More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4438 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA1165  aminotransferase, class III  82.9 
 
 		 427 aa  745    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  100 
 
 		 427 aa  879    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1377  aminotransferase  63.66 
 
 		 429 aa  554  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427783  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4354  aminotransferase  56.91 
 
 		 427 aa  503  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3343  aminotransferase class-III  59.52 
 
 		 413 aa  481  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.65062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5225  aminotransferase class-III  55.21 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0414  aminotransferase  55.02 
 
 		 416 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2224  aminotransferase class-III  50.82 
 
 		 434 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5426  aminotransferase class-III  55.88 
 
 		 442 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341099  normal  0.107268 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2538  aminotransferase class-III  50.35 
 
 		 434 aa  444  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043195  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  51.19 
 
 		 433 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1796  aminotransferase class-III  52.35 
 
 		 436 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1272  aminotransferase class-III  48.36 
 
 		 424 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5905  aminotransferase class-III  50.71 
 
 		 465 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  50.94 
 
 		 1016 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3009  aminotransferase  50.7 
 
 		 443 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  49.65 
 
 		 1049 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  49.53 
 
 		 1023 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0067  aminotransferase class-III  46.48 
 
 		 447 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2916  aminotransferase class-III  46.34 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  47.78 
 
 		 1015 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  46.37 
 
 		 1018 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  47.06 
 
 		 1015 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1546  aminotransferase class-III  45.86 
 
 		 448 aa  376  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.634671  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  46.26 
 
 		 1015 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0048  aminotransferase class-III  44.79 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1957  aminotransferase class-III  51.41 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2498  aminotransferase class-III  45.09 
 
 		 446 aa  361  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0312  aminotransferase  50.94 
 
 		 436 aa  358  8e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0982  aminotransferase class-III  50.48 
 
 		 436 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2403  aminotransferase class-III  43.29 
 
 		 447 aa  356  5.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.634591  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  43.33 
 
 		 978 aa  332  9e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  37.35 
 
 		 970 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  38.03 
 
 		 973 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  36.43 
 
 		 970 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  38.17 
 
 		 1003 aa  295  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  38.14 
 
 		 975 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  37.56 
 
 		 973 aa  292  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  36.45 
 
 		 976 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  39.07 
 
 		 981 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  38.55 
 
 		 981 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  38.55 
 
 		 981 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  36.45 
 
 		 910 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  36.45 
 
 		 976 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  35.9 
 
 		 966 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  38.97 
 
 		 994 aa  289  8e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  36.62 
 
 		 970 aa  288  9e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  37.88 
 
 		 977 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  38.03 
 
 		 974 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  37.94 
 
 		 967 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  39.58 
 
 		 448 aa  282  7.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52110  hypothetical protein  39.3 
 
 		 427 aa  273  3e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  38.1 
 
 		 436 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  37.15 
 
 		 431 aa  248  1e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  35.25 
 
 		 437 aa  244  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  35.15 
 
 		 431 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  32.95 
 
 		 430 aa  219  5e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  32.42 
 
 		 428 aa  217  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  36.3 
 
 		 418 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  33.77 
 
 		 457 aa  211  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  32.77 
 
 		 433 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  32.77 
 
 		 433 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  33.56 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2675  aminotransferase  33.83 
 
 		 433 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  33.25 
 
 		 451 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  32.11 
 
 		 445 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  35.78 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  33.64 
 
 		 433 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  32.76 
 
 		 433 aa  203  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  33.25 
 
 		 433 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  33.04 
 
 		 465 aa  203  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  33.25 
 
 		 433 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.21 
 
 		 391 aa  202  9e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  32.66 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  32.93 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  32.54 
 
 		 444 aa  200  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  32.28 
 
 		 434 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  33.1 
 
 		 430 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  33.09 
 
 		 419 aa  199  9e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  31.73 
 
 		 465 aa  199  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  32.34 
 
 		 430 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  31.03 
 
 		 432 aa  197  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  33.65 
 
 		 428 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  32.12 
 
 		 431 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  34.6 
 
 		 439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  31.65 
 
 		 427 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2046  aminotransferase class-III  32.44 
 
 		 433 aa  196  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000254153 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  30.64 
 
 		 461 aa  196  9e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  31.65 
 
 		 427 aa  196  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  31.12 
 
 		 426 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  31.12 
 
 		 426 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  31.07 
 
 		 434 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  31.02 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  32.78 
 
 		 446 aa  193  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2989  4-aminobutyrate aminotransferase  31.42 
 
 		 427 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0883038 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  30.89 
 
 		 426 aa  193  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  31.42 
 
 		 427 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  30.89 
 
 		 426 aa  192  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  32 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  31.37 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>