More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2601 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  70.48 
 
 		 1049 aa  1515    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  92.41 
 
 		 1015 aa  1957    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  39.92 
 
 		 994 aa  669    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  70.58 
 
 		 1023 aa  1517    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  70.57 
 
 		 1016 aa  1511    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  100 
 
 		 1015 aa  2089    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  92.61 
 
 		 1015 aa  1956    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  38.3 
 
 		 1003 aa  655    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  61.83 
 
 		 1018 aa  1278    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  39.58 
 
 		 978 aa  672    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  31.75 
 
 		 970 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  31.23 
 
 		 970 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  31.89 
 
 		 975 aa  401  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  32.15 
 
 		 970 aa  392  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  30.73 
 
 		 973 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  31.4 
 
 		 973 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2224  aminotransferase class-III  45.63 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  47.78 
 
 		 427 aa  379  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1165  aminotransferase, class III  46.82 
 
 		 427 aa  376  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5426  aminotransferase class-III  45.22 
 
 		 442 aa  372  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341099  normal  0.107268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5225  aminotransferase class-III  45.97 
 
 		 427 aa  368  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  29.94 
 
 		 974 aa  369  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0414  aminotransferase  46.14 
 
 		 416 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2538  aminotransferase class-III  44.44 
 
 		 434 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043195  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1272  aminotransferase class-III  46.12 
 
 		 424 aa  366  1e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1796  aminotransferase class-III  44.8 
 
 		 436 aa  356  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4354  aminotransferase  42.66 
 
 		 427 aa  351  3e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1377  aminotransferase  44.06 
 
 		 429 aa  347  7e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427783  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  44.66 
 
 		 433 aa  345  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  29.37 
 
 		 966 aa  343  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  29.82 
 
 		 910 aa  330  9e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3009  aminotransferase  45.13 
 
 		 443 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5905  aminotransferase class-III  40.17 
 
 		 465 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0048  aminotransferase class-III  42.02 
 
 		 458 aa  324  6e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52110  hypothetical protein  44.2 
 
 		 427 aa  322  1.9999999999999998e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0067  aminotransferase class-III  41.63 
 
 		 447 aa  316  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2498  aminotransferase class-III  42.14 
 
 		 446 aa  316  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2403  aminotransferase class-III  42.38 
 
 		 447 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.634591  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  42.22 
 
 		 448 aa  315  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2916  aminotransferase class-III  41.19 
 
 		 448 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1957  aminotransferase class-III  44.52 
 
 		 436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1546  aminotransferase class-III  40.95 
 
 		 448 aa  308  3e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.634671  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0312  aminotransferase  44.32 
 
 		 436 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  38.94 
 
 		 981 aa  304  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  38.72 
 
 		 981 aa  302  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  38.72 
 
 		 981 aa  302  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  37 
 
 		 977 aa  301  6e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0982  aminotransferase class-III  42.79 
 
 		 436 aa  299  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3343  aminotransferase class-III  41.78 
 
 		 413 aa  294  5e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.65062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  37.05 
 
 		 967 aa  288  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  32.46 
 
 		 976 aa  273  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  34.44 
 
 		 976 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  35.31 
 
 		 437 aa  233  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2539  aminoglycoside phosphotransferase  38.17 
 
 		 373 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0686705  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  34.25 
 
 		 431 aa  219  2.9999999999999998e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0983  aminoglycoside phosphotransferase  42.67 
 
 		 345 aa  218  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.904238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  35.45 
 
 		 436 aa  217  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2225  aminoglycoside phosphotransferase  37.43 
 
 		 374 aa  214  7.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0311  putative aminotransferase protein  42.67 
 
 		 371 aa  209  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.452775  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  31.65 
 
 		 461 aa  207  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1956  aminoglycoside phosphotransferase  42.02 
 
 		 345 aa  206  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.92621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0415  aminoglycoside phosphotransferase  36.66 
 
 		 360 aa  204  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1273  aminoglycoside phosphotransferase  36.99 
 
 		 349 aa  203  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.98058  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  31.69 
 
 		 436 aa  202  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  33.26 
 
 		 446 aa  197  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  32.57 
 
 		 427 aa  195  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  31.76 
 
 		 430 aa  192  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  31.66 
 
 		 465 aa  187  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  30.21 
 
 		 428 aa  187  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  33.11 
 
 		 434 aa  187  8e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5226  aminoglycoside phosphotransferase  39.44 
 
 		 351 aa  187  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  30.18 
 
 		 431 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  30.3 
 
 		 441 aa  185  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  30.9 
 
 		 465 aa  184  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  31.49 
 
 		 436 aa  184  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  29.52 
 
 		 454 aa  182  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  30.54 
 
 		 448 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  30.73 
 
 		 444 aa  182  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  32.94 
 
 		 451 aa  182  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.17 
 
 		 391 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  32.06 
 
 		 433 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  31.9 
 
 		 430 aa  181  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  31.89 
 
 		 433 aa  181  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  29.19 
 
 		 454 aa  180  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  30.5 
 
 		 431 aa  180  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5339  aminotransferase class-III  33.99 
 
 		 437 aa  180  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  29.19 
 
 		 454 aa  179  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  29.26 
 
 		 454 aa  179  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  29.26 
 
 		 478 aa  179  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  29.26 
 
 		 454 aa  179  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5409  aminotransferase class-III  33.59 
 
 		 452 aa  179  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  29.26 
 
 		 454 aa  179  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  29.19 
 
 		 468 aa  178  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5425  aminoglycoside phosphotransferase  36.28 
 
 		 362 aa  178  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628583  normal  0.0994203 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  32.94 
 
 		 433 aa  178  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  28.95 
 
 		 479 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  32.33 
 
 		 432 aa  176  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3669  aminotransferase class-III  30.77 
 
 		 443 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.445293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2675  aminotransferase  33.97 
 
 		 433 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  32.61 
 
 		 433 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>