More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3725 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  45.97 
 
 		 981 aa  819    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  92.2 
 
 		 910 aa  1705    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  55.6 
 
 		 973 aa  1040    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  86.93 
 
 		 966 aa  1711    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  67.18 
 
 		 970 aa  1281    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  90.06 
 
 		 976 aa  1795    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  44.37 
 
 		 977 aa  769    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  66.91 
 
 		 970 aa  1266    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  66.36 
 
 		 970 aa  1302    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  55.81 
 
 		 973 aa  1052    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  45.66 
 
 		 967 aa  777    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  45.76 
 
 		 981 aa  815    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  55.74 
 
 		 975 aa  1028    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  100 
 
 		 976 aa  1988    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  52.63 
 
 		 974 aa  948    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  45.76 
 
 		 981 aa  815    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  34.1 
 
 		 1003 aa  461  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  34.27 
 
 		 994 aa  427  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  32.55 
 
 		 978 aa  423  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  40.94 
 
 		 1049 aa  315  2.9999999999999996e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  40.49 
 
 		 1023 aa  314  4.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  40.69 
 
 		 1016 aa  310  9e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2224  aminotransferase class-III  37.2 
 
 		 434 aa  297  7e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  36.04 
 
 		 1018 aa  292  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0414  aminotransferase  38.81 
 
 		 416 aa  293  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  36.45 
 
 		 427 aa  290  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1165  aminotransferase, class III  37.88 
 
 		 427 aa  290  9e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5225  aminotransferase class-III  37.65 
 
 		 427 aa  290  9e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2538  aminotransferase class-III  37.2 
 
 		 434 aa  287  5.999999999999999e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043195  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4354  aminotransferase  36.68 
 
 		 427 aa  281  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5426  aminotransferase class-III  38.63 
 
 		 442 aa  280  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341099  normal  0.107268 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2916  aminotransferase class-III  35.53 
 
 		 448 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1546  aminotransferase class-III  36 
 
 		 448 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.634671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3009  aminotransferase  39.46 
 
 		 443 aa  276  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52110  hypothetical protein  40.49 
 
 		 427 aa  275  3e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  34.73 
 
 		 1015 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  34.73 
 
 		 1015 aa  271  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0067  aminotransferase class-III  35.45 
 
 		 447 aa  271  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2403  aminotransferase class-III  36 
 
 		 447 aa  271  5e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.634591  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2498  aminotransferase class-III  35.68 
 
 		 446 aa  270  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  37.62 
 
 		 433 aa  269  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  34.44 
 
 		 1015 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1796  aminotransferase class-III  36.17 
 
 		 436 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  37.1 
 
 		 448 aa  268  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0048  aminotransferase class-III  35.15 
 
 		 458 aa  266  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1272  aminotransferase class-III  34.2 
 
 		 424 aa  262  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1377  aminotransferase  35.46 
 
 		 429 aa  246  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427783  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3343  aminotransferase class-III  37.31 
 
 		 413 aa  244  7.999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.65062 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1957  aminotransferase class-III  37.24 
 
 		 436 aa  239  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5905  aminotransferase class-III  34.43 
 
 		 465 aa  239  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0312  aminotransferase  37.24 
 
 		 436 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0982  aminotransferase class-III  36.34 
 
 		 436 aa  233  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  32.11 
 
 		 437 aa  221  6e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  32.35 
 
 		 451 aa  196  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  31.39 
 
 		 436 aa  194  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  31.18 
 
 		 433 aa  190  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  29.86 
 
 		 433 aa  188  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  31.24 
 
 		 433 aa  188  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2675  aminotransferase  30.38 
 
 		 433 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  31.72 
 
 		 431 aa  187  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  29.86 
 
 		 433 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  29.86 
 
 		 433 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2878  aminotransferase class-III  32.35 
 
 		 434 aa  185  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19268  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  30.47 
 
 		 445 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5803  aminotransferase class-III  30.44 
 
 		 433 aa  185  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  29.4 
 
 		 433 aa  183  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  29.93 
 
 		 428 aa  180  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  33.02 
 
 		 430 aa  180  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  29.17 
 
 		 436 aa  180  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  28.67 
 
 		 425 aa  180  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2046  aminotransferase class-III  30.05 
 
 		 433 aa  179  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000254153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  30.1 
 
 		 432 aa  179  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  31.16 
 
 		 427 aa  178  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  28.44 
 
 		 425 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  28.44 
 
 		 425 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  32.01 
 
 		 400 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  28.57 
 
 		 461 aa  176  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3215  aminotransferase class-III  31.53 
 
 		 436 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  28.84 
 
 		 426 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  28.84 
 
 		 426 aa  174  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  27.97 
 
 		 425 aa  174  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  30.96 
 
 		 446 aa  174  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  30.58 
 
 		 433 aa  173  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  28.6 
 
 		 440 aa  173  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2993  aminotransferase class-III  31.46 
 
 		 436 aa  172  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  32.57 
 
 		 433 aa  172  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  29.3 
 
 		 427 aa  172  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.05 
 
 		 397 aa  172  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3251  aminotransferase class-III  29.44 
 
 		 428 aa  171  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2159  4-aminobutyrate aminotransferase  25.53 
 
 		 445 aa  171  6e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4825  aminotransferase class-III  28.68 
 
 		 446 aa  171  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00475157  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5409  aminotransferase class-III  29.27 
 
 		 452 aa  170  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  28.85 
 
 		 436 aa  170  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2626  4-aminobutyrate aminotransferase  26.22 
 
 		 445 aa  169  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.805613  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2680  4-aminobutyrate aminotransferase  26.22 
 
 		 445 aa  169  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  30.7 
 
 		 426 aa  169  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  30.14 
 
 		 427 aa  169  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  29.77 
 
 		 431 aa  169  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0910  4-aminobutyrate aminotransferase  29.7 
 
 		 425 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000169324  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  27.8 
 
 		 425 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>