More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5905 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5905  aminotransferase class-III  100 
 
 		 465 aa  952    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5426  aminotransferase class-III  56.32 
 
 		 442 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341099  normal  0.107268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5225  aminotransferase class-III  54.31 
 
 		 427 aa  455  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  54.94 
 
 		 433 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0414  aminotransferase  55.05 
 
 		 416 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1796  aminotransferase class-III  52.29 
 
 		 436 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0048  aminotransferase class-III  50.8 
 
 		 458 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1546  aminotransferase class-III  51.38 
 
 		 448 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.634671  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2224  aminotransferase class-III  53.7 
 
 		 434 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2916  aminotransferase class-III  51.5 
 
 		 448 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2538  aminotransferase class-III  53.08 
 
 		 434 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043195  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0067  aminotransferase class-III  51.15 
 
 		 447 aa  435  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2498  aminotransferase class-III  51.57 
 
 		 446 aa  432  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2403  aminotransferase class-III  51.92 
 
 		 447 aa  429  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.634591  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1272  aminotransferase class-III  50.47 
 
 		 424 aa  421  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1957  aminotransferase class-III  54.88 
 
 		 436 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0312  aminotransferase  55.1 
 
 		 436 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3009  aminotransferase  50.35 
 
 		 443 aa  412  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0982  aminotransferase class-III  54.2 
 
 		 436 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  50.71 
 
 		 427 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1165  aminotransferase, class III  49.77 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1377  aminotransferase  49.88 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427783  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4354  aminotransferase  44.55 
 
 		 427 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  40.76 
 
 		 1023 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  40.97 
 
 		 1016 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  41.09 
 
 		 1049 aa  334  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  40.17 
 
 		 1015 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  40.55 
 
 		 1015 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  39.37 
 
 		 1018 aa  323  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3343  aminotransferase class-III  45.61 
 
 		 413 aa  322  9.000000000000001e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.65062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  40.34 
 
 		 1015 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  42.75 
 
 		 978 aa  313  3.9999999999999997e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  42.4 
 
 		 994 aa  296  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  38.83 
 
 		 1003 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  38.24 
 
 		 981 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  38 
 
 		 981 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  38 
 
 		 981 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  36.82 
 
 		 977 aa  254  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52110  hypothetical protein  39.31 
 
 		 427 aa  250  3e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  37.21 
 
 		 448 aa  249  7e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  37.04 
 
 		 974 aa  249  9e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  36.19 
 
 		 967 aa  246  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  35.45 
 
 		 973 aa  246  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  34.79 
 
 		 970 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  32.91 
 
 		 970 aa  242  9e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  33.48 
 
 		 970 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  34.51 
 
 		 973 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  34.2 
 
 		 910 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  34.43 
 
 		 976 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  34.2 
 
 		 976 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  35.31 
 
 		 975 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  33.8 
 
 		 966 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  34.94 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  33.41 
 
 		 437 aa  220  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  33.33 
 
 		 431 aa  208  1e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  34.03 
 
 		 457 aa  204  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  33.66 
 
 		 436 aa  203  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3215  aminotransferase class-III  33.73 
 
 		 436 aa  195  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  32.94 
 
 		 431 aa  192  9e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  31.82 
 
 		 431 aa  190  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  32.45 
 
 		 431 aa  189  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2993  aminotransferase class-III  33.49 
 
 		 436 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  30.87 
 
 		 451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  31.96 
 
 		 433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  31.94 
 
 		 430 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  28 
 
 		 450 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  32.45 
 
 		 452 aa  179  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  33.74 
 
 		 418 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  28 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  27.78 
 
 		 450 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  28 
 
 		 449 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  28 
 
 		 449 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  27.78 
 
 		 449 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  31.93 
 
 		 465 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  27.78 
 
 		 449 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  27.78 
 
 		 450 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1673  aminotransferase  27.94 
 
 		 450 aa  176  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0301264  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0926  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  32.23 
 
 		 454 aa  175  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0888484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3671  aminotransferase  27.33 
 
 		 450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0477751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  32.08 
 
 		 419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  31.36 
 
 		 444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3669  aminotransferase class-III  33.33 
 
 		 443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.445293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  30.77 
 
 		 430 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  29.6 
 
 		 428 aa  173  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1331  aminotransferase  28.07 
 
 		 451 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  34.04 
 
 		 448 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  34.04 
 
 		 448 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  33.33 
 
 		 472 aa  171  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  31.55 
 
 		 434 aa  171  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  32.71 
 
 		 448 aa  170  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  30.68 
 
 		 446 aa  169  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5339  aminotransferase class-III  31.67 
 
 		 437 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0199  4-aminobutyrate aminotransferase  30.54 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00118095  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1120  aminotransferase class-III  29.02 
 
 		 446 aa  167  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.020832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  28.12 
 
 		 448 aa  167  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  31.87 
 
 		 474 aa  166  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2523  aminotransferase class-III  29.38 
 
 		 443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  31.22 
 
 		 448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  31.22 
 
 		 448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  30.56 
 
 		 465 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>