-III  37.16 
 
 		 436 aa  277  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5426  aminotransferase class-III  37.71 
 
 		 442 aa  277  9e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341099  normal  0.107268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  38.81 
 
 		 433 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5225  aminotransferase class-III  37.09 
 
 		 427 aa  274  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2498  aminotransferase class-III  36.34 
 
 		 446 aa  274  6e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0048  aminotransferase class-III  35.14 
 
 		 458 aa  269  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1272  aminotransferase class-III  34.99 
 
 		 424 aa  265  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0067  aminotransferase class-III  35.87 
 
 		 447 aa  265  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4354  aminotransferase  34.91 
 
 		 427 aa  264  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3009  aminotransferase  38.83 
 
 		 443 aa  263  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5905  aminotransferase class-III  37.04 
 
 		 465 aa  258  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1377  aminotransferase  36.47 
 
 		 429 aa  256  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427783  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3343  aminotransferase class-III  38.31 
 
 		 413 aa  250  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.65062 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  33.56 
 
 		 437 aa  234  8.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0982  aminotransferase class-III  36.95 
 
 		 436 aa  231  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1957  aminotransferase class-III  37.38 
 
 		 436 aa  228  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0312  aminotransferase  37.15 
 
 		 436 aa  228  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  34.7 
 
 		 436 aa  218  5.9999999999999996e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  32.68 
 
 		 436 aa  207  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  34.39 
 
 		 433 aa  205  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  34.39 
 
 		 433 aa  205  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  32.41 
 
 		 428 aa  205  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  33.9 
 
 		 433 aa  204  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  33.9 
 
 		 433 aa  202  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  36.23 
 
 		 430 aa  202  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  33.9 
 
 		 433 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  33.9 
 
 		 433 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2675  aminotransferase  33.9 
 
 		 433 aa  201  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  34.59 
 
 		 451 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5803  aminotransferase class-III  33.41 
 
 		 433 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  36.43 
 
 		 431 aa  197  7e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4825  aminotransferase class-III  32.85 
 
 		 446 aa  197  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00475157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  32.52 
 
 		 432 aa  194  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  31.45 
 
 		 445 aa  193  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  30.31 
 
 		 452 aa  193  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  31.13 
 
 		 427 aa  192  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2878  aminotransferase class-III  35.21 
 
 		 434 aa  191  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19268  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  33.86 
 
 		 459 aa  190  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5339  aminotransferase class-III  33.33 
 
 		 437 aa  189  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  30.32 
 
 		 461 aa  189  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  33.33 
 
 		 436 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  34.22 
 
 		 446 aa  187  9e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.47 
 
 		 393 aa  187  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  30.69 
 
 		 465 aa  186  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5409  aminotransferase class-III  31.65 
 
 		 452 aa  185  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2046  aminotransferase class-III  33.5 
 
 		 433 aa  184  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000254153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  31.59 
 
 		 465 aa  181  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  32.05 
 
 		 463 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  31.15 
 
 		 456 aa  180  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  32.23 
 
 		 418 aa  179  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1673  aminotransferase  33.66 
 
 		 450 aa  178  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0301264  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4189  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  31.28 
 
 		 462 aa  178  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4253  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  31.28 
 
 		 462 aa  178  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3861  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  31.42 
 
 		 462 aa  177  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  33.56 
 
 		 479 aa  177  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  33.9 
 
 		 449 aa  177  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4028  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  31.42 
 
 		 462 aa  177  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4341  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate transaminase  31.42 
 
 		 462 aa  177  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3671  aminotransferase  33.9 
 
 		 450 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0477751  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  33.66 
 
 		 449 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  33.66 
 
 		 450 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  29.41 
 
 		 445 aa  177  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  30.1 
 
 		 426 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  31.49 
 
 		 426 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>