More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2578 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  61.67 
 
 		 1015 aa  1308    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  66.24 
 
 		 1023 aa  1398    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  61.67 
 
 		 1015 aa  1304    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  39.82 
 
 		 994 aa  667    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  61.83 
 
 		 1015 aa  1314    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  66.15 
 
 		 1049 aa  1396    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  39.37 
 
 		 1003 aa  683    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  100 
 
 		 1018 aa  2068    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  67.68 
 
 		 1016 aa  1419    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  40.87 
 
 		 978 aa  692    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  33.46 
 
 		 973 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  33.1 
 
 		 973 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  33.01 
 
 		 975 aa  436  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  31.47 
 
 		 970 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  30.94 
 
 		 970 aa  399  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5225  aminotransferase class-III  48.96 
 
 		 427 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  30.33 
 
 		 976 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1165  aminotransferase, class III  46.84 
 
 		 427 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  46.37 
 
 		 427 aa  379  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0414  aminotransferase  48.58 
 
 		 416 aa  378  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2224  aminotransferase class-III  46.12 
 
 		 434 aa  375  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2538  aminotransferase class-III  45.35 
 
 		 434 aa  372  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043195  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4354  aminotransferase  43.09 
 
 		 427 aa  363  7.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  30.26 
 
 		 967 aa  363  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1377  aminotransferase  44.78 
 
 		 429 aa  358  2.9999999999999997e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427783  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5426  aminotransferase class-III  47.68 
 
 		 442 aa  357  7.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341099  normal  0.107268 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1272  aminotransferase class-III  45.28 
 
 		 424 aa  351  4e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  43.66 
 
 		 433 aa  347  6e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52110  hypothetical protein  45.21 
 
 		 427 aa  340  9e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3009  aminotransferase  45.67 
 
 		 443 aa  332  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  44.14 
 
 		 448 aa  332  3e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1796  aminotransferase class-III  42.52 
 
 		 436 aa  330  7e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0048  aminotransferase class-III  42.35 
 
 		 458 aa  325  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5905  aminotransferase class-III  39.37 
 
 		 465 aa  323  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0067  aminotransferase class-III  41.81 
 
 		 447 aa  323  8e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  42.54 
 
 		 981 aa  321  5e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  42.29 
 
 		 981 aa  319  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  42.29 
 
 		 981 aa  319  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2916  aminotransferase class-III  42.86 
 
 		 448 aa  314  4.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2403  aminotransferase class-III  41.98 
 
 		 447 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.634591  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1546  aminotransferase class-III  42.37 
 
 		 448 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.634671  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2498  aminotransferase class-III  41.43 
 
 		 446 aa  308  4.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  39.05 
 
 		 977 aa  302  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1957  aminotransferase class-III  44.26 
 
 		 436 aa  299  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  37.01 
 
 		 970 aa  297  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0312  aminotransferase  44.06 
 
 		 436 aa  296  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3343  aminotransferase class-III  41.08 
 
 		 413 aa  296  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.65062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  36.04 
 
 		 976 aa  292  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  39.5 
 
 		 966 aa  288  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  35.85 
 
 		 910 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0982  aminotransferase class-III  43.12 
 
 		 436 aa  285  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  35.5 
 
 		 974 aa  280  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  36.18 
 
 		 437 aa  253  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  36.02 
 
 		 436 aa  223  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2225  aminoglycoside phosphotransferase  38.28 
 
 		 374 aa  222  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0415  aminoglycoside phosphotransferase  39.82 
 
 		 360 aa  222  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  34.35 
 
 		 431 aa  222  3e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2539  aminoglycoside phosphotransferase  37.83 
 
 		 373 aa  214  5.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0686705  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  31.8 
 
 		 436 aa  212  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  33.94 
 
 		 446 aa  211  6e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  33.1 
 
 		 461 aa  210  9e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  32.65 
 
 		 428 aa  209  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  34.02 
 
 		 465 aa  208  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  31.86 
 
 		 441 aa  207  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1956  aminoglycoside phosphotransferase  43.05 
 
 		 345 aa  207  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.92621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1273  aminoglycoside phosphotransferase  37.19 
 
 		 349 aa  206  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.98058  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0311  putative aminotransferase protein  42.72 
 
 		 371 aa  207  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.452775  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  31.47 
 
 		 431 aa  202  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5226  aminoglycoside phosphotransferase  40.07 
 
 		 351 aa  201  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0983  aminoglycoside phosphotransferase  41.06 
 
 		 345 aa  201  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.904238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  31.04 
 
 		 454 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  30.27 
 
 		 454 aa  198  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  35.04 
 
 		 419 aa  198  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  30.57 
 
 		 454 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  30.27 
 
 		 468 aa  198  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  30.57 
 
 		 478 aa  197  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  34.02 
 
 		 457 aa  197  8.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  30.57 
 
 		 454 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  33.11 
 
 		 465 aa  197  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  30.57 
 
 		 454 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  30.94 
 
 		 479 aa  197  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07656  conserved hypothetical protein  31.69 
 
 		 452 aa  196  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.346872  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  30.57 
 
 		 454 aa  196  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.9 
 
 		 391 aa  195  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1030  aminotransferase class-III  31.83 
 
 		 431 aa  195  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5339  aminotransferase class-III  34.13 
 
 		 437 aa  195  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  32.4 
 
 		 390 aa  194  5e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  31.92 
 
 		 436 aa  194  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  33.17 
 
 		 431 aa  194  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  32.54 
 
 		 452 aa  194  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  30.7 
 
 		 454 aa  194  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  31.99 
 
 		 430 aa  193  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1896  aminotransferase class-III  32.39 
 
 		 432 aa  193  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311328 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  31.19 
 
 		 448 aa  193  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  31.88 
 
 		 445 aa  193  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  33.72 
 
 		 441 aa  192  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  29.81 
 
 		 454 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  31.6 
 
 		 444 aa  192  2.9999999999999997e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  30.88 
 
 		 474 aa  190  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  34.24 
 
 		 418 aa  187  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>