50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0983 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0983  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 345 aa  675    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.904238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0311  putative aminotransferase protein  81.17 
 
 		 371 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.452775  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1956  aminoglycoside phosphotransferase  80.86 
 
 		 345 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.92621  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  42.01 
 
 		 1015 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  42.01 
 
 		 1015 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2225  aminoglycoside phosphotransferase  38.35 
 
 		 374 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2539  aminoglycoside phosphotransferase  37.54 
 
 		 373 aa  226  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0686705  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  41.72 
 
 		 1015 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5425  aminoglycoside phosphotransferase  42.06 
 
 		 362 aa  222  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628583  normal  0.0994203 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1273  aminoglycoside phosphotransferase  40.62 
 
 		 349 aa  222  9e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.98058  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5226  aminoglycoside phosphotransferase  43.04 
 
 		 351 aa  222  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0415  aminoglycoside phosphotransferase  39.71 
 
 		 360 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  38.94 
 
 		 1016 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  39.6 
 
 		 1023 aa  206  5e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3215  aminoglycoside phosphotransferase  40.18 
 
 		 355 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  39.02 
 
 		 1049 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  39.94 
 
 		 1018 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5904  aminoglycoside phosphotransferase  35.42 
 
 		 364 aa  159  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  36.59 
 
 		 978 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  31.73 
 
 		 970 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  31.76 
 
 		 970 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  31.55 
 
 		 976 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  31.29 
 
 		 1003 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  31.53 
 
 		 994 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  34.27 
 
 		 973 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  32.45 
 
 		 975 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  31.16 
 
 		 970 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  32.4 
 
 		 973 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  33.33 
 
 		 966 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  33.44 
 
 		 974 aa  112  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  31.07 
 
 		 976 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  32.7 
 
 		 981 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  32.7 
 
 		 981 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  32.9 
 
 		 981 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  29.31 
 
 		 967 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  29.59 
 
 		 910 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  28.85 
 
 		 977 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47420  predicted protein  27.21 
 
 		 514 aa  72.4  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27007  predicted protein  28.29 
 
 		 524 aa  68.6  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000261622  normal  0.260585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6026  homoserine kinase  30.28 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.139905  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1086  homoserine kinase  33.88 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7259  homoserine kinase  29.76 
 
 		 321 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220234  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0590  homoserine kinase  26.8 
 
 		 326 aa  46.6  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.954317  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0749  homoserine kinase  27.38 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4750  homoserine kinase  26.59 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0685  homoserine kinase  26.88 
 
 		 321 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28844  predicted protein  28.04 
 
 		 249 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2361  phosphotransferase enzyme family protein, putative  40 
 
 		 322 aa  43.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.699195  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0824  homoserine kinase  25.71 
 
 		 321 aa  43.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782493 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1793  aminoglycoside phosphotransferase  25.54 
 
 		 336 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>