More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1466 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1466  aminotransferase  100 
 
 
329 aa  670    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2675  aminotransferase  83.94 
 
 
433 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0665  aminotransferase  83.58 
 
 
433 aa  474  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.459907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2878  aminotransferase class-III  82.55 
 
 
434 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19268  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  82.85 
 
 
433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4418  aminotransferase class-III  83.21 
 
 
433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0107565 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  82.85 
 
 
433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4936  aminotransferase class-III  83.21 
 
 
433 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  82.12 
 
 
433 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2046  aminotransferase class-III  83.21 
 
 
433 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000254153 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  73.82 
 
 
451 aa  411  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  66.18 
 
 
436 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4825  aminotransferase class-III  64.06 
 
 
446 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00475157  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5409  aminotransferase class-III  69.03 
 
 
452 aa  368  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5803  aminotransferase class-III  66.17 
 
 
433 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.413013  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  64.62 
 
 
432 aa  349  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3251  aminotransferase class-III  64.18 
 
 
428 aa  342  5e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07656  conserved hypothetical protein  56.34 
 
 
452 aa  323  3e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.346872  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0839  aminotransferase  54.48 
 
 
445 aa  305  7e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.33368  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  41.8 
 
 
437 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  35.33 
 
 
438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  37.7 
 
 
436 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  38.34 
 
 
418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0662  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  38.97 
 
 
462 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00898604  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  34.67 
 
 
448 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  34.67 
 
 
448 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  35.34 
 
 
439 aa  155  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0701  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.16 
 
 
410 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520056  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.44 
 
 
397 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1180  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.78 
 
 
410 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4074  aminotransferase class-III  36.61 
 
 
443 aa  153  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  37.25 
 
 
445 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4291  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.23 
 
 
410 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2866  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.69 
 
 
410 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1736  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.69 
 
 
410 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143405  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0591  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.69 
 
 
410 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2124  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.46 
 
 
410 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.975893  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2847  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.69 
 
 
410 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2785  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.69 
 
 
410 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2425  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.69 
 
 
410 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725646  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0275  4-aminobutyrate aminotransferase  35.45 
 
 
417 aa  152  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1996  aminotransferase class-III  39.53 
 
 
434 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.026551  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2727  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.38 
 
 
410 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  34.4 
 
 
430 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1787  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.35 
 
 
409 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1061  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.23 
 
 
410 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.964628  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0034  hypothetical protein  34.92 
 
 
441 aa  149  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1775  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.23 
 
 
411 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664584  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  35.4 
 
 
438 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1157  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.02 
 
 
410 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.861166  normal  0.0351204 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  36.08 
 
 
419 aa  149  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2923  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  38.49 
 
 
411 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.689777  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  36.9 
 
 
439 aa  149  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  35.71 
 
 
434 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  33.22 
 
 
434 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  37.3 
 
 
475 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1061  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  39.23 
 
 
410 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.637479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  35.69 
 
 
428 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  33.84 
 
 
464 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  32.55 
 
 
454 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1558  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  36.98 
 
 
411 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751074  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  35.71 
 
 
427 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4211  4-aminobutyrate aminotransferase  35.38 
 
 
425 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225868  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  36.57 
 
 
440 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  32.55 
 
 
479 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  32.55 
 
 
468 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  32.55 
 
 
478 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  34.53 
 
 
465 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  33.87 
 
 
435 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  32.55 
 
 
454 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  37.16 
 
 
436 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  35.41 
 
 
396 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  34.39 
 
 
417 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  32.16 
 
 
454 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  35.87 
 
 
451 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4054  aminotransferase  36.09 
 
 
540 aa  146  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  32.55 
 
 
454 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  32.55 
 
 
454 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  32.55 
 
 
454 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4128  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.97 
 
 
396 aa  145  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0278283  decreased coverage  0.00000134579 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  34.25 
 
 
448 aa  145  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  34.89 
 
 
465 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  32.16 
 
 
454 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  36.26 
 
 
453 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  32.54 
 
 
464 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  37.21 
 
 
444 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  37.3 
 
 
446 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  33.46 
 
 
452 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1757  aminotransferase  34.92 
 
 
425 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.744583  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  34.57 
 
 
442 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  31.43 
 
 
396 aa  143  4e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  34.06 
 
 
432 aa  143  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0564  Acetylornithine transaminase  33.69 
 
 
461 aa  143  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.129985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  34.39 
 
 
431 aa  142  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00920  aminotransferase  34.26 
 
 
463 aa  142  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3443  aminotransferase class-III  30.65 
 
 
450 aa  142  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000605746  normal  0.17806 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0819  aminotransferase class-III  36.9 
 
 
475 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.149442  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0412  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.98 
 
 
465 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.481167  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  35.06 
 
 
446 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  36.19 
 
 
446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>