More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3251 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3251  aminotransferase class-III  100 
 
 		 428 aa  867    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4825  aminotransferase class-III  69.79 
 
 		 446 aa  595  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00475157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  65.96 
 
 		 436 aa  575  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5409  aminotransferase class-III  69.62 
 
 		 452 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  67.63 
 
 		 432 aa  567  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5803  aminotransferase class-III  65.88 
 
 		 433 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2675  aminotransferase  62.21 
 
 		 433 aa  528  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  61.97 
 
 		 433 aa  522  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  61.5 
 
 		 433 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  61.5 
 
 		 433 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2878  aminotransferase class-III  65.71 
 
 		 434 aa  521  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19268  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  61.74 
 
 		 433 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  61.74 
 
 		 433 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  61.74 
 
 		 433 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2046  aminotransferase class-III  61.65 
 
 		 433 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000254153 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  58.45 
 
 		 451 aa  500  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0839  aminotransferase  53.32 
 
 		 445 aa  479  1e-134  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.33368  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07656  conserved hypothetical protein  52.11 
 
 		 452 aa  455  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.346872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1466  aminotransferase  64.18 
 
 		 329 aa  350  3e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  35.84 
 
 		 448 aa  224  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  35.78 
 
 		 465 aa  224  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  34.59 
 
 		 465 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  33.33 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5339  aminotransferase class-III  37.17 
 
 		 437 aa  211  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  34.69 
 
 		 448 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  34.69 
 
 		 448 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  33.1 
 
 		 452 aa  205  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  34.72 
 
 		 418 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  35.31 
 
 		 978 aa  202  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  32.13 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  32.13 
 
 		 478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  32.42 
 
 		 454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  31.89 
 
 		 454 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  35.29 
 
 		 430 aa  200  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  32.13 
 
 		 454 aa  201  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  32.13 
 
 		 479 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  34.62 
 
 		 439 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  32.13 
 
 		 454 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  32.13 
 
 		 454 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  32.13 
 
 		 454 aa  200  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0662  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  34.5 
 
 		 462 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00898604  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  32.46 
 
 		 428 aa  199  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  32.37 
 
 		 454 aa  199  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  35.28 
 
 		 440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  34.29 
 
 		 430 aa  198  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  34.75 
 
 		 441 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  30.86 
 
 		 441 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  31.57 
 
 		 427 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0213  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  36 
 
 		 457 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  32.68 
 
 		 437 aa  196  8.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  33.02 
 
 		 464 aa  196  9e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  33.74 
 
 		 474 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  32.69 
 
 		 445 aa  193  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  33.57 
 
 		 434 aa  193  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  33.71 
 
 		 444 aa  193  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  32.53 
 
 		 436 aa  193  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3443  aminotransferase class-III  30.35 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000605746  normal  0.17806 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  33.49 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  33.33 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  31.99 
 
 		 464 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  33.81 
 
 		 434 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.19 
 
 		 399 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4493  aminotransferase class-III  35.99 
 
 		 436 aa  190  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906001  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  33.33 
 
 		 432 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  29.98 
 
 		 454 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  33.88 
 
 		 396 aa  189  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  31.35 
 
 		 461 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  33.09 
 
 		 419 aa  189  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0564  Acetylornithine transaminase  34.13 
 
 		 461 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.129985 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3009  aminotransferase  34.79 
 
 		 443 aa  187  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  34.83 
 
 		 433 aa  187  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  33.65 
 
 		 426 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  33.65 
 
 		 426 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3494  4-aminobutyrate aminotransferase  34.89 
 
 		 424 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.782932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  36.32 
 
 		 432 aa  186  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0429  4-aminobutyrate aminotransferase  34.04 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286831  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  32.14 
 
 		 397 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2679  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  33.8 
 
 		 460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000398425  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  33.09 
 
 		 439 aa  185  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0048  aminotransferase class-III  31.88 
 
 		 458 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  30.75 
 
 		 427 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  32.61 
 
 		 981 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  32.61 
 
 		 981 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  32.61 
 
 		 981 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  32.29 
 
 		 417 aa  183  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0539  aminotransferase class-III  32.39 
 
 		 440 aa  182  7e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  31.66 
 
 		 457 aa  182  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  32.61 
 
 		 446 aa  182  8.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5225  aminotransferase class-III  34.46 
 
 		 427 aa  182  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00880  ornithine-oxo-acid aminotransferase, putative  31.89 
 
 		 476 aa  182  9.000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0414  aminotransferase  34.2 
 
 		 416 aa  182  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2355  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  32.79 
 
 		 460 aa  182  9.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0339571  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  32.37 
 
 		 435 aa  182  9.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2060  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  32.79 
 
 		 460 aa  182  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00222981  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2839  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  32.02 
 
 		 493 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000267861  normal  0.189909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2210  acetylornithine transaminase  30.84 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1438  aminotransferase class-III  32.7 
 
 		 444 aa  181  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4054  aminotransferase  34.35 
 
 		 540 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0514  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  35.1 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  36.36 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.161601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>